Genome-wide association study in Chinese men identifies two new prostate cancer risk loci at 9q31.2 and 19q13.4

doi:10.1038/ng.2424

.2012年11月；44(11):1231-5.

doi:10.1038/ng.2424。 Epub 2012年9月30日。

中国男性的全基因组关联研究在9q31.2和19q13.4确定了两个新的前列腺癌风险位点

徐建峰¹, 曾南莫, 丁伟业, 王美林, 刘芳, 金广福, 徐传良, 王翔（音）, 羌绍, 陈志文, 陶志华, Jun Qi先生, 周方建, 钟旺, 傅耀文, 何大林, 强伟（Qiang Wei）, 郭建明, 吴登龙, 新高, 袁建林, 王功仙, 徐勇（音）, 王国增, 姚海军, 裴东, 杨娇, 莫申, 金阳, 欧阳君, 姜浩文, 姚竹, 山城人, 张正东, 尹长军, 徐高, 博代, 胡志斌, 杨亚军, 吴启军（Qijun Wu）, 陈红艳, 彭鹏, 应征, 郑晓东, 永冰巷, 吉荣龙, 建工, 荣娜, 林晓玲, 余洪杰, 钟旺, 沙涛, 冯俊杰, 孙继山, 刘文南, 安兴, 剑鱼饶, Qiang Ding（强丁）, 弗雷德里克·威克伦德, 亨利克·格隆伯格, 肖欧舒, 魏征, 沈宏兵, 李进, 荣石, 达鲁鲁语, 张学军, 孙杰林, S礼来·郑, 孙英豪

附属公司

PMID： 23023329
预防性维修识别码：项目经理4116636
内政部： 10.1038/纳克.2424

中国男性的全基因组关联研究在9q31.2和19q13.4确定了两个新的前列腺癌风险位点

徐建峰等。自然基因. 2012年11月.

.2012年11月；44(11):1231-5.

doi:10.1038/ng.2424。 Epub 2012年9月30日。

作者

徐建峰¹, 曾南莫, 丁伟业, 王美林, 刘芳, 金广福, 徐传良, 王翔（音）, 羌绍, 陈志文, 陶志华, Jun Qi先生, 周方建, 钟旺, 傅耀文, 何大林, 强伟（Qiang Wei）, 郭建明, 吴登龙, 新高, 袁建林, 王功仙, 徐勇（音）, 王国增, 姚海军, 裴东, 杨娇, 莫申, 金阳, 欧阳君, 姜浩文, 姚朱, 山城人, 张正东, 尹昌军, 徐高, 博代, 胡志斌, 杨亚军, 吴启军（Qijun Wu）, 陈红艳, 彭鹏, 应征, 郑晓东, 永冰巷, 吉荣龙, 建工, 荣娜, 林晓玲, 余洪杰, 钟旺, 沙涛, 冯俊杰, 孙继山, 刘文南, 安兴, 剑鱼饶, Qiang Ding（强丁）, 弗雷德里克·威克伦德, 亨利克·格隆伯格, 小欧书, 魏征, 沈宏兵, 李进, 荣石, 达鲁·鲁, 张学军, 孙洁琳, S礼来·郑, 孙英浩

附属

¹复旦大学华山医院复旦泌尿研究所，中国上海。

PMID： 23023329
预防性维修识别码：项目经理4116636
内政部： 10.1038/ng.2424

摘要

使用全基因组关联研究（GWAS）在欧洲后裔、非洲裔美国人和日本人中报告了前列腺癌风险相关变异。为了系统研究中国男性前列腺癌风险相关变异，我们在汉族人群中进行了首次GWAS。除了证实其他祖先组报告的一些相关性外，本研究在4484例前列腺癌患者和8934例对照组的染色体9q31.2（rs817826，P=5.45×10（-14））和19q13.4（rs103294，P=5.3×10（-16））上确定了前列腺癌的两个新的风险相关位点。19q13.4处的rs103294标记与6.7-kb生殖系缺失处于强连锁平衡，该缺失删除了LILRA3（一种调节炎症反应的基因）中七个外显子的前六个，并且与T细胞中LILRA3mRNA的表达显著相关（P<1×10（-4））。这些发现可能会促进对前列腺癌遗传易感性的理解。

PubMed免责声明

数字

图1
区域关联图。(**a、 b条**)9q31.2的区域图（顶部）和LD图（底部）(一)和19q13.4(b条). 对于区域图，单个SNP的关联绘制为–log₁₀*P（P）*与染色体位置相反。显示了基因型SNP和插补SNP的结果。符号颜色代表SNP的LD，在每个位点具有最显著的SNP（紫色菱形）。右边年axis显示了根据1000基因组计划CHB和JPT数据估计的重组率。LD图基于D类‘使用1000基因组项目中CHB和JPT基因型的值（第1阶段综合数据版本3，2012年3月发布）。

图2
种系删除时间*LILRA3系列*以及基因两侧的基因型SNP。顶部，示意图*LILRA3系列*在19q13.4处与前列腺癌风险相关的SNP rs103294的强LD中的缺失。底部，成对LD(第页²)根据GWAS阶段样本的数据计算得出的值。

请参阅PMC中的此图像和版权信息

类似文章

9q31.2新的乳腺癌易感性位点：全基因组关联研究结果。
Fletcher O、Johnson N、Orr N、Hosking FJ、Gibson LJ、Walker K、Zelenika D、Gut I、Heath S、Palles C、Coupland B、Broderick P、Schoemaker M、Jones M、Williamson J、Chilcott Burns S、Tomczyk K、Simpson G、Jacobs KB、Chanock SJ、Hunter DJ、Tomlinson IP、Swerdlow A、Ashworth A、Ross G、dos Santos Silva I、Lathrop M、Houlston RS、Peto J。 Fletcher O等人。美国国家癌症研究所杂志2011年3月2日；103(5):425-35. doi:10.1093/jnci/djq563。Epub 2011年1月24日。 2011年国家癌症研究所杂志。 PMID：21263130
中国人群前列腺癌遗传易感性的遗传学研究和荟萃分析。
Marzec J、Mao X、Li M、Wang M、Feng N、Gou X、Wang G、Sun Z、Xu J、Xu H、Zhang X、Zhao SC、Ren G、Yu Y、Wu Y、Wou J、Schue Y、Zhou B、Zhang-Y、Xu X、Le J、He W、Benlloch S、Ross-Adams H、Chen L、Li J、Hong Y、Kote-Jarai Z、Cui X、Hou J、Guo J、Xu L、Yin C、Zhouo Y、Neal DE、Oliver T、Cao G、ZhangZ、Easton DF、Chelala C；实用财团；CHIPGECS集团；Al Olama AA、Eeles RA、Zhang H、Lu YJ。 Marzec J等人。 Oncotarget公司。2016年4月19日；7(16):21393-403. doi:10.18632/目标7250。 Oncotarget公司。2016. PMID：26881390 免费PMC文章。
在两项韩国人群队列研究中，1q32.1、10q11.2和19q13.41的遗传变异与前列腺癌筛查前列腺特异性抗原相关。
Kim S、Shin C、Jee SH。 Kim S等人。基因。2015年2月10日；556(2):199-205. doi:10.1016/j.gene.2014.11.059。Epub 2014年11月27日。基因。2015 PMID：25434496
对最初从全基因组关联研究中确定的高危男性前列腺癌易感性遗传变异的复制研究进行的系统综述。
Ishak MB，Giri VN。 Ishak MB等人。癌症流行生物标志物预防。2011年8月；20(8):1599-610. doi:10.1158/1055-9965.EPI-11-0312。Epub 2011年6月29日。癌症流行生物标志物预防。2011. PMID：21715604 审查。
前列腺癌遗传易感性的最新进展：前景和展望。
Ellatif MA、Gamal BE、Musaam AO、Malik A、Tarique M。 Ellatif MA等人。细胞分子生物学（Noisy-le-grand）。2023年2月28日；69(2):1-7. doi:10.14715/cmb/2023.69.2.1。细胞分子生物学（Noisy-le-grand）。2023 PMID：37224054 审查。

查看所有类似文章

引用人

杂交基因的鉴定LILRB5-3号机组通过长读测序及其新型信号功能的暗示。
Hirayasu K、Khor SS、Kawai Y、Shimada M、Omae Y、Hasegawa G、Hashikawa Y、Tanimoto H、Ohashi J、Hosomichi K、Tajima A、Nakamura H、Nakamora M、Tokunaga K、Hanayama R、Nagasaki M。 Hirayasu K等人。前免疫。2024年5月14日；15:1398935. doi:10.3389/fimmu.2024.1398935。eCollection 2024年。前免疫。2024 PMID：38807600 免费PMC文章。
健康和疾病中的人类白细胞免疫球蛋白样受体。
Redondo-García S、Barritt C、Papagregoriou C、Yeboah M、Frendeus B、Cragg MS、Roghanian a。 Redondo-García S等人。前免疫。2023年11月13日；14:1282874. doi:10.3389/fimmu.2023.1282874。eCollection 2023年。前免疫。2023 PMID：38022598 免费PMC文章。审查。
欧洲人和东亚人前列腺癌可改变行为的因果关系：一项孟德尔综合随机研究。
詹毅、阮X、王P、黄D、黄J、黄J，Chun TTS、Ho BS、Ng AT、Tsu JH、Na R。詹毅等。生物学（巴塞尔）。2023年4月29日；12(5):673. doi:10.3390/biology12050673。生物学（巴塞尔）。2023 PMID：37237487 免费PMC文章。
利用基因组变异预测复杂疾病风险的深度学习框架。
Alzoubi H、Alzubi R、Ramzan N。 Alzoubi H等人。传感器（巴塞尔）。2023年5月1日；23(9):4439. doi:10.3390/s23094439。传感器（巴塞尔）。2023 PMID：37177642 免费PMC文章。
端粒酶逆转录酶基因的遗传多态性与前列腺肿瘤发生、侵袭性和死亡率的关系：一项跨年代分析。
詹毅、阮X、刘J、黄D、黄J、黄J、Chun TTS、Ng AT、Wu Y、Wei G、蒋H、徐D、Na R。詹毅等。癌症（巴塞尔）。2023年5月8日；15(9):2650. doi:10.3390/cancers15092650。癌症（巴塞尔）。2023 PMID：37174115 免费PMC文章。

查看所有“被引用”文章

工具书类

1. Jemal A等人，《全球癌症统计》。加州癌症杂志临床。2011;61:69–90.-公共医学
1. Amundadottir LT等。欧洲和非洲人群中与前列腺癌相关的常见变异。自然遗传学。2006;38:652–658.-公共医学
1. Gudmundsson J等人。全基因组关联研究确定了第二种前列腺癌易感性变异在8q24。自然遗传学。2007;39:631–637.-公共医学
1. Gudmundsson J等人。17号染色体上的两个变体具有前列腺癌风险，TCF2中的一个变体可预防2型糖尿病。自然遗传学。2007;39:977–983.-公共医学
1. Yeager M等人。前列腺癌的全基因组关联研究在8q24确定了第二个风险位点。自然遗传学。2007;39:645–649.-公共医学

出版物类型

行动

MeSH术语

行动
行动
行动
行动
行动
行动
行动
行动
行动
行动
行动
行动
行动
行动
行动
行动

赠款和资金

R01 CA129684/CA/NCI NIH HHS/美国

LinkOut-更多资源

[1] Jemal A等人，《全球癌症统计》。加州癌症杂志临床。2011;61:69–90.-公共医学

[2] Jemal A等人，《全球癌症统计》。加州癌症杂志临床。2011;61:69–90.-公共医学

[3] Amundadottir LT等。欧洲和非洲人群中与前列腺癌相关的常见变异。自然遗传学。2006;38:652–658.-公共医学

[4] Amundadottir LT等。欧洲和非洲人群中与前列腺癌相关的常见变异。自然遗传学。2006;38:652–658.-公共医学

[5] Gudmundsson J等人。全基因组关联研究确定了第二种前列腺癌易感性变异在8q24。自然遗传学。2007;39:631–637.-公共医学

[6] Gudmundsson J等人。全基因组关联研究确定了第二种前列腺癌易感性变异在8q24。自然遗传学。2007;39:631–637.-公共医学

[7] Gudmundsson J等人。17号染色体上的两个变体具有前列腺癌风险，TCF2中的一个变体可预防2型糖尿病。自然遗传学。2007;39:977–983.-公共医学

[8] Gudmundsson J等人。17号染色体上的两个变体具有前列腺癌风险，TCF2中的一个变体可预防2型糖尿病。自然遗传学。2007;39:977–983.-公共医学

[9] Yeager M等人。前列腺癌的全基因组关联研究在8q24确定了第二个风险位点。自然遗传学。2007;39:645–649.-公共医学

[10] Yeager M等人。前列腺癌的全基因组关联研究在8q24确定了第二个风险位点。自然遗传学。2007;39:645–649.-公共医学

将引文保存到文件

电子邮件引文

添加到集合

添加到我的书目

您保存的搜索

为外部引文管理软件创建文件

您的RSS源

中国男性的全基因组关联研究在9q31.2和19q13.4确定了两个新的前列腺癌风险位点

附属

中国男性的全基因组关联研究在9q31.2和19q13.4确定了两个新的前列腺癌风险位点

作者

附属

摘要

数字

类似文章

引用人

工具书类

出版物类型

MeSH术语

物质

赠款和资金

LinkOut-更多资源

全文源

医疗

其他

摘要

数字

类似文章

引用人

工具书类

出版物类型

MeSH术语

物质

相关信息

赠款和资金

LinkOut-更多资源

全文源

医疗

其他