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.2014年3月;13(3):907-17。
doi:10.1074/mcp。M113.036095。 Epub 2014年1月17日。

生物学和医学中的靶向肽测量:使用适合目的的方法开发基于质谱的分析的最佳实践

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生物学和医学中的靶向肽测量:使用适合目的的方法开发基于质谱的分析的最佳实践

史蒂文·卡尔等。 分子细胞蛋白质组学. 2014年3月.

摘要

蛋白质组学界正在采用靶向质谱(MS)方法,如多反应监测(MRM)来研究生物和生物医学问题。成功应用取决于能否生成可靠的分析方法,唯一且自信地识别样本中的目标肽。不幸的是,有一个广泛的标准正在应用,以表明一种分析已经成功开发。对于什么标准是可以接受的,没有达成共识,也很少了解可变标准对所产生结果质量的影响。描述肽靶向MS分析的出版物通常不包含足够的信息,读者无法确定测试是否按预期工作或是否能够应用自己实验室中描述的测试。必须制定指南,以便世界各地的许多实验室能够广泛分发和应用具有既定性能的目标MS分析。为了开始解决这些问题及其解决方案,美国国立卫生研究院举办了一次研讨会,来自多个社区的代表开发并使用了针对性MS分析。参与者讨论了他们的实验的分析目标和所需的实验证据,以确定他们开发的分析按预期工作并达到所需的性能水平。使用这种“适合目的”的方法,该小组定义了三个层次的分析,以其性能和分析表征的范围来区分。描述了用于分析靶向MS结果的计算和统计工具。参与者还详细说明了作者需要在其手稿中提供的信息,以使审稿人和读者能够清楚地了解所执行的程序,并评估所报告的肽或蛋白质定量测量的可靠性。本文对会议进行了总结并提出了建议。

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