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。2000年2月；16(2):169-75.
doi:10.1093/bioinformatics/16.2.169。

PNAD-CSS：构建蛋白质名称缩写词典的工作台

M吉田 1, K福田, T高木
附属公司

PNAD-CSS：构建蛋白质名称缩写词典的工作台

M吉田等。 生物信息学。 2000年2月。

摘要

动机：自最初开发以来，分子级数据数据库的集成和建设取得了进展。虽然生物分子相互关联，形成一个复杂的系统，但信息存储在大量文献档案或各种数据库中。生物物体没有统一的命名约定，生物术语可能是模糊的或多义的。这使得数据库的集成和交互变得困难。为了消除这些问题，机器可读自然语言资源似乎很有前途。我们开发了一个用于构建蛋白质名称缩写词典（PNAD）的工作台。

结果：我们开发了PNAD构建支持系统（PNAD-CSS），该系统提供了各种便利设施，以降低蛋白质名称缩写词典的构建成本，该词典的词条是从生物医学论文的摘要中收集的。该系统允许用户通过删除一些麻烦的任务来集中精力进行更高级别的解释，例如管理摘要、提取蛋白质名称及其缩写等。为了提取一对蛋白质名称和缩写，我们开发了一个由PROPER系统和PNAD系统组成的混合系统。PNAD系统可以从蛋白质名称中的括号释义中提取对，PROPER系统识别这些对，准确率为98.95%，召回率为95.56%，完全准确率为97.58%。

可利用性：PROPER系统可从免费获得http://www.hgc.inc.u-tokyo.ac.jp/service/tooldoc/KeX/intro.html。其他软件也可根据要求提供。联系作者。

联系人：mikio@ims.u-tokyo.ac.jp

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