|
状态 |
2018年5月1日公开 |
标题 |
KAMX-WT3型 |
样品类型 |
SRA公司 |
|
|
源名称 |
Lin-BM祖细胞(HSPC)
|
有机体 |
小家鼠 |
特点 |
电池类型:C57BL/6 基因型:UTX_WT 菌株:C57BL/6
|
提取的分子 |
基因组DNA |
提取协议 |
使用Lineage Cell Depletion Kit(Miltenyi Biotec,目录号130-090-858)从骨髓中提取HSPC,使用Nextera标记主混合物(Illumina FC-121-1030)裂解细胞并进行标记 使用FC-121-1030 Nextra®DNA样本制备试剂盒和FC-121-1011 Nextera®索引试剂盒准备ATAC-Seq文库进行测序
|
|
|
图书馆战略 |
其他 |
库源 |
基因组学 |
库选择 |
其他 |
仪器型号 |
Illumina HiSeq 2000公司 |
|
|
数据处理 |
使用MACS2调用峰值,并使用P值10e-11作为截止值 基因组构建:mm10 补充文件_format_and_content:原始文件、已处理文件、峰值文件分别为BAM、bigwig和bed格式
|
|
|
提交日期 |
2016年9月6日 |
上次更新日期 |
2019年5月15日 |
联系人姓名 |
布赖恩·亨特利 |
电子邮件 |
bjph2@cam.ac.uk
|
组织名称 |
剑桥大学
|
部门 |
血液学系
|
街道地址 |
Hills路
|
西蒂 |
剑桥 |
邮政编码 |
CB2 0AW型 |
国家 |
大不列颠联合王国 |
|
|
平台ID |
GPL13112型 |
系列(2) |
GSE86489型 |
UTX介导的染色质重塑通过ETS和GATA转录程序的非催化逆调控抑制髓系白血病的发生(ATAC-Seq) |
GSE86490型 |
UTX介导的增强子和染色质重塑通过ETS和GATA程序的非催化逆调节抑制髓系白血病的发生 |
|
关系 |
生物样本 |
SAMN05733177号 |
SRA公司 |
SRX2141221型 |