总结
组织
大脑
单细胞
组织细胞
病理学
疾病
免疫
血液
子单元格
细胞系
结构
相互作用
使用来自HGNC公司和合奏以及人类蛋白质图谱项目的预测。
官方基因符号,通常是基因名称的缩写,根据HGNC公司.
完整基因名称依据HGNC公司.
基于信号肽和跨膜区域的预测方法,对所有基因的所有转录物进行了相应蛋白质的位置分析。
注释位置推翻了预测位置,因此编码已注释为细胞内的预测分泌蛋白的基因将以细胞内为最终位置。
RNA数据用于根据基因在免疫细胞中的表达来聚类基因。簇包含具有相似表达模式的基因,每个簇都被手动注释以描述功能和特异性方面的共同特征。
RNA特异性类别基于分析样本中基于数据的mRNA表达水平高性能放大器这些类别包括:细胞类型富集、组富集、细胞类型增强、低细胞类型特异性和未检测到。
Tau特异性评分是跨细胞或组织的基因表达特异性的数字指标。该值的范围为0和1,其中0表示所有细胞/组织类型的表达相同,而1表示单个细胞/组织的表达。
RNA分布类别基于分析样本中基于数据的mRNA表达水平高性能放大器。类别包括:全部检测到、多个检测到、部分检测到、单个检测到和未检测到。
RNA特异性类别基于分析样本中基于数据的mRNA表达水平高性能放大器这些类别包括:谱系丰富、群体丰富、谱系增强、低谱系特异性和未检测到。谱系包括B细胞、T细胞、NK细胞、单核细胞、粒细胞和树突状细胞。
RNA数据用于根据基因在单个细胞类型中的表达进行聚类。簇包含具有相似表达模式的基因,每个簇都被手动注释以描述功能和特异性方面的共同特征。
血细胞类型表达概述显示了来自三个不同来源的RNA-seq数据:内部生成的人类蛋白图谱(高性能放大器)数据,以及由(摩纳哥等)和(Schmiedel等人). 颜色编码基于血细胞类型谱系,包括B细胞、T细胞、NK细胞、单核细胞、粒细胞和树突状细胞以及总PBMC。要访问样本数据,请单击组织名称或栏。
生成的转录表达值计算为nTPM,由内部标准化管道检测18种免疫细胞和总外周血单个核细胞(PBMC)。
由内部标准化管道显示29种血细胞类型和总外周血单个核细胞(PBMC)摩纳哥等.
显示了来自Schmiedel等人。数据集。
RNA数据用于根据基因在样本中的表达进行聚类。生成的簇被手动注释,以描述功能和特异性方面的共同特征。簇的注释与基因分配到簇的置信度一起显示。置信度计算为基因在重复计算中分配给该簇的次数的分数,并在0到1之间报告,其中1是可能的最高置信度。聚类结果显示在UMAP中,其中该基因被分配到的簇被突出显示为大多数簇基因所在的有色区域。表中显示了15个在表达谱方面最相似的基因。
置信度是指基因在重复聚类中被分配到聚类的次数,因此反映了它与聚类的相关性有多强。置信度为1表示该基因在所有重复聚类中被分配到该聚类。
基因名称依据HGNC公司.
基因描述依据HGNC公司.
所选基因与相邻基因之间的相关性。相关性是根据RNA-seq表达数据在PCA空间中计算为Spearman相关性。
相邻基因表达簇的ID。