巴西一例小头病例分离出的Fortaleza-strain Zika病毒（红色）的阴性染色透射电镜图像
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NIAID公司
NIAID正与政府、学术界、制药和生物技术行业的合作伙伴合作，以更好地了解寨卡病毒、寨卡病毒引起的疾病以及对抗寨卡病毒的方法。具体而言，NIAID正在加快疾病自然史、寨卡毒基础研究、，它是如何引起疾病的（称为发病机制），诊断以快速确定某人是否感染了寨卡病毒并与其他黄病毒区分，以及治疗和疫苗。
尽管寨卡病毒在西半球是新出现的，但NIAID的科学家和受赠者长期以来一直在研究寨卡病毒的亲属，如登革热病毒和西尼罗河病毒。这些研究为加快寨卡病毒的研究提供了一个跳板，并可能为开发对抗寨卡病毒治疗药物和疫苗提供良好途径。
2016年1月22日，NIAID向研究界发出呼吁，强调其对资助寨卡病毒研究的兴趣，包括
- 开发敏感、特异和快速的寨卡病毒临床诊断试验
- 创造对寨卡病毒和广谱抗病毒药物有效的治疗方法，以对抗多种黄病毒
- 开发和测试疫苗以防止寨卡病毒感染，并推进新的疫苗接种战略
- 进行基础研究，以了解寨卡病毒的感染、复制、发病机制和传播，以及蚊子媒介的生物学
- 开发模拟人类寨卡病毒感染的动物模型，以便研究人员能够研究疾病的进展
- 继续研究寨卡病毒的进化和出现，包括识别影响宿主范围和毒力的因素
- 对寨卡病毒的分布和自然历史进行监测研究
- 评估同一地理区域可能出现的寨卡病毒和其他黄病毒（尤其是登革热病毒和黄热病病毒）的相对免疫反应
2016年2月5日，国家卫生研究院向研究团体发布了一份通知，寻求资助旨在调查寨卡病毒感染如何影响生殖、妊娠和胎儿发育的研究。此外，2017年1月17日，NIH发布了一份资助公告，为寨卡病毒及其并发症的研究提供支持。
