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.2007年3月7日;5(5):741-58.
doi:10.1039/b615319b。 Epub 2007年1月26日。

超分子结构、聚集体和(生物)有机分子络合物的密度泛函理论及其色散修正

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超分子结构、聚集体和(生物)有机分子络合物的密度泛函理论及其色散修正

斯特凡·格里姆等。 有机生物化学. .

摘要

科恩-沙姆密度泛函理论(KS-DFT)是目前化学和物理中电子结构计算中应用最广泛的量子化学方法。其在超分子化学或生物化学等领域的进一步应用主要受到几乎所有电流密度泛函无法描述普遍存在的具有吸引力的长程范德华(色散)相互作用的阻碍。我们在这里回顾了克服这一缺陷的方法,并详细描述了基于阻尼-C(6)的非常成功的校正。R(-6)电位(DFT-D)。作为示例,我们考虑了不饱和有机分子(苯和染料中的所谓pi-pi堆积)、生物相关系统(核酸碱/对、蛋白质和“折叠”模型)、氟化分子之间、弯曲芳烃(珊瑚烯和碳纳米管)之间的非共价分子间和分子内相互作用以及用于将甲烷封装在水团簇中。在选定的情况下,我们将相互作用能量划分为来自交换排斥、静电和色散的最相关贡献,以提供对结合特性的定性认识。

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