Oncol Lett公司。 2017年10月; 14(4): 4605–4612.
miR-1和miR-214的异常改变与PDAC患者的临床病理特征和预后相关 , , , , 和
青城 中国山西省长治市人民医院老年科,邮编:046000
李华汉 中国山西省长治市人民医院老年科,邮编:046000
赵海娟 中国山西省长治市人民医院老年科,邮编:046000
李慧(音) 中国山西省长治市人民医院老年科,邮编:046000
李建兵 中国山西省长治市人民医院老年科,邮编:046000
中国山西省长治市人民医院老年科,邮编:046000
2016年1月14日收到; 2017年7月27日接受。
摘要 胰腺导管腺癌(PDAC)是一种预后不良的恶性疾病。 众所周知,PDAC早期难以诊断,无复发预后差,但缺乏有效治疗,对其生物学特性了解有限。 因此,迫切需要提高对PDAC相关细胞或分子特性的理解,并探索诊断和治疗该疾病的新途径。 在本研究中,使用miRNA微阵列研究了PDAC患者和健康对照者血清和肿瘤样本的microRNA(miRNA/miR)谱,并确定了miR-1表达在PDAC中的潜在作用。 长治市人民医院门诊确诊为PDAC的43名患者被邀请参加。 采集血液和手术肿瘤样本,通过miRNA微阵列和逆转录定量聚合酶链反应(RT-qPCR)进行分析。 手术肿瘤组织还用于通过以下方式确定miRNA的状态 就地 杂交(ISH)。 微阵列结果显示:i)PDAC患者血清中27个miRNA和肿瘤组织中23个miRNA与对照组相比存在差异; ii)PDAC组的血清或肿瘤组织样本中miR-1、miR-10b和miR-214显著改变。 RT-qPCR检测PDAC患者的miRNA水平,结果证实了从miRNA微阵列获得的结果。 特别是,本研究结果表明,PDAC组织中miR-1的减少和miR-214的增加与PDAC患者的临床病理特征和生存率有关。 本研究结果表明,miRNAs在PDAC致癌进展中起着重要作用,并提供了有用的标记物,包括miR-1、miR-214和miR-10b,用于使用无创方法确定PDAC预后。
关键词: 胰腺导管腺癌,microRNA-1,microRNA-10b,microRNA-214,临床病理特征,生存率
介绍 胰腺癌(PCC)是一种高度恶性的肿瘤,具有很高的转移率( 1 , 2 ). 在美国,PCC是人类死亡的主要原因之一( 1 ). 在美国,预计PCC导致的死亡总数将显著增加,并在2030年之前成为癌症相关死亡的第二大原因( 2 ). 在各种类型的PCC中,胰腺导管腺癌(PDAC)占所有胰腺肿瘤的90%以上。 PDAC是一种毁灭性的恶性疾病,预后不良,其所有阶段的1年生存率约为18%( 三 , 4 ). 仅在2012年,PDAC就导致全球33000人死亡。 即使在世界上拥有最好医疗服务的地区,也只有少数患者得到及时及时的治疗,5年生存率<22%,预计发病率会随着人口老龄化而上升( 5 ). 众所周知,PDAC早期难以诊断,无复发预后差,但缺乏有效治疗,对其生物学特性了解有限( 6 , 7 ). 因此,迫切需要提高对PDAC相关细胞或分子特性的理解,并探索诊断和治疗该疾病的新途径( 8 , 9 ).
μmicroRNAs(miRNAs/miR)通过与3′非翻译区(UTR)结合,参与抑制翻译和促进靶mRNAs降解。 研究还表明,miRNAs在肿瘤组织的发展和进展中可能作为致癌因子或抑制物发挥作用( 10 ). 以前的研究表明,miRNAs在肿瘤细胞的生物学过程中发挥着重要作用,包括细胞增殖、分化、迁移和侵袭( 11 , 12 ). 以前的研究也表明,某些miRNAs在肿瘤组织中高度表达,而另一些则在肿瘤组织下调( 13 , 14 ). 这些结果表明,与正常组织相比,癌组织miRNA表达谱的改变可用于PCC诊断。 对于PDAC的诊断和预后,迫切需要新的、可靠的生物标志物。 循环miRNAs已在PDAC血样中广泛分布,但只有少数研究对候选标记物进行了充分验证( 15 ). 特别是,PDAC患者血清中miRNAs的表达水平尚不清楚,其变化是否与PDAC的严重程度和临床结局相关尚不清楚。
本研究探讨了PDAC患者miRNAs表达状态与致癌进展之间的关系。 采用miRNA微阵列分析技术,对PDAC患者和非PDAC患者的血清和肿瘤组织的miRNA谱进行了研究,并确定了miRNA异常表达在PDAC中的可能作用。 共有43名患者受邀参加了长治市人民医院(中国长治)的诊所。 PDAC患者由两名独立的病理学家通过病理检查确诊。 其中,7名患者参与了miRNA微阵列分析。 为了证实miRNA微阵列的结果,还获得了43名患者的血液和手术肿瘤样本,用于逆转录定量聚合酶链反应分析。 还使用 就地 杂交。 还分析了miRNAs的表达状态与PDAC临床病理特征之间的关系。
材料和方法
学习道德 本研究符合《国际伦理宣言》,并经中国山西省人类伦理委员会和研究伦理委员会批准。 通过手术同意书,患者被告知,切除的标本由长治市人民医院保存,可用于科学研究,并将维护其隐私。
患者 本研究纳入了2009年2月至2011年1月期间在长治市人民医院就诊的43名患者(男性22名,女性23名)。 患者年龄从39岁到76岁不等,中位年龄为55岁。 中位随访时间为60.2个月(平均值±标准差,60.2±2.36个月)。 在本研究之前,没有患者接受过手术或化疗。 两名资深独立病理学家对这些标本进行了组织病理学验证,确认为PDAC。 随后,获得了肿瘤样本和匹配的正常邻近组织,这些组织在肿瘤边缘远端至少0.5 cm处被切除( 16 ).
手术后立即将活检样本分为两部分。 一个片段立即储存在−80°C下,直到核酸分离。 共制备了7份随机选择的样本和匹配的血清样本,用于miRNA微阵列分析。 其余36份样品用于miRNA检测。 43名患者的第二部分被固定在4%甲醛中2天,石蜡包埋 就地 杂交(ISH)检查。 如前所述,切割福尔马林固定的石蜡包埋组织(5µm)( 17 ),并按照制造商的方案用苏木精和伊红(H&E)染色(苏木精伊红染色试剂盒,分类号C0105;中国海门贝尤泰姆生物技术研究所)。 如前所述,根据组织病理学标准对PDAC进行分类( 18 ).
此外,在长治市人民医院进行常规健康检查的大量个体中,招募了51名年龄和性别匹配的个体作为健康对照。 对其进行处理,以采集血清样本并随后进行miRNA检测。 其中,随机选择7名个体作为正常对照,使用miRNA微阵列进行血清分析。
RNA制备和miRNA微阵列 在冰镇PBS中仔细冲洗后,将血清或组织在三唑中的冰上均质化 ® (Invitrogen;Thermo Fisher Scientific,Inc.,美国马萨诸塞州沃尔瑟姆)。 使用TRIzol分离总RNA ® 和一个miRNeasy迷你试剂盒(德国希尔登Qiagen GmbH),根据制造商的协议,该试剂盒可有效回收所有RNA物种,包括miRNAs。 使用纳米滴分光光度计(ND-1000;Nanodrop Technologies;Thermo Fisher Scientific,Inc.)测量RNA的质量和数量,如前所述通过凝胶电泳测定RNA的完整性( 19 ).
为了检测miRNAs,根据制造商的协议,使用人类microRNA微阵列试剂盒(12.0版)(安捷伦科技公司,加利福尼亚州圣克拉拉)对100 ng RNA进行标记和杂交。 采用Agilent microRNA微阵列(1.0版)进行分析。 使用安捷伦DNA微阵列扫描仪(G2505B;安捷伦科技公司)检测杂交信号,并使用安捷伦特特征提取软件(10.10.1.1版;安捷伦特科技公司)分析扫描图像。 所有数据均保存在国家生物技术信息中心基因表达综合数据库(GEO)中,可通过GEO系列登录号访问 {“类型”:“entrez-geo”,“属性”:{“文本”:“GSE57555”,“term_id”:“57555“}} GSE57555型 .
血清样品制备 PDAC患者和健康对照的血清样本在确诊后24小时内采集,并在采集后立即进行处理。 通过在4°C下以3000×g离心15分钟来分离血清,然后在−80°C下储存直到分析。
逆转录定量聚合酶链反应(RT-qPCR) 使用TRIzol从血清和组织样品中制备总RNA ® 和miRNeasy迷你套件(Qiagen GmbH)。 根据制造商的协议,使用TaqMan MicroRNA分析试剂盒(Applied Biosystems;Thermo Fisher Scientific,Inc.)中的基因特异性引物从总RNA合成cDNA。 使用应用生物系统7300序列检测系统(应用生物系统;赛默飞世尔科学公司)对miRNA进行qPCR。 根据TaqMan MicroRNA分析协议,10µl PCR体积包含0.67µl逆转录产物、1X TaqMan-Universal PCR主混合物和1µl引物和探针混合物。 根据制造商的协议,使用默认阈值设置确定阈值周期数据。 阈值周期被定义为荧光超过固定阈值的分数周期数( 20 , 21 ).
ISH公司 根据制造商的协议,本研究中ISH使用了MicroRNA ISH缓冲液和对照试剂盒(Exiqon A/S,Vedbaek,Denmark)。 如前所述,对肿瘤组织中的miR-1、miR-10b和miR-214进行ISH检测( 22 ). 简单地说,将福尔马林固定石蜡包埋的PDAC组织切割成4µm的切片并脱蜡( 23 ). 本研究中使用的miR-1、miR-10b和miR-214探针分别是对人类成熟miR-1,miR-10b和miR-244的补充。 为了进行信号检测,使用抗地高辛碱性磷酸酶Fab片段(1:800;罗氏应用科学公司,德国彭茨堡;罗氏诊断公司,德国曼海姆)作为主要抗体,并将载玻片与硝基蓝四唑/5-溴-4-氯吲哚-3-基磷酸溶液孵育(罗氏应用科技公司; 罗氏诊断有限公司)。 Nuclear Fast Red(德国斯图加特Chroma ATE公司)进行反染色。
统计分析 数值表示为平均值的平均值±标准误差。 使用重复测量方差分析和事后检验(最小显著性差异检验或Dunnett的T3)测试各组之间的差异。 使用未配对t检验比较各组之间的基线差异。 采用分类变量的双侧Fisher精确检验和χ 2 测试用于比较序数变量。 使用Spearman测试分析分级相关数据。 除非另有说明,否则P≤0.05表示存在统计学显著差异。 所有分析均使用SPSS软件(19.0版;IBM Corp.,Armonk,NY,USA)进行。
结果
PDAC患者的不同miRNA表达谱 使用≥2.0的折叠变化阈值来识别两组间差异表达的miRNA。 在两组患者的血清中,PDAC患者和健康对照组之间27个miRNA的表达水平不同,其中14个miRNA上调[ 智人 (hsa)-miR-214、hsa-miR-432、hsa-milR-875-5p、hsa-mitR-760、hsa-micR-526b、hsa-miR-10b、hsa-miR-801、hsa-miR-571、hsa-micR-302b、hse-miR-378、hsa-misR-135a、hsa-minR-520c-3p、hsa-miR-29c和hsa-miR923], 13个miRNAs下调(hsa-miR-301b、hsa-miR185、hsa-milR-144、hsa-micR-124、hsa-miR-30e、hsa-miR-200a、hsa-miR-141、hse-miR-219-5p、hsa-mitR-106b、hsa-miR-1、hsa-misR-23b、hse-miR-186和hsa-miR142-5p; ). 在两组获得的肿瘤组织中,PDAC组织与相邻正常对照组之间23个miRNA的表达水平不同,其中12个miRNA上调(hsa-miR-10b、hsa-miR-575、hsa-micR-159a、hsa-milR-644、hsa-miR-581、hsa-mitR-637、hsa-miR-935、hsa-misR-98、hsa-minR-513-3p、hsa-miR-518e、hsa-muR-382和hsa-miR 214), 11个miRNAs下调(hsa-miR-1、hsa-miR-19a、hsa-milR-381、hsa-miR-93、hsa-micR-593-3p、hsa-miR-17、hsa-mitR-101、hsa-miR-23a、hsa-micR-214、hsa-minR-653和hsa-miR 519d; ). 本研究的重点是miR-1、miR-10b和miR-214,它们在PDAC和对照组的血清和肿瘤样本中存在差异( ).
PDAC和健康对照组血清和肿瘤样本的miRNA分析。 热图确定了显著差异表达的miRNAs。 本文分析了健康对照PDAC患者配对血清和邻近正常组织PDAC患者肿瘤组织中miRNA的表达。 红色和绿色分别代表高表达和低表达。 (A) 塞拉。 (B) 肿瘤。 miR、微小RNA; 胰腺导管腺癌; hsa,智人。
PDAC和对照样品之间的差异miRNAs。 (A) 血清样本。 (B) 肿瘤样本。 该图表明,在胰腺导管腺癌和对照组之间的差异miRNA中,miR-1、miR-10b和miR-214在血清或肿瘤组织样本中是不同的。 miR、微小RNA; PDAC,胰腺导管腺癌。
miRNAs的定量分析 采用RT-qPCR方法验证芯片结果。 miR-1、miR-10b和miR-214的表达在血清(43例PDAC患者和51例对照组)和肿瘤组织(43例患者和匹配的相邻对照组)中检测。 结果表明,与健康对照组相比,PDAC组血清中miR-1显著降低( ; P<0.05)。 与匹配的正常邻近组织相比,PDAC组肿瘤组织中miR-1的水平也降低( ; P<0.05)。 miR-10b和miR-214的定量分析进一步证实,在PDAC和对照组织之间,这些miR分别在血清和肿瘤样本中上调( ; P<0.05)。
使用RT-qPCR检测miRNA表达。 用RT-qPCR检测PDAC患者和对照组的血清和肿瘤标本中(A)miR-1、(B)miR-10b和(C)miR-214的表达水平。 结果表示为平均值的平均值±标准误差* 与对照组相比,P<0.05。 RT-qPCR、逆转录定量聚合酶链反应; miR、微小RNA; PDAC,胰腺导管腺癌。
PDAC相关miR-1异常表达 使用ISH在PDAC细胞的肿瘤组织中检测到miR-1、miR-10b和miR-214 RNA信号,在本研究中,显示阳性癌细胞>10%的病例被认为是miRNA ISH状态阳性( 22 ). ISH检测显示正常邻近组织中miR-1、miR-10b和miR-214呈阳性染色( )和PDAC组织( ). 结果显示miR-1阳性染色( ),miR-10b( )和miR-214( )PDAC肿瘤细胞的细胞质中。
PDAC和正常邻近组织中miR-1、miR-10b和miR-214的ISH阳性染色。 (A) 正常组织中miR-1的原位杂交染色。 (B) miR-10b在正常组织中的原位杂交染色。 (C) 正常组织中miR-214的ISH染色。 (D) PDAC组织中miR-1的ISH染色。 (E) PDAC组织中miR-10b的ISH染色。 (F) PDAC组织中miR-214的ISH染色。 miR-1的ISH信号在PDAC组织中较弱,但在正常邻近组织中显著。 PDAC组织中miR-10b和miR-214与正常邻近组织相比呈显著阳性染色。 放大倍数,×400。 ISH中, 就地 杂交; miR、微小RNA; PDAC,胰腺导管腺癌。
Spearman分析表明,ISH miR-1阴性状态与肿瘤大小(r=0.661,P<0.01)、淋巴结转移(r=0.399,P<0.05)和病理性肿瘤淋巴结转移分期有关( 24 )在这43个癌症样本中(r=0.327,P<0.05)( ). 在60个月(5年)的随访期内,发生了10例PDAC相关死亡,均为miR-1阴性肿瘤患者。 pTNM 1期患者的60个月生存率>92%,而pTNM III–IV期患者的生存率<10%。 随访60个月患者基于组织miR-1表达的总生存率Kaplan-Meier估计分析( ). 在整个队列中,与miR-1阴性肿瘤患者相比,miR-1阳性肿瘤患者的总生存率显著增加(82.53vs.23.25%;log-rank检验:χ 2 =21.63,P=0.00005; ).
具有miR-1和miR-214 ISH状态的PDAC患者的生存曲线(5年)。 (A) 经ISH检测miR-1阴性的PDAC患者与ISH结果阳性的患者相比,其5年生存率显著降低(*P<0.05 vs.miR-1阳性样本)。 (B) 与ISH信号阴性的患者相比,miR-214阳性ISH信号患者的生存率显著降低(*P<0.05 vs.miR-214-阴性样本)。 ISH、, 就地 杂交; miR、微小RNA; PDAC,胰腺导管腺癌。
表一。 胰腺导管腺癌组织中ISH检测到的miR-1状态与临床病理特征的相关性。
miR-1 ISH染色 临床病理特征 阴性(n=32) 阳性(n=11) 第页 秒 P值 性别 0.127 0.740000 男 17 5 女性 15 6 肿瘤大小,cm 3.348±0.44 1.251±0.34 0.661 0.000013 组织学分级 0.114 0.120000 G1 13 2 G2型 10 5 G3(G3) 9 4 淋巴结转移 0.399 0.000028 编号0 24 10 N1型 8 1 pTNM阶段 0.327 0.000542 I–II级 7 8 三 11 三 四、 14 0
结果还表明,43例肿瘤中miR-214阳性ISH染色与肿瘤大小(r=0.601,P<0.01)、组织学分级(r=0.407,P<0.01。 此外,与miR-214阳性肿瘤患者相比,miR-214-阴性肿瘤患者的总生存率增加(78.99 vs.34.86%;log-rank检验:χ 2 =11.09,P=0.00061; ). 在本研究中,未观察到miR-10b染色与淋巴结转移、pTNM分期或5年生存率相关(数据未显示)。
表二:。 胰腺导管腺癌组织中ISH检测到的miR-214状态与临床病理特征的相关性。
miR-214 ISH染色 临床病理特征 阴性(n=9) 正(n)=34 第页 秒 P值 性别 0.102 0.4900000 男 4 15 女性 5 19 肿瘤大小,cm 1.882±0.24 3.118±0.52 0.601 0.0000008 组织学分级 0.407 0.0000015 G1号 5 4 G2级 三 17 G3(G3) 1 13 淋巴结转移 0.532 0.0000001 编号0 7 6 N1型 2 28 pTNM阶段 0.327 0.000042 I–II级 7 5 三 2 16 四、 0 13
讨论 本研究结果显示,无论是在血清中还是在肿瘤样本中,健康对照组和PDAC患者的miRNA表达谱存在差异。 在PDAC患者组的血清中,27个miRNA的表达水平与健康对照组不同,其中14个miRNA上调,另外13个miRNA下调。 在PDAC患者的肿瘤组织中,23个miRNA的表达水平与邻近正常组织不同,其中12个miRNA上调,其余11个miRNA下调。 特别是,微阵列分析结果显示,与血清样本或肿瘤组织相比,PDAC组中miR-1、miR-10b和miR-214的表达存在显著差异。 RT-qPCR的数据证实了miR-10b和miR-214的上调,以及miR-1在血清或肿瘤样本中的下调。 这些结果表明,PDAC组织中miR-1和miR-214的失调与PDAC患者的临床病理特征和生存率有关。
有证据表明,miRNA的表达似乎是细胞类型和疾病特异性的,并可能用于某些癌症组织类型的分类,与目前大多数可用的生物标记物不同( 25 ). 随后的研究表明,各种miRNAs在PCC中异常表达,并且这些异常表达模式能够准确区分PCC与良性胰腺组织( 26 , 27 ). 本研究结果表明,与正常对照组相比,PDAC患者的血清和肿瘤组织中有几种miRNAs表达异常,这表明它们在PDAC的发病过程中具有潜在作用。
本研究的结果还证实,PDAC患者血清和肿瘤组织样本中miR-1的下调与这些患者的临床病理特征有关。 miR-1在各种癌症中的致癌作用已得到证实。 朱和王( 28 )提示临床骨肉瘤(OS)肿瘤组织中miR-1经常降低,并参与(−)-表没食子儿茶素-3-没食子酸诱导的抗癌作用( 28 ). 另一项研究表明,miR-1通过靶向凋亡蛋白重复表达蛋白1杆状病毒抑制剂对结肠癌的增殖起负调控作用( 29 ). 先前的数据还表明,下调的miR-1是:i)与结肠癌途径相关,与细胞或趋化因子表达相关( 30 ); ii)通过结合靶基因LIM和Src同源性3蛋白1和转导蛋白2与食管鳞癌淋巴结受累、组织学分类和血管浸润相关( 31 ); 和iii)与人类乳腺癌侵袭性表型相关( 17 ). 下调的hsa-miR-1与乳腺癌的侵袭性呈负相关( 32 , 33 ). 一项功能研究表明,肾癌细胞中miR-1的强制过表达抑制了增殖和转移 在体外 和 体内 ( 34 ). 先前的研究还表明,miR-1抑制剂显著减少PCC内皮细胞的迁移,但不减少增殖( 35 ). 本研究结果证实了miR-1在PDAC发病过程中的抑癌作用。
在血清和肿瘤样本中的两个上调的miRNAs中,miR-214先前已被确定与小鼠胰腺发育有关( 36 ). 本研究表明,miR-214在PDAC患者中上调,并与肿瘤大小、组织学分级、pTNM分期、淋巴结转移和PDAC患者的总生存率(5年)相关。 以前有人认为miR-214参与了小鼠的衰老过程( 37 )它通过调节刺猬信号来确定肌肉细胞的命运( 38 )靶向磷酸酶和张力蛋白同源物诱导卵巢癌细胞存活和顺铂耐药( 38 )负调控HeLa细胞增殖,提高T细胞的存活率和活性( 39 , 40 ). 先前的一项研究表明,miR-214在不同类型的癌症中起致癌基因或抑癌基因的作用( 41 ). 还发现,与匹配的正常组织相比,胃癌组织中miR-214的表达水平上调,miR-214的表达水平与临床进展和不良预后显著相关( 42 ). 此外,与匹配的良性胰腺组织相比,PCC组织中miR-214的表达增加,并且miR-215的过度表达通过靶向生长家族成员4 mRNA抑制剂降低了PCC细胞对吉西他滨(GEM)的敏感性( 43 ). 研究还表明,miR-214可提高PCC细胞的存活率和GEM耐药性,这可能与PCC患者对化疗的不良反应有关( 41 ). 结合本研究的结果,先前关于miR-214抑癌作用的数据得到了证实。 本研究结果表明,miR-214作为一种负调控因子,其失调与PDAC患者的临床病理特征和预后指标有关。 此外,miR-10b在胶质瘤和转移性PCC中的表达增加( 44 , 45 ). 值得注意的是,胃癌、非小细胞肺癌和转移性乳腺癌患者血清miR-10b水平升高( 46 , 47 ),这也在本研究中观察到,并表明其在PDAC中的致癌作用。
总之,微阵列分析结果显示,PDAC血清或肿瘤组织样本中的miR-1、miR-10b和miR-214显著改变。 RT-qPCR数据证实了血清和肿瘤样本中miR-1、miR-10b和miR-214的失调。 分析表明,PDAC组织中miR-1和miR-214的失调与PDAC患者的临床病理特征和5年生存率有关。 本研究的结果确定了有用的标记物miR-1和miR-214,用于通过无创方法确定PDAC患者的预后。
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