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在9a自噬相关9A[小家鼠（家鼠）]

基因ID:245860，更新日期2024年6月6日

总结

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官方符号
在9a由提供MGI公司
官方全名
自噬相关9A由提供MGI公司
主要来源
MGI:MGI:2138446
请参阅相关
乐团：ENSMUSG00000033124 联盟基因组：MGI:2138446
基因类型
蛋白质编码
RefSeq状态
已验证
有机体
小家鼠
血统
真核生物；后生动物；脊索动物；克兰亚塔；脊椎动物；真造口术；哺乳动物；Eutheria；尤阿古托格利尔斯；闪光；啮齿动物；肌形态；鼠形目；鼠科；Murinae公司；穆斯；穆斯
也称为
附件9；Apg9l1；在9l1
总结
作用于几个过程的上游或内部，包括自噬体组装；干扰素-β产生的负调控；高尔基体蛋白定位。位于自噬体中。表达于多种结构，包括耳蜗；心脏；肝脏；肺；和端脑。与人类ATG9A同源（自噬相关9A）。【由基因组资源联盟提供，2022年4月】
表达式
在成人睾丸（RPKM 166.6）、成人十二指肠（RPKM40.8）和26个其他组织中普遍表达查看更多
直系同源
人类 全部的
新款
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基因组背景

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请参阅中的Atg9a基因组数据查看器
位置：
1 C4；1 38.62厘米
外显子计数：
17
注释发布 状态 装配 Chr公司 位置
RS_2024_02号 现在的 GRCm39型(GCF_000001635.27号) 1 NC_000067.7（75157509..75168654，补码）
108.20200622 上一个程序集 GRCm38.p6型(GCF_000001635.26号) 1 NC_000067.6（75180861..75192010，补遗）

染色体1-NC_000067.7描述相邻基因的基因组上下文 Neighboring gene STARR-positive B cell enhancer ABC_E1550 Neighboring gene zinc finger, AN1 type domain 2B Neighboring gene ATP-binding cassette, sub-family B member 6 Neighboring gene STARR-positive B cell enhancer ABC_E8982 Neighboring gene STARR-positive B cell enhancer ABC_E321 Neighboring gene ankyrin repeat and zinc finger domain containing 1 Neighboring gene galactosidase, beta 1-like Neighboring gene serine/threonine kinase 16 Neighboring gene tubulin, alpha 4A

基因组区域、转录物和产物

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表达式

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  • 项目名称：小鼠ENCODE转录组数据
  • 描述：鼠标ENCODE项目生成的RNA分析数据集。
  • 生物项目：PRJNA66167型
  • 出版物：PMID 25409824
  • 分析日期：无

参考文献

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PubMed中的相关文章

  1. Atg9A蛋白是一种自噬相关的膜蛋白，定位于小鼠大脑的神经元。 田村H，等.组织化学与细胞化学杂志，2010年5月.PMID 20124090，免费PMC文章
  2. HSF4转录通过调节ATG9a在晶状体末端分化过程中激活自噬。 张杰，等《眼科视觉科学研究》，2023年6月1日。PMID 37266953，免费PMC文章
  3. MicroRNA-34a通过靶向自噬相关基因9a介导乙醇诱导的神经嵴细胞神经分化损伤。 风扇H，等.实验神经学，2019年10月PMID 31247197，免费PMC文章
  4. 改变AP-4缺乏综合征小鼠模型神经元中ATG9A的分布和轴突聚集物的积累。 减速R，等PLoS Genet，2018年4月PMID 29698489，免费PMC文章
  5. 在对沙门氏菌的自噬反应中，LC3募集机制与Atg9L1依赖性膜的形成是分开的。 Kageyama S公司，等《分子生物学细胞》，2011年7月1日。PMID 21525242，免费PMC文章

查看PubMed中的所有（46）条引文

GeneRIFs：功能的基因引用

什么是GeneRIF？
  1. IL-4通过增加自噬流量和线粒体氧化应激，激活哮喘、NLRP3炎性体和高尔基体碎片中的ULK1/Atg9a/Rab9。
    标题：IL-4通过增加自噬流量和线粒体氧化应激，激活哮喘、NLRP3炎症小体和高尔基体碎裂中的ULK1/Atg9a/Rab9。
  2. S100a9抑制Atg9a转录，并参与抑制β1肾上腺素受体自身抗体诱导的心肌细胞自噬。
    标题：S100a9抑制Atg9a转录并参与抑制β（1）-肾上腺素受体自身抗体诱导的心肌细胞自噬。
  3. HSF4转录通过调节ATG9a在晶状体末端分化过程中激活自噬。
    标题：HSF4转录通过调节ATG9a在晶状体末端分化过程中激活自噬。
  4. 通过Atg9的Ufm化在果蝇老化大脑中的神经保护作用。
    标题：通过Atg9的Ufm化在果蝇老化大脑中的神经保护作用。
  5. ATG9A通过非常规溶酶体靶向途径防止TNF细胞毒性。
    标题：ATG9A通过非常规溶酶体靶向途径防止TNF细胞毒性。
  6. NMMHC IIA通过促进脑缺血/再灌注中F-肌动蛋白依赖性ATG9A的运输，触发神经元自噬细胞死亡。
    标题：NMMHC IIA通过促进脑缺血/再灌注中F-肌动蛋白依赖性ATG9A的运输，触发神经元自噬细胞死亡。
  7. ATG9A分选失败导致的轴突自噬体成熟缺陷是AP-4缺乏综合征的病理基础。
    标题：由于ATG9A分选失败导致的轴突自噬体成熟缺陷是AP-4缺乏综合征病理学的基础。
  8. 这些结果表明，乙醇通过靶向Atg9a介导miR-34a抑制神经嵴细胞的神经分化。
    标题：MicroRNA-34a通过靶向自噬相关基因9a介导乙醇诱导的神经嵴细胞神经分化损伤。
  9. 高ATG9A表达与肝纤维化相关。
    标题：lncRNA NEAT1/miR-29b/Atg9a轴调节IGFBPrP1诱导的小鼠肝星状细胞自噬和活化。
  10. Atg9a缺乏会导致轴突及其末端进行性退化，但不会导致神经元胞体退化。
    标题：Atg9a缺乏导致轴突特异性损伤，包括神经回路发育不全。
提交： 新GenerRIF 更正 查看所有GenerRIF（21）

变更

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等位基因

这种类型的等位基因在《小鼠基因组信息学》中有记载（MGI）
  • 核酸内切酶介导（4）
  • 目标（2）1条引文

互动

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产品 交互作用剂 其他基因 复杂 来源 酒吧 描述

一般基因信息

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标记

同源性

克隆名称

  • MGC105176型

基因本体论 由MGI提供

功能 证据代码 酒吧
启用磷脂超临界淀粉酶活性 国际标准化组织
从序列正畸学推断
更多信息
  
过程 证据代码 酒吧
自噬体组装内的上游行为 进口
根据突变表型推断
更多信息
 公共医学 
自噬体组装内的上游行为 国际标准化组织
从序列正畸学推断
更多信息
 公共医学 
自噬中的上游行为 进口
根据突变表型推断
更多信息
 公共医学 
参与自噬 进口
根据突变表型推断
更多信息
 公共医学 
参与线粒体自噬 国际律师协会
从祖先的生物学角度推断
更多信息
  
参与骨形态发生 进口
根据突变表型推断
更多信息
 公共医学 
先天性免疫反应中的上游活动 进口
根据突变表型推断
更多信息
 公共医学 
干扰素-β生产的上游活动 进口
根据突变表型推断
更多信息
 公共医学 
acts上游of或脂质转运内 国际能源署
从电子注释推断
更多信息
  
巨噬细胞细胞因子产生的上游行为 进口
根据突变表型推断
更多信息
 公共医学 
acts_upstream_of_or或干扰素-β产生的负调控 进口
根据突变表型推断
更多信息
 公共医学 
acts_upstream_of_of_within对巨噬细胞细胞因子产生的负调控 进口
根据突变表型推断
更多信息
 公共医学 
参与核的分段微自噬 国际律师协会
从祖先的生物学角度推断
更多信息
  
参与程序性坏死细胞死亡 进口
根据突变表型推断
更多信息
 公共医学 
acts_upstream_of_or_in高尔基体蛋白定位 进口
根据突变表型推断
更多信息
 公共医学 
吞噬细胞组装位点相关蛋白定位 国际律师协会
从祖先的生物学角度推断
更多信息
  
卷入网织吞噬 国际律师协会
从祖先的生物学角度推断
更多信息
  
组件 证据代码 酒吧
高尔基体中的位置 国际标准化组织
从序列正畸学推断
更多信息
  
位于高尔基膜内 国际开发协会
根据直接分析推断
更多信息
 公共医学 
位于高尔基膜内 国际标准化组织
从序列正畸学推断
更多信息
  
在自噬体中是活性的 国际律师协会
从祖先的生物学角度推断
更多信息
  
定位于自噬体 国际开发协会
根据直接分析推断
更多信息
 公共医学 
未定位于自噬体膜 国际标准化组织
从序列正畸学推断
更多信息
  
位于细胞质中 国际开发协会
根据直接分析推断
更多信息
 公共医学 
定位于细胞质小泡 国际能源署
从电子注释推断
更多信息
  
定位内质网 国际能源署
从电子注释推断
更多信息
  
定位内质网膜 国际开发协会
根据直接分析推断
更多信息
 公共医学 
定位内质网膜 国际标准化组织
从序列正畸学推断
更多信息
  
定位于内体 国际标准化组织
从序列正畸学推断
更多信息
 公共医学 
定位于细胞内膜结合细胞器 国际标准化组织
从序列正畸学推断
更多信息
  
定位于晚期内体 国际标准化组织
从序列正畸学推断
更多信息
  
定位膜 国际能源署
从电子注释推断
更多信息
  
位于线粒体内 国际标准化组织
从序列正交推断
更多信息
  
is_active_in吞噬细胞装配点 国际律师协会
从祖先的生物学角度推断
更多信息
  
位于吞噬细胞装配点 国际标准化组织
从序列正畸学推断
更多信息
  
位于回收内体中 国际标准化组织
从序列正畸学推断
更多信息
  
定位再循环内体膜 国际标准化组织
从序列正畸学推断
更多信息
  
突触膜中的is_active 国际开发协会
根据直接分析推断
更多信息
 公共医学 
突触膜中的is_active 进口
根据突变表型推断
更多信息
 公共医学 
突触小泡中的is_active 国际标准化组织
从序列正畸学推断
更多信息
  
位于trans-Golgi网络中 国际标准化组织
从序列正畸学推断
更多信息
 公共医学 

一般蛋白质信息

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首选名称
自噬相关蛋白9A
姓名
APG9自噬9-like 1
APG9类1
自噬蛋白9
自噬相关9样蛋白1

NCBI参考序列（RefSeq）

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新款 尝试新的成绩单表

独立于注释的RefSeq维护基因组

这些参考序列独立于基因组构建而存在。解释

这些参考序列与基因组无关注释循环，因此其版本可能与当前的RefSeq版本不匹配基因组构建。通过比较中RefSeq的版本来确定版本不匹配本节至中报告的那一节基因组区域，成绩单和产品以上。

mRNA和蛋白质

  1. NM_001003917.5号→NP_001003917.2号自噬相关蛋白9A亚型a

    参见NP_001003917.2的相同蛋白质及其注释位置

    状态：已验证

    描述
    成绩单变体：与变体1相比，该变体（2）在5'UTR上有所不同。变体1、2、5和6都编码相同的亚型（a）。
    源序列
    AC166150型
    共识CDS
    CCDS35622.1型
    UniProtKB/瑞士Prot
    第三季度第四季度,Q68FE2号机组
    UniProtKB/TrEMBL公司
    A0A087WP33型
    相关的
    ENSMUSP00000047449.9,ENSMUST00000040689.15
    保守领域（1）总结
    pfam04109型
    位置：37→525
    APG9；自噬蛋白Apg9

  2. NM_001288612.2号→NP_001275541.1号自噬相关蛋白9A亚型a

    参见NP_001275541.1的相同蛋白质及其注释位置

    状态：已验证

    描述
    转录变体：该变体（1）编码较长的亚型（a）。变体1、2、5和6都编码相同的亚型（a）。
    源序列
    交流电166150
    共识CDS
    CCDS35622.1型
    UniProtKB/瑞士Prot
    第三季度第四季度,Q68FE2号机组
    UniProtKB/TrEMBL公司
    A0A087WP33型
    相关的
    ENSMUSP00000139731.2号,ENSMUST00000188347.7号
    保守领域（1）总结
    pfam04109型
    位置：37→525
    APG9；自噬蛋白Apg9

  3. NM_001408225.1→NP_001395154.1自噬相关蛋白9A亚型a

    状态：已验证

    源序列
    AC166150型
    UniProtKB/瑞士Prot
    第三季度第四季度,Q68FE2号机组
    UniProtKB/TrEMBL公司
    A0A087WP33型

  4. NM_001408227.1→NP_001395156.1号自噬相关蛋白9A亚型a

    状态：已验证

    源序列
    AC166150型
    UniProtKB/瑞士Prot
    第三季度第四季度,Q68FE2号机组
    UniProtKB/TrEMBL公司
    A0A087WP33型
    相关的
    ENSMUSP00000139641.2号,ENSMUST00000189702.7

  5. NM_001408229.1→NP_001395158.1型自噬相关蛋白9A亚型c

    状态：已验证

    源序列
    AC166150型

  6. NM_001408230.1→NP_001395159.1号自噬相关蛋白9A亚型c

    状态：已验证

    源序列
    AC166150型

  7. NM_001408231.1→NP_001395160.1型自噬相关蛋白9A亚型c

    状态：已验证

    源序列
    AC166150型

核糖核酸

  1. 编号：109938.2RNA序列

    状态：已验证

    描述
    转录变体：与变体1相比，该变体（4）在5'UTR上有所不同，在外显子的3'端使用了一个交替的剪接连接。该变体被表示为非编码，因为使用变体1中使用的5’-最期望的翻译起始密码子，使转录物成为非传感介导的mRNA衰变（NMD）的候选。
    源序列
    交流电166150
    相关的
    ENSMUST00000239085.2

  2. 176609.1尼泊尔卢比RNA序列

    状态：已验证

    源序列
    AC166150型
    相关的
    恩斯穆斯特00000189665.7

  3. 176610.1尼泊尔卢比RNA序列

    状态：已验证

    源序列
    AC166150型

  4. 编号_176611.1RNA序列

    状态：已验证

    源序列
    AC166150型

注释基因组的参考序列：GCF_000001635.27-RS_2024_02

以下部分包含属于特定基因组构建。解释

参考GRCm39 C57BL/6J

基因组学

  1. NC_000067.7参考GRCm39 C57BL/6J

    范围
    75157509..75168654补码
    下载
    发电厂银行,美国金融服务贸易协会,序列查看器（图形）

mRNA和蛋白质

  1. XM_011238690.4号→XP_011236992.1号自噬相关蛋白9A亚型X3

    UniProtKB/TrEMBL公司
    A0A087WP33型
    保守领域（1）总结
    pfam04109型
    位置：37→525
    APG9；自噬蛋白Apg9
核苷酸 蛋白质 应变
标题 访问和版本
蛋白质接入 链接
GenPept链接 UniProtKB链接
Q68FE2.2问题 GenPept公司 UniProtKB/Swiss-Prot:Q68FE2

基因链接输出

以下内容链接输出资源由外部提供者提供。这些提供者负责维护链接。

化学信息
分子生物学数据库
研究材料
工具
其他