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.2006年10月;26(20):7772-82.
doi:10.1128/MCB.00468-06。 Epub 2006年9月5日。

Klf4与Oct3/4和Sox2合作激活胚胎干细胞中的Lefty1核心启动子

附属公司

Klf4与Oct3/4和Sox2合作激活胚胎干细胞中的Lefty1核心启动子

中谷由纪夫等。 摩尔细胞生物学. 2006年10月.

摘要

尽管POU转录因子Oct3/4在维持胚胎干细胞的自我更新中起关键作用,但其分子机制尚不清楚。我们之前报道过Oct3/4的N末端反式激活域是激活Lefty1表达所必需的(H.Niwa、S.Masui、I.Chambers、A.G.Smith和J.Miyazaki,Mol.Cell.Biol.22:1526-15362002)。这里我们测试Lefty1是否是10月3/4日的直接目标。我们在Lefty1启动子上游发现了一个ES细胞特异性增强子,该增强子包含Oct3/4和Sox2的结合位点。然而,与其他已知的Oct3/4-Sox2-dependent增强子不同,该增强子元件在分化细胞中不能被Oct3/4和Sox2激活。通过对ES特异性转录因子的功能筛选,我们发现Krüppel样因子4(Klf4)与Oct3/4和Sox2协同激活Lefty1的表达,并且Klf4作为一种介导因子特异性结合Lefty1启动子的近端元件。DNA微阵列分析显示,一部分假定的Oct3/4靶基因可能以相同的方式进行调控。我们的发现揭示了Oct3/4在ES细胞中的一种新功能。

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数字

图1。
图1。
鉴定中的Oct3/4依赖性增强子左侧1基因。(A) 小鼠的隔离左侧1启动子。通过PCR亚克隆了一个1379 bp的基因组DNA片段,相对于转录起始位点从−1297到+82。第1章,第1染色体。(B) Oct3/4依赖的启动子活性pLefty1-luc(左侧1-luc)在ES细胞中。将报告质粒转染到ZHBTc4 ES细胞,然后进行有或无Tc的培养。显示了产生的荧光素酶活性的比率(−Tc/+Tc)。(C和D)Oct3/4依赖的缺失突变体活性pLefty1-luc(左侧1-luc)(E和F)含有假定的Oct-Sox结合位点的元素的增强活性。小缺失突变体(E)和pLefty1-luc(左侧1-luc)在ZHBTc4 ES细胞(F)中检测Oct或Sox元件(F)的突变。(G) Oct-Sox元素的EMSA。如图所示,野生型(wt)Oct-Sox元素与ES核提取物孵育,有或没有多余的冷竞争物(1到7道),或与Oct3/4、Sox2或Gata4抗体孵育(8到10道),并接受EMSA。探针的顺序如表1所示。请注意,每个抗体都获得了超移带(ss)和信号减少。
图2。
图2。
激活左侧1Oct3/4和Sox2启动子。(A) 的活动pLefty1-luc(左侧1-luc)在由突变型Oct3/4维持的ES细胞中。的相对表达水平充足的1-luc(填充)和Fgf4tkluc公司(阴影)如图所示。Fgf4tkluc公司有一个tk公司与Oct3/4和Sox2可以结合的增强子元件连接的最小启动子。表达野生型(wt)Oct3/4的ES细胞中的荧光素酶活性设置为1.0。(B) 10月3/4日和Sox2对HeLa细胞中报告子的相对激活。报告质粒与2004年10月3日和/或Sox2系统表达载体。仅报告者的荧光素酶活性设置为1.0。(C) 在10月3/4日前重新激活记者2004年10月3日-耗尽的ES细胞。报告质粒转染ZHBTc4 ES细胞,有或无2004年10月3日表达载体,并将细胞与Tc或不与Tc培养。与不含Tc和Tc的ES细胞相比,产生荧光素酶活性2004年10月3日表达式向量,如图所示。
图3。
图3。
激活左侧1Klf4记者。(A) 激活pLefty1-luc(左侧1-luc)通过各种ES-特异性转录因子,有(开放)或无(填充)10月3/4日Sox2系统HeLa细胞中的表达载体。荧光素酶活性的诱导是相对于空载体的诱导进行测量的。(B) Klf4在HeLa细胞中激活各种记者。报告质粒与空或Klf4公司将表达载体导入HeLa细胞,并测定其荧光素酶活性(相对于空载体)。(C) 激活p左1勒克通过Klf公司家庭成员。pLefty1-luc(左侧1-luc)与空或Klf公司对HeLa细胞的家族表达载体和荧光素酶活性(相对于空载体)进行了测定。
图4。
图4。
Oct3/4、Sox2和Klf4在激活左侧1记者。(A) 合作激活左侧110月3/4日,Sox2和Klf4报道。pLefty1-luc(左侧1-luc)与多种空,2004年10月3日,Sox2系统、和Klf4公司将表达载体导入HeLa细胞,并测量相对于空载体的荧光素酶活性。(B) 激活左侧110月3/4日发布的变体。pLefty1-luc(左侧1-luc)与Oct3/4变异体、Sox2和Klf4表达载体共转染到HeLa细胞中,并相对于空载体测定荧光素酶活性。(C) 激活左侧1Sox2变体的报告员。pLefty1-luc(左侧1-luc)与Sox2变异体、Oct3/4和Klf4表达载体共转染到HeLa细胞中,并测量荧光素酶活性相对于空载体的活性。(D和E)激活左侧1Klf4变体的记者。pLefty1-luc(左侧1-luc)与单独的Klf4变体(D)或Klf4变体加上Oct3/4和Sox2(E)的表达载体共转染到HeLa细胞中,并测量相对于空载体的荧光素酶活性。wt,野生型。
图5:。
图5:。
近端Klf4结合位点的鉴定左侧1核心启动子。(A) 围绕左侧1核心启动子pLefty1ΔSacI-luc在核心启动子附近发现了两个假定的Klf4结合位点(K1和K2),这两个位点在人类中都是保守的左YB也显示了K1m和K2m的突变序列。(B) 假定的Klf4结合位点对Klf4依赖活性的贡献pLefty1ΔSacI-luc。pLefty1ΔSacI-luc将K1和/或K2突变或两个位点都缺失的衍生物与Klf4或空表达载体共转染到HeLa细胞中,并测定相对于空载体的荧光素酶活性。(C) 用Klf4或空表达载体转染ES或Cos-7细胞的细胞裂解液进行EMSA,包括或不包括竞争对手。所有探头如表2所示。(D) ChIP分析左侧1远端增强子、近端元件和核心启动子。设计QPCR引物检测Oct3/4和Sox2结合的远端增强子(b区)、Klf4结合的近端元件和核心启动子(d区)及其侧翼区域(a、c和e)作为对照。来自未分化(ZHBTc4 Tc−)、分化(ZHBTc4 Tc+)和Δ用所示抗体免疫沉淀N ES细胞,然后用输入DNA归一化QPCR。在每组分析中,区域a的数量设置为1.0,并计算区域b、c、d和e的相对信号强度。
图6。
图6。
ES细胞中的Klf4靶基因。(A) 用siKlf4处理的ES细胞中干细胞标记基因的表达。通过QPCR评估用模拟转染剂(填充;设置为1.0)或siKlf4(孵化)处理的ES细胞中每个基因的相对表达水平。(B) 用siKlf4处理的ES细胞的DNA微阵列分析。绘制具有相对表达水平的基因的对数比率。图为左侧1显示。(C) Klf4和Oct3/4调控的假定靶基因的鉴定。我们确定了28个基因,其表达依赖于Klf4和Oct3/4。(D) 激活1200015N20瑞克Klf4启动子。1200015N20里克卢克,6Wtk-luc(重量),或tk-luc公司用空载体或Klf4表达载体共转染HeLa细胞,测定与空载体相关的荧光素酶活性。(E) 10月3/4日重新启用记者2004年10月3日-耗尽的ES细胞。报告质粒转染ZHBTc4 ES细胞2004年10月3日表达载体,细胞培养有或没有Tc,荧光素酶活性相对于没有Tc和2004年10月3日确定表达载体。
图7。
图7。
Klf4在激活左侧1启动子。(A) Oct3/4和Sox2激活的差异启动子因子要求。这个左侧1启动子通过招募Klf4作为启动子因子而激活,但需要Utf1号机组10月3/4日发起人尚未确定。(B) 的规定左侧1通过ES-特异性转录因子。2004年10月3日Sox2系统被自身激活,并且Klf4公司处于Oct3/4的控制之下。

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