总结
组织
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子单元格
细胞系
结构
相互作用
使用来自HGNC公司和合奏以及人类蛋白质图谱项目的预测。
官方基因符号,通常是基因名称的缩写,根据HGNC公司.
完整基因名称依据HGNC公司.
为编码蛋白指定HPA蛋白类别。
基于信号肽和跨膜区预测方法,对所有基因的所有转录物进行了相应蛋白质的位置分析。
注释的位置否决了预测的位置,因此编码已注释为细胞内的预测分泌蛋白的基因将以细胞内为最终位置。
来自基因的蛋白质编码转录物的数量,定义如下合奏。
报告中的数据摘要组织部分,具有代表性的蛋白质表达图像(左)和显示组织特异性mRNA表达的交互式图表(右)。图像和图表是可点击的,并将重定向到更多的组织数据。本节包含关于正常人体组织中蛋白质编码基因在mRNA和蛋白质水平上的表达谱的信息。蛋白质表达数据来自使用免疫组织化学的基于抗体的蛋白质分析。
RNA数据用于根据基因在组织中的表达对基因进行聚类。簇包含具有相似表达模式的基因,每个簇都被手动注释以描述功能和特异性方面的共同特征。
RNA特异性类别基于共识根据样本中的RNA表达水平计算的数据集高性能放大器和GTEX公司. The类别包括:组织富集、组富集、组织增强、组织特异性低和未检测。
Tau特异性评分是跨细胞或组织的基因表达特异性的数字指标。该值的范围为0和1,其中0表示所有细胞/组织类型的表达相同,而1表示单个细胞/组织的表达。
RNA分布类别基于分析样本中的mRNA表达水平,基于来自高性能放大器和GTEX公司。类别包括:全部检测、多个检测、部分检测、单个检测和未检测。
基于UniProt蛋白存在性的基因证据评分(UniProt证据);neXtProt蛋白存在(neXtProt证据);以及基于人类蛋白图谱抗体或RNA的评分(HPA证据)。可用分数为蛋白质水平的证据、转录水平的证据,无证据或不可用。
基于人类蛋白质图谱亚细胞部分生成的数据的主要亚细胞位置。
所有具有至少一个预测分泌亚型的基因都已注释并分类,目的是确定相应的蛋白质是否:
在交互摘要中,显示了基因交互伙伴的网络图,节点表示基因,边表示交互类型和置信度(MI得分)用于交互。交互类型(直接交互或物理关联)由边的颜色反映,而交互的可信度则由边的厚度反映。分数大于0.6(高置信度)的分数线比0.45到0.6(中等置信度)之间的分数线更粗。
图顶部的高亮条可用于根据亚细胞位置(基于亚细胞部分中的数据)、预测位置(基于信号肽和跨膜区域预测)、组织特异性(基于RNA组织表达谱)或蛋白质类别为节点着色。
还可以使用左上角的“过滤器”选项高亮显示节点,在该选项中,可以构建一个选择查询,例如标记人类和小鼠大脑中组织丰富的所有节点,或属于特定组织表达簇的所有节点。该基因的表达簇在网络图上方的“人类蛋白质图谱信息”框中说明。单击图左上角的Filter以查找查询生成器和一些示例查询。
在本总结中,基因所属的途径/子系统与基于代谢物信息的反应的相关细胞室一起显示。显示了途径中蛋白质和代谢物的数量以及所选基因的反应数量。单击汇总表中的一条通路,即可显示相关的代谢网络图,以及显示该通路中基因在不同组织中表达的基因-组织热图。