PubTator: a web-based text mining tool for assisting biocuration

doi:10.1093/nar/gkt441

.2013年7月；41（Web服务器问题）：W518-22。

doi:10.1093/nar/gkt441。 Epub 2013年5月22日。

PubTator：一种基于web的文本挖掘工具，用于帮助生物化

志宣伟¹, 洪玉高, 卢志勇

附属机构

PMID： 23703206
预防性维修识别码： PMC3692066
内政部： 10.1093/nar/gkt441

PubTator：一种基于web的文本挖掘工具，用于帮助生物化

志宣伟等。核酸研究. 2013年7月.

.2013年7月；41（Web服务器问题）：W518-22。

doi:10.1093/nar/gkt441。 Epub 2013年5月22日。

作者

志宣伟¹, 洪玉高, 卢志勇

附属

¹美国国家医学图书馆国家生物技术信息中心，8600 Rockville Pike，Bethesda，MD 20894，USA。

PMID： 23703206
预防性维修识别码： PMC3692066
内政部： 10.1093/nar/gkt441

摘要

手动将生物医学文献中的知识整理到结构化数据库中既昂贵又耗时，很难跟上文献的快速增长。因此，迫切需要使用自动文本挖掘工具来帮助生物化。在这里，我们描述了PubTator，一个基于网络的系统，用于协助生物化。PubTator不同于现有的少数几个工具，它具有PubMed般的界面，这是许多生物化学家所熟悉的，并且配备了多个具有挑战性的文本挖掘算法，以确保其自动结果的质量。通过与两个外部用户组的正式评估，PubTator被证明能够提高手动管理的效率和准确性。PubTator可在以下网址公开获取：http://www.ncbi.nlm.nih.gov/CBBresearch/Lu/Demo/PubTator/。

PubMed免责声明

数字

**图2。**
PubTator搜索结果页面。自动计算的实体以颜色高亮显示。与PubMed不同，文章摘要可以在此处显示，而无需转到其他页面。

**图3。**
PubTator注释页。页面顶部的两个单选按钮（可编辑/不可编辑）用于文档分类。文本框和下表用于实体注释。页面底部的关系表用于关系注释。在提及视图中，每一行对应一个实体提及。在概念视图（默认）中，相同概念的不同引用（即具有相同标识符）被合并并显示在同一行中。

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