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样品GSM2304471 GSM2304471的查询数据集
状态 2018年5月1日公开
标题 KAMX52-KO1-H3K27Me3型
样品类型 SRA公司
 
来源名称 Lin-BM祖细胞(HSPC)
有机体 小家鼠
特点 电池类型:C57BL/6
基因型:UTX KO
菌株:C57BL/6
芯片抗体:H3K27Me3(Abcam,#Ab6002)
提取的分子 基因组DNA
提取协议 使用Lineage Cell Depletion Kit(Miltenyi Biotec,cat.no.130-090-858)从骨髓中提取HSPC,从声波核中澄清裂解产物,并用抗体分离组蛋白-DNA复合物。
使用标准Illumina协议准备ChIP-Seq文库进行测序
 
图书馆战略 ChIP-Seq公司
库源 基因组学
库选择 炸薯条
仪器型号 Illumina HiSeq 2000公司
 
数据处理 在10e-08截止时使用SICER调用峰值
基因组构建:mm10
补充文件_format_and_content:原始文件、已处理文件、峰值文件分别为BAM、bigwig和bed格式
 
提交日期 2016年9月6日
上次更新日期 2019年5月15日
联系人姓名 布赖恩·亨特利
电子邮件 bjph2@cam.ac.uk
组织名称 剑桥大学
部门 血液学系
街道地址 Hills路
西蒂 剑桥
邮政编码 CB2 0AW型
国家 大不列颠联合王国
 
平台ID gpl3112型
系列(2)
86488克 UTX介导的染色质重塑通过ETS和GATA转录程序的非催化逆调控抑制髓系白血病的发生(ChIP-Seq)
GSE86490型 UTX介导的增强子和染色质重塑通过ETS和GATA程序的非催化逆调节抑制髓系白血病的发生
关系
生物样品 SAMN05733171号
SRA公司 SRX2141207型

补充文件 大小 下载 文件类型/资源
GSM2304471_KAM52-KO1-H3K27me3.bed.gz 137.5千桶 (英尺/平方英尺)(http)
GSM2304471_KAMX52-KO1-H3K27Me3.bw 199.8兆 (英尺/平方英尺)(http) BW公司
SRA运行选择器帮助
SRA中有原始数据
作为补充文件提供的处理数据

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