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.2023年1月6日；51（D1）：D384-D388。
doi:10.1093/nar/gkac1096。

2023年保存的域数据库

王继尧 1, 法里德·奇萨兹 1, 迈拉·K·德比郡 1, 诺琳·R·冈萨雷斯 1, 马克·瓜兹 1, 深南路 1, 加布里埃尔·H·马切勒 1, 詹姆斯·S·宋 1, 纳马达·塔基 1, Roxanne A Yamashita公司 1, 杨明章 1, 张大川 1, 郑昌娟 1, 克里斯托弗·兰茨基 1, 阿伦·马什勒·鲍尔 1
附属公司

2023年保存的域数据库

王继尧等。 核酸研究. .

摘要

NLM的保守域数据库（CDD）是一个蛋白质域和蛋白质家族模型的集合，构建为多序列比对。其主要目的是通过域足迹和相关功能位点的位置为蛋白质和翻译核苷酸序列提供注释，并将蛋白质域结构定义为指定基因产品名称和假定/预测功能的基础。CDD已公开发行20多年，并在这段时间内大幅增长。维护预计算注释的存档仍然是一项挑战，并减缓了CDD发布的节奏。CDD管理人员建立了大型蛋白质结构域家族的层次分类，通过监测目前缺乏注释的蛋白质“暗物质”，为新的结构域家族添加了模型，现在花费了大量精力为保守结构域提供名称和属性。客户尽职调查可访问https://www.ncbi.nlm.nih.gov/Structure/cdd/cdd.shtml。

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数字

图1。
图1。
格式化为几个查询序列的BATCH CD搜索结果显示了域架构信息（在“蛋白质分类”标题下）的可用性，以及分配给每个架构的可转移属性，位于与一些域模型相关的域足迹注释和功能站点之上。蛋白质分类信息和位点注释可以关闭，以实现只关注域足迹的稀疏显示。
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