NIAID支持的研究人员对鼠疫耶尔森菌这与包括黑死病在内的第二次瘟疫大流行有关。这将为科学家确定这种致命病原体的疫苗、药物和诊断的新靶点提供宝贵的研究资源。 目前的研究项目包括识别鼠疫耶氏菌感染跳蚤消化道并研究细菌是如何传播给人类的。NIAID也在研究鼠疫耶氏菌让细菌在人体内生长，并了解它们在人体肺部的功能。
