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Egln2号机组egl-9家族低氧诱导因子2[小家鼠(家鼠)]

基因ID:112406,更新日期2024年5月12日

总结

官方符号
Egln2号机组由提供MGI公司
官方全名
egl-9家族低氧诱导因子2由提供MGI公司
主要来源
MGI:MGI:1932287
请参阅相关
乐团:ENSMUSG00000058709 联盟基因组:MGI:1932287
基因类型
蛋白质编码
RefSeq状态
已验证
有机体
小家鼠
血统
真核生物;后生动物;脊索动物;克兰亚塔;脊椎动物;真造口术;哺乳动物;Eutheria;尤阿古托格利尔斯;闪光;啮齿动物;肌形态;鼠形目;鼠科;穆里奈;穆斯;穆斯
也称为
Ier4;Phd1;SM-20;Hif-p4h-1;0610011A13瑞克
总结
预计可实现亚铁结合活性;氧传感器活性;肽基脯氨酸4-双加氧酶活性。预计参与多种过程,包括细胞氧化还原稳态;细胞缺氧反应;肽基-脯氨酸羟基化为4-羟基-L-脯氨酸。预计位于核质中。预计在细胞质和细胞核中活跃。在大脑中表达;大脑皮层;海马;和嗅觉上皮。该基因的人类同源基因与肾细胞癌有关。与人EGLN2(egl-9家族缺氧诱导因子2)同源。【由基因组资源联盟提供,2022年4月】
表达式
睾丸成体(RPKM 271.8)、肾上腺成体(RP KM 57.2)和27个其他组织中普遍表达查看更多
直系同源
新款
尝试新的基因表
尝试新的成绩单表

基因组背景

参见中的Egln2基因组数据查看器
位置:
7 A3;7 15.83立方厘米
外显子计数:
7
注释发布 状态 装配 Chr公司 位置
RS_2024_02号 现在的 GRCm39型(GCF_000001635.27号) 7 NC_000073.7(26858083..26866227,补体)
108.20200622 上一个程序集 GRCm38.p6型(GCF_000001635.26号) 7 NC_000073.6(27158658..27166802,补遗)

染色体7-NC_000073.7描述邻近基因的基因组背景 Neighboring gene cytochrome P450, family 2, subfamily f, polypeptide 2 Neighboring gene STARR-seq mESC enhancer starr_18343 Neighboring gene cytochrome P450, family 2, subfamily t, polypeptide 4 Neighboring gene STARR-positive B cell enhancer mm9_chr7:27952094-27952395 Neighboring gene RAB4B, member RAS oncogene family Neighboring gene STARR-positive B cell enhancers ABC_E1725 and ABC_E288 Neighboring gene microRNA 3101 Neighboring gene MIA SH3 domain containing

基因组区域、转录物和产物

表达式

  • 项目名称:鼠标ENCODE转录组数据
  • 描述:鼠标ENCODE项目生成的RNA分析数据集。
  • 生物项目:PRJNA66167型
  • 出版物:PMID 25409824
  • 分析日期:无

参考文献

GeneRIFs:功能的基因引用

什么是GeneRIF?

变更

等位基因

这类等位基因在《小鼠基因组信息学》上有记载(MGI)
  • 核酸内切酶介导(3)
  • 目标(5)1条引文

PubChem的途径

互动

产品 交互作用剂 其他基因 复杂 来源 酒吧 描述

一般基因信息

标记

克隆名称

  • MGC101954年

基因本体论 由MGI提供

组件 证据代码 酒吧
细胞质中的is_active_ 国际律师协会
从祖先的生物学角度推断
更多信息
 
核质定位 国际标准化组织
从序列正畸学推断
更多信息
 
在核心中是活动的 国际律师协会
从祖先的生物学角度推断
更多信息
 
位于细胞核内 国际标准化组织
从序列正畸学推断
更多信息
 

一般蛋白质信息

首选名称
脯氨酰羟化酶EGLN2
姓名
HIF-PH1型
HIF-脯氨酰羟化酶1
HPH-1型
法尔科
低氧诱导因子脯氨酰羟化酶1
即时早期响应4
脯氨酰羟化酶结构域蛋白1
NP_001344696.1号
NP_444438.2号
XP_030097849.1号
XP_030097850.1型
XP_030097851.1号
XP_036008464.1号

NCBI参考序列(RefSeq)

新款 尝试新的成绩单表

独立于注释的RefSeq维护基因组

这些参考序列独立于基因组构建而存在。解释

这些参考序列与基因组无关注释循环,因此其版本可能与当前的RefSeq版本不匹配基因组构建。通过比较中RefSeq的版本来确定版本不匹配本节至中报告的那一节基因组区域,成绩单和产品以上。

mRNA和蛋白质

  1. NM_001357767.1NP_001344696.1号脯氨酰羟化酶EGLN2亚型2

    状态:已验证

    源序列
    AC157553型
    保守领域(1)总结
    智能00702
    位置:172266
    P4Hc;脯氨酸4-羟化酶α亚基同源物
  2. NM_053208.4号NP_444438.2号脯氨酰羟化酶EGLN2亚型1

    参见NP_444438.2的相同蛋白质及其注释位置

    状态:已验证

    源序列
    BC086764、BE993075、CB248412
    共识CDS
    CCDS21011.1号
    UniProtKB/Swiss-Prot公司
    问题8C6I4,问题8CIL9,Q8VHJ1型,Q91年2,Q99MI0型
    UniProtKB/TrEMBL公司
    Q3TXL8号,第3U8V5期,Q80X29型
    相关的
    ENSMUSP00000078966.5,ENSMUST00000080058.11号
    保守领域(1)总结
    智能00702
    位置:217387
    P4Hc;脯氨酸4-羟化酶α亚基同源物

注释基因组的参考序列:GCF_000001635.27-RS_2024_02

以下部分包含属于特定基因组构建。解释

参考GRCm39 C57BL/6J

基因组学

  1. NC_000073.7参考GRCm39 C57BL/6J

    范围
    26858083..26866227补码
    下载
    GenBank(基因银行),美国金融服务贸易协会,序列查看器(图形)

mRNA和蛋白质

  1. XM_030241990.1号XP_030097850.1型脯氨酰羟化酶EGLN2亚型X2

    保守领域(1)总结
    智能00702
    位置:172266
    P4Hc;脯氨酸4-羟化酶α亚基同源物
  2. XM_030241991.1号XP_030097851.1号脯氨酰羟化酶EGLN2异构体X2

    保守领域(1)总结
    智能00702
    位置:172266
    P4Hc;脯氨酸4-羟化酶α亚基同源物
  3. XM_030241989.1号XP_030097849.1号脯氨酰羟化酶EGLN2亚型X1

    UniProtKB/Swiss-Prot公司
    问题8C6I4,问题8CIL9,Q8VHJ1型,Q91年2,Q99MI0型
    UniProtKB/TrEMBL公司
    Q3TXL8号,第3U8V5期,Q80X29型
    相关的
    ENSMUSP00000104019.2号机组,库存00000108382.2
    保守领域(1)总结
    智能00702
    位置:217387
    P4Hc;脯氨酸4-羟化酶α亚基同源物
  4. XM_036152571.1号XP_036008464.1号脯氨酰羟化酶EGLN2亚型X1

    UniProtKB/Swiss-Prot公司
    问题8C6I4,问题8CIL9,Q8VHJ1型,Q91年2,Q99MI0型
    UniProtKB/TrEMBL公司
    Q3TXL8号,第3U8V5期,Q80X29型
    保守领域(1)总结
    智能00702
    位置:217387
    P4Hc;脯氨酸4-羟化酶α亚基同源物