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H3C4型H3聚集组蛋白4[智人（人类）]

基因ID:8351，更新日期2024年3月5日

总结

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官方符号
H3C4型由提供HGNC公司
官方全名
H3聚集组蛋白4由提供HGNC公司
主要来源
HGNC:HGNC:4767
请参阅相关
乐团：ENSG00000197409 MIM:602811； 联盟基因组：HGNC:4767
基因类型
蛋白质编码
RefSeq状态
检验过的
有机体
智人
血统
真核生物；后生动物；脊索动物；克兰亚塔；脊椎动物；真造口术；哺乳动物；Eutheria；尤阿古托格利尔斯；灵长类；Haplorrhini公司；卡塔里尼；人科；人类
也称为
H3/b；H3C1；H3C2；H3C3；H3C6；H3C7；H3C8；H3FB；H3C10；H3C11；H3C12；HIST1H3D
总结
组蛋白是真核生物中负责染色体纤维核小体结构的基本核蛋白。四个核心组蛋白（H2A、H2B、H3和H4）中每一个的两个分子形成八聚体，约146 bp的DNA被包裹在重复单元中，称为核小体。连接体组蛋白H1与核小体之间的连接体DNA相互作用，并在染色质压缩成高阶结构中发挥作用。该基因是无内含子的，编码组蛋白H3家族成员的复制依赖性组蛋白。该基因的转录本没有多聚a尾部，但含有回文终止元件。该基因位于第6染色体上的大组蛋白基因簇中。[由RefSeq提供，2015年8月]
表达式
骨髓（RPKM2.8）、前列腺（RPKM1.5）和14个其他组织中广泛表达查看更多
直系同源
全部的
新款
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基因组背景

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参见中的H3C4基因组数据查看器
位置：
第22页
外显子计数：
2
注释发布 状态 装配 Chr公司 位置
RS_2023_10号 现在的 GRCh38.p14型(GCF_000001405.40) 6 NC_000006.12（26196784..26199293，补码）
RS_2023_10号 现在的 T2T-CHM13v2.0(GCF_009914755.1号) 6 NC_060930.1（26065245..26067759，补码）
105.20220307 上一个程序集 GRCh37.0p13型(GCF_000001405.25号) 6 NC_000006.11（26197012..26199521，补码）

染色体6-NC_000006.12描述邻近基因的基因组背景 Neighboring gene ATAC-STARR-seq lymphoblastoid active region 24199 Neighboring gene H4 clustered histone 4 Neighboring gene ATAC-STARR-seq lymphoblastoid active region 24200 Neighboring gene H3K27ac hESC enhancer GRCh37_chr6:26196641-26197242 Neighboring gene H1.12 linker histone, cluster member, pseudogene Neighboring gene H3K27ac hESC enhancer GRCh37_chr6:26197243-26197843 Neighboring gene ATAC-STARR-seq lymphoblastoid active region 24202 Neighboring gene ATAC-STARR-seq lymphoblastoid active region 24203 Neighboring gene BRD4-independent group 4 enhancer GRCh37_chr6:26199013-26200212 Neighboring gene H2A clustered histone 7 Neighboring gene H2B clustered histone 7 Neighboring gene ribosomal protein S10 pseudogene 1

基因组区域、转录物和产物

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表达式

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  • 项目名称：HPA RNA-seq正常组织
  • 描述：对代表27种不同组织的95名人类个体的组织样本进行RNA-seq，以确定所有蛋白编码基因的组织特异性
  • 生物项目：项目编号：4337
  • 出版物：项目管理标识号24309898
  • 分析日期：2018年4月4日星期三07:08:55

参考文献

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PubMed中的相关文章

  1. 褐藻黄质可能通过下调HIST1H3D抑制宫颈癌细胞增殖。 叶G，等《国际医学研究杂志》，2020年10月，PMID 33086884，免费PMC文章
  2. HIST1H3D：肺癌有希望的治疗靶点。 鲁伊，等国际Oncol杂志，2017年3月，PMID 28112369
  3. 组蛋白mRNA和microRNA 760在胃癌患者中的表达模式对比。 Iwaya T，等《临床癌症研究》，2013年12月1日。PMID 24097871号
  4. DPF3b与乙酰化组蛋白肽复合物的晶体结构。 李伟，等《结构生物学杂志》，2016年9月，PMID 27402533
  5. 通过组合修饰模式调节14-3-3与磷酸化组蛋白H3的相互作用。 冬季S，等《细胞周期》，2008年5月15日。PMID 18418070，免费PMC文章

查看PubMed中的所有（89）引文

GeneRIFs：功能的基因引用

表型

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在NIH基因检测注册中心（GTR）查找该基因的测试

使用PheGenI回顾该区域的eQTL和表型关联数据

EBI GWAS目录

描述
全基因组荟萃分析确定了11个人体测量特征的新位点，并为遗传结构提供了见解。
EBI GWAS目录
数百种变异聚集在基因组基因座和生物学途径中，影响人类身高。
EBI GWAS目录
东亚成人身高全基因组关联研究的荟萃分析确定了17个新基因座。
EBI GWAS目录

变更

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参见ClinVar中的变量

参见dbVar中的研究和变体

参见变体查看器（GRCh37.p13）

参见变体查看器（GRCh38）

基因型

HIV-1相互作用

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蛋白质相互作用

蛋白质 基因 互动 酒吧
Tat公司 塔特 HIV-1 Tat肽结合核心组蛋白H2A、H2B、H3和H4，Tat蛋白向HIV-1 LTR启动子招募组蛋白乙酰转移酶，导致组蛋白H3和H4乙酰化，脱去染色质结构并增加NFkappaB反应性 公共医学

转到HIV-1人类交互数据库

PubChem的途径

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互动

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产品 交互作用剂 其他基因 复杂 来源 酒吧 描述

一般基因信息

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标记

潜在的阅读

包含基因：H2AC7型

同源性

基因本体论 GOA提供

功能 证据代码 酒吧
启用DNA绑定 国际能源署
从电子注释推断
更多信息
  
启用钙粘蛋白绑定 HDA公司 公共医学 
实现蛋白质结合 国际开发协会
根据直接分析推断
更多信息
 公共医学 
实现蛋白质结合 IPI公司
从物理相互作用推断
更多信息
 公共医学 
实现蛋白质异二聚体活性 国际能源署
从电子注释推断
更多信息
  
使染色质的结构成分成为可能 国际能源署
从电子注释推断
更多信息
  
流程 证据代码 酒吧
涉及染色质组织 北美
不可追踪的作者声明
更多信息
 公共医学 
参与基因表达的表观遗传调控 国际开发协会
根据直接分析推断
更多信息
 公共医学 
acts_upstream_of_opositive_effect基因表达 国际开发协会
根据直接分析推断
更多信息
 公共医学 
参与核小体组装 国际开发协会
根据直接分析推断
更多信息
 公共医学 
参与核小体组装 进口
根据突变表型推断
更多信息
 公共医学 
涉及端粒组织 TAS公司
可追溯作者声明
更多信息
 公共医学 
组件 证据代码 酒吧
定位于胞外外体 HDA公司 公共医学 
位于细胞外区域 TAS公司
可追溯作者声明
更多信息
  
定位膜 HDA公司 公共医学 
核质定位 国际开发协会
根据直接分析推断
更多信息
  
核质定位 TAS公司
可追溯作者声明
更多信息
  
核小体部分 国际开发协会
根据直接分析推断
更多信息
 公共医学 
核小体部分 IPI公司
从物理相互作用推断
更多信息
 公共医学 
位于细胞核内 HDA公司 公共医学 
位于细胞核内 国际开发协会
根据直接分析推断
更多信息
 公共医学 
部分含蛋白复合物 国际开发协会
根据直接分析推断
更多信息
 公共医学 

一般蛋白质信息

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首选名称
组蛋白H3.1
姓名
H3组蛋白家族，成员B
组蛋白1，H3d
组蛋白H3/b
组蛋白簇1 H3家族成员d
组蛋白簇1，H3d

NCBI参考序列（RefSeq）

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新款 尝试新的成绩单表

独立于注释的RefSeq维护基因组

这些参考序列独立于基因组构建而存在。解释

这些参考序列与基因组无关注释循环，因此其版本可能与当前的RefSeq版本不匹配基因组构建。通过比较中RefSeq的版本来确定版本不匹配本节至中报告的那一节基因组区域，成绩单和产品以上。

mRNA和蛋白质

  1. 纳米_001376937.1→NP_001363866.1号组蛋白H3.1

    状态：已审阅

    描述
    成绩单变体：与变体2相比，该变体（1）在5'UTR上有所不同。变体1和2编码相同的蛋白质。
    源序列
    AL031777号
    共识CDS
    CCDS4590.1公司
    UniProtKB/Swiss-Prot公司
    A0PJT7型,A5PLR1型,P02295号,P02296号,第16106页,第68431页,Q6ISV8,问题6NWP8,问题6NWP9,Q6NXU4型,Q71DJ3号机组,问题93081
    UniProtKB/TrEMBL公司
    A8K4Y7型,B2R6Y1型
    相关的
    ENSP00000366999.2号,ENST00000356476.3标准
    保守领域（1）总结
    PTZ00018型
    位置：1→136
    PTZ00018；组蛋白H3；暂定

  2. NM_003530.4号→NP_003521.2号组蛋白H3.1

    参见NP_003521.2的相同蛋白质及其注释位置

    状态：已审阅

    描述
    成绩单变体：此变体（2）表示较长的成绩单。变体1和2编码相同的蛋白质。
    源序列
    BC031333、DB242999
    共识CDS
    CCDS4590.1公司
    UniProtKB/Swiss-Prot公司
    第0页第7页,A5PLR1型,P02295号,P02296号,第16106页,第68431页,Q6ISV8,问题6NWP8,问题6NWP9,Q6NXU4型,Q71DJ3号机组,问题93081
    UniProtKB/TrEMBL公司
    A8K4Y7型,B2R6Y1型
    保守领域（1）总结
    PTZ00018型
    位置：1→136
    PTZ00018；组蛋白H3；暂定

注释基因组的参考序列：GCF_000001405.40-RS_2023_10

以下部分包含属于特定基因组构建。解释

参考GRCh38.p14一次组件

基因组学

  1. NC_000006.12参考GRCh38.p14初级组件

    范围
    26196784..26199293补码
    下载
    GenBank（基因银行）,美国金融服务贸易协会,序列查看器（图形）

备选T2T-CHM13v2.0

基因组学

  1. NC_060930.1替代T2T-CHM13v2.0

    范围
    26065245..26067759补码
    下载
    GenBank（基因银行）,美国金融服务贸易协会,序列查看器（图形）
核苷酸 蛋白质
标题 访问和版本
蛋白质接入 链接
GenPept链接 UniProtKB链接
第68431.2页 GenPept公司 UniProtKB/Swiss-Prot:P68431

基因链接输出

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