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| 状态 |
2007年8月6日公开 |
| 标题 |
DND41第3天凌晨1点MRK-003 |
| 样品类型 |
核糖核酸 |
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| 通道1 |
| 源名称 |
DND41第3天DMSO
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| 有机体 |
智人 |
| 特点 |
T-ALL细胞系
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| 治疗方案 |
T-ALL细胞系以每毫升5e4-1.5e5细胞的密度进行培养（取决于加倍时间），并用1uM MRK-003处理3天。
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| 生长方案 |
T-ALL细胞系以每毫升5e4-1.5e5细胞的密度进行培养（取决于加倍时间），并用1uM MRK-003处理3天。
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| 提取的分子 |
总核糖核酸 |
| 提取协议 |
经DNAse处理的Qiagen RNeasy自旋柱
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| 标签 |
Cy3（Cy3）
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| 标签协议 |
Ambion氨基烯丙基MessageAmp II试剂盒的定制自动化版本。
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| 频道2 |
| 源名称 |
DND41第3天凌晨1点MRK-003
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| 有机体 |
智人 |
| 特点 |
T-ALL细胞系
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| 治疗方案 |
T-ALL细胞系以每毫升5e4-1.5e5细胞的密度进行培养（取决于加倍时间），并用1uM MRK-003处理3天。
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| 生长方案 |
T-ALL细胞系以每毫升5e4-1.5e5细胞的密度进行培养（取决于加倍时间），并用1uM MRK-003处理3天。
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| 提取的分子 |
总核糖核酸 |
| 提取协议 |
经DNAse处理的Qiagen RNeasy自旋柱
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| 标签 |
Cy5细胞
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| 标签协议 |
Ambion氨基烯丙基MessageAmp II试剂盒的定制自动化版本。
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| 杂交协议 |
微阵列在旋转转盘中在40°C下孵育48小时。与定制安捷伦微阵列的杂交如前所述完成（Hughes等人Nat Biotech（2001），19（4）:342-7）。清洗微阵列以去除非特异性杂交样品。然后，在无臭氧氮室中干燥微阵列。
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| 扫描协议 |
使用安捷伦LP2激光扫描仪扫描微阵列。扫描仪输出是一个Tiff文件，其中包含来自每个微阵列的定量杂交数据。然后使用Rosetta自定义特征提取软件处理Tiff文件。
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| 描述 |
T-ALL细胞系
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| 数据处理 |
使用Rosetta Resolver®系统处理数据。Rosetta的自定义特征提取软件在数据加载到Resolver系统之前执行错误建模。Resolver系统执行挤压操作，在应用错误权重的同时，将相同序列的副本组合在一个数组中。误差加权包括对加性噪声和乘性噪声的调整。生成P值并在整个系统中传播。P值表示基因表达的概率。Resolver系统允许用户设置阈值，低于该阈值时，视为P值基因显著表达。Resolver系统还使用压缩过程组合多个阵列。如果多个点引用一个序列，则使用Roland Stoughton和Hongyue Dai《细胞表达谱的统计组合》中描述的误差加权平均值进行汇总。美国专利号63517122002年2月26日。
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| 提交日期 |
2007年7月6日 |
| 上次更新日期 |
2011年8月14日 |
| 联系人姓名 |
奥利维娅·方 |
| 电子邮件 |
olivia.fong@merck.com
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| 组织名称 |
默克公司。
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| 部门 |
分子剖析
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| 门诊化验室 |
默克研究实验室
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| 街道地址 |
邮政信箱2000
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| 西蒂 |
拉威 |
| 省/自治区 |
新泽西州 |
| 邮政编码 |
07065 |
| 国家 |
美国 |
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| 平台ID |
GPL4372标准 |
| 系列（1） |
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