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状态 |
2018年5月1日公开 |
标题 |
输出x输入A |
样品类型 |
SRA公司 |
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来源名称 |
Lin-BM祖细胞(HSPC)
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有机体 |
小家鼠 |
特点 |
电池类型:C57BL/6 基因型:UTX WT 菌株:C57BL/6 芯片抗体:无
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提取的分子 |
基因组DNA |
提取协议 |
使用Lineage Cell Depletion Kit(Miltenyi Biotec,cat.no.130-090-858)从骨髓中提取HSPC,从声波核中澄清裂解产物,并用抗体分离组蛋白-DNA复合物。 使用标准Illumina协议准备ChIP-Seq文库进行测序
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图书馆战略 |
ChIP-Seq公司 |
库源 |
基因组学 |
库选择 |
炸薯条 |
仪器型号 |
Illumina HiSeq 2000公司 |
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数据处理 |
在10e-08截止时使用SICER调用峰值 基因组构建:mm10 补充文件_format_and_content:原始文件、已处理文件、峰值文件分别为BAM、bigwig和bed格式
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提交日期 |
2016年9月6日 |
上次更新日期 |
2019年5月15日 |
联系人姓名 |
布赖恩·亨特利 |
电子邮件 |
bjph2@cam.ac.uk
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组织名称 |
剑桥大学
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部门 |
血液学系
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街道地址 |
Hills路
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西蒂 |
剑桥 |
邮政编码 |
CB2 0AW型 |
国家 |
大不列颠联合王国 |
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平台ID |
gpl3112型 |
系列(2) |
86488克 |
UTX介导的染色质重塑通过ETS和GATA转录程序的非催化逆调控抑制髓系白血病的发生(ChIP-Seq) |
GSE86490型 |
UTX介导的增强子和染色质重塑通过ETS和GATA程序的非催化逆调节抑制髓系白血病的发生 |
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关系 |
生物样品 |
SAMN05733180标准 |
SRA公司 |
SRX2141218型 |