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.2013年4月;23(2):72-9.
doi:10.1016/j.semcancer.2012.06.009。 Epub 2012年7月4日。

SATB1在肿瘤进展中的基因组组织功能

附属公司
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SATB1在肿瘤进展中的基因组组织功能

Terumi Kohwi-Shigematsu公司等。 Semin癌症生物学. 2013年4月.

摘要

当细胞改变功能或活动时(例如在分化、对细胞外刺激的反应或迁移期间),基因表达会以细胞类型和功能特定的方式进行大规模的重新编程。基因调控的巨大变化需要改变染色质结构,这涉及到染色质重塑酶和表观基因组修饰酶对特定基因组位点的补充。转录因子也必须在这些位点上准确组装。SATB1是一种促进这些过程的基因组组织蛋白,通过与特定基因组序列的相互作用,提供了一个锚定数百个基因的核结构平台;这种活性允许所有这些基因的表达被平行调节,从而使细胞改变其功能。我们回顾并描述了SATB1在高阶染色质结构和基因调控中的功能,以及它在乳腺癌和其他肿瘤类型转移中的作用的未来前景。

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图1
图1。SATB1为大规模基因调控提供了一个核结构。该方案表明,SATB1靶基因(而非非靶基因)通过每个位点的BUR序列锚定到SATB1“笼状”结构。锚定基因位点将与染色质重塑和修饰酶以及转录因子组装
A) 显示了乳腺癌细胞中SATB1表达上调(红色)和下调(蓝色)的基因的代表性列表。下划线基因经BUR证实与SATB1直接结合。B) 对生长在三维基质上的MDA-MB-231细胞进行SATB1(绿色)和DAPI(蓝色)免疫染色,显示SATB1网络的“笼状”核分布。C)SATB1(浅蓝色)与特定靶基因(上调基因:橙色和绿色;下调基因:深蓝色;盒子代表外显子)以创建染色质环,使远端位点更接近。染色质的这种错综复杂的组织结构,加上组蛋白乙酰化酶p300在激活基因位点上的SATB1募集或组蛋白去乙酰化酶HDAC1在抑制基因位点上募集,导致了许多基因的平行调控。一些表达SATB1依赖性(灰色)的基因即使含有BUR,也与SATB1无关。
图2
图2
SATB1靶向基因在乳腺癌和表皮之间的有限重叠表明,SATB1根据细胞类型调节不同的基因组。使用乳腺癌(A,红色)和表皮(B,绿色)中已发表的基因表达谱来确定SATB1依赖基因,然后根据基本GO功能组对其进行分组。显示了每种单元格类型的最上面代表的组。请注意,GO组中每个细胞类型都有高度代表性,并且每个GO组在乳腺癌和表皮之间缺少共同的SATB1依赖基因。

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