如何提交到dbSNP:
六、 设置提交数据的格式
VCF提交格式
为与提交关联的发布、方法、填充和分析信息创建所需的元数据(即元文件)。 a。 每个图元文件的规范可在 图元文件规范部分 的 格式化元数据(Meta)文件文档 . b。 您可以单独提交这些图元文件,也可以将其合并为单个文本文件进行提交。 使用中的详细说明为您的数据创建VCF提交文件 dbSNP VCF提交格式指南 ,或者如果您提交了少量数据或打算手动输入数据,请使用 VCF Excel模板 以格式化您的提交。 您的VCF提交文件应包括: a。 格式正确的dbSNP VCF文件头 b。 包含所提交变体所需INFO标记的数据表 c。 可选的INFO标记,更全面地描述您的数据。 使用 dbSNP VCF在线验证器 .
Excel平面文件提交模板
数据提交选项
提交无基因型和频率数据的变异
提交dbSNP现有变异的基因型或等位基因频率数据
VCF:使用dbSNP的VCF提交模板提交现有变异的基因型数据。 遵循1000基因组计划在其描述中提供的基因型提交示例 VCF版本4.1 .
重要事项: 从2017年11月1日开始,dbSNP将不再接受SNPPOPUSE格式的现有变体的基因型频率和等位基因频率信息,该格式位于“ 模板_SNPsub.xls “,在 提交文件 的 /specs子目录 dbSNP FTP站点的。
联系dbSNP
将提交内容和提交问题发送至: snp-sub@ncbi.nlm.nih.gov 将提交更新发送到: snp-update@ncbi.nlm.nih.gov 将一般查询等发送至: snp-admin@ncbi.nlm.nih.gov