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元分析
.2012年4月1日;5(2):217-25.
doi:10.1161/CIRCGENETICS.111.961243。 Epub 2012年2月7日。

冠状动脉疾病的全基因组关联研究确定了主要组织相容性复合体中的一个新的易感性位点

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元分析

冠状动脉疾病的全基因组关联研究确定了主要组织相容性复合体中的一个新的易感性位点

罗伯特·戴维斯等。 循环心血管基因. .

摘要

背景:最近的全基因组关联研究(GWAS)发现了几个与冠状动脉疾病(CAD)和/或心肌梗死风险相关的新基因座。然而,已知的常见CAD风险变异体仅能解释疾病预测遗传力的10%,这表明重要的遗传信号仍有待发现。

方法和结果:我们对5个GWAS进行了一项发现荟萃分析,涉及13949名受试者(7123例,6826名对照受试者),其中约有500万个单核苷酸多态性,使用了1000个基于基因组的试点单倍型。在另外5项研究中,对11032名受试者(5211例,5821名对照受试者)的有希望的基因座进行了随访。在HCG27和HLA-C之间的主要组织相容性复合体(MHC)染色体6p21.3上发现了一个新的CAD位点,并在联合分析中获得了全基因组意义(rs3869109;p(发现)=3.3×10(-7),p(复制)=5.3×10(-4)p(联合)=1.12×10(-9))。结合发现GWAS的亚分析显示,当对欧洲人口结构进行严格修正时,显著性减弱(P=4.1×10(-10)vs.3.2×10(-7)),表明观测信号因人口分层而部分混淆。这个基因密集区在炎症、免疫和自我细胞识别中起着重要作用。为了确定潜在关联是否由MHC I类等位基因驱动,我们将常见HLA等位基因输入到发现受试者中;然而,没有一种常见的HLA类型能够显著或完全解释所观察到的相关性。

结论:我们在MHC中发现了一个与CAD相关的新基因座。MHC基因调节炎症和T细胞反应,对动脉粥样硬化的发生和传播起重要作用。需要进行进一步的实验室研究,以了解这种关联的生物学基础,并确定致病等位基因。

PubMed免责声明

利益冲突声明

利益冲突披露:葛兰素史克公司支持PennCath和MedStar的基因分型。没有其他需要报告的披露。

数字

图1
图1
rs3869109与CAD关联的森林地块
图2
图2
rs3869109和6p21.3的周围基因的曼哈顿图。使用LocusZoom生成的曼哈顿本地地块。所示为rs3869109和侧翼区域。rs3869109给出了最终的荟萃分析p值,而对于所有其他SNP,所示的p值来自发现分析。
图3
图3
rs3869109的种族效应。A) 一张带有国家颜色以反映收集到的种族信息的欧洲地图B)对整个发现队列中基因型SNP进行PCA的第一个主要成分,大致对应于北方和南方的地理背景,子集根据种族进行着色。水平轴变化是均匀正态随机分布,便于目视解释。第二个主要主成分和更多细节见图S2。C) 病例和对照组中rs3869109相对于第一主成分的预测频率。此图与面板C垂直对齐。
图4
图4
常见MHC I类等位基因与CAD的相关性。发现人群中常见(>2%频率)MHC I类等位基因与冠心病的关联未调整(左)和调整(右)rs3869109。

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引用人

工具书类

    1. Lloyd-Jones DM、Nam BH、D'Agostino RB、Sr、Levy D、Murabito JM、Wang TJ等。父母心血管疾病是中年人心血管疾病的危险因素:父母和子女的前瞻性研究。JAMA。2004;291:2204–11.-公共医学
    1. McPherson R、Pertsemlidis A、Kavaslar N、Stewart A、Roberts R、Cox DR等。9号染色体上与冠心病相关的常见等位基因。科学。2007;316:1488–1491.-项目管理委员会-公共医学
    1. Helgadottir A、Thorleifsson G、Manolescu A、Gretarsdottil S、Blondal T、Jonasdottir A等。染色体9p21上的常见变异影响心肌梗死风险。科学。2007;316:1491–1493.-公共医学
    1. Reilly MP,Li M,He J,Ferguson JF,Stylianou IM,Mehta NN,et al.确定ADAMTS7为冠状动脉粥样硬化的新基因座以及冠状动脉粥样硬化时ABO与心肌梗死的相关性:两项全基因组关联研究。柳叶刀。2011;377:383–392.-项目管理委员会-公共医学
    1. Samani NJ、Erdmann J、Hall AS、Hengstenberg C、Mangino M、Mayer B等。冠状动脉疾病的全基因组关联分析。《英国医学杂志》,2007年;357:443–453.-项目管理委员会-公共医学

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