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GSE86489系列 GSE86489的查询数据集
状态 2018年5月1日公开
标题 UTX介导的染色质重塑通过ETS和GATA转录程序的非催化逆调控抑制髓系白血病的发生(ATAC-Seq)
有机体 小家鼠
实验类型 高通量测序的基因组结合/占有率分析
总结 H3K27赖氨酸特异性去甲基酶UTX是多种癌症中功能丧失突变的靶点。在这里,我们证明UTX通过非催化功能抑制髓系白血病的发生,这一特性与其催化不活跃的Y染色体副序列UTY相同。与此相一致,我们证明了多种人类癌症中UTX和UTY的伴随缺失/突变。从机制上讲,全球基因组分析显示H3K27Me3仅发生微小变化,但H3K27 Ac和染色质可及性发生显著双向变化,ETS和GATA因子结合发生变化,Utx缺失后基因表达发生改变。通过整合蛋白质组学和基因组分析,我们将这些变化与ATP依赖的染色质重塑的UTX协调以及UTX和ETS因子在关键DNA序列上结合的竞争联系起来。总之,我们的发现揭示了UTX通过抑制致癌ETS和上调抑瘤GATA程序在抑制急性髓性白血病中的双重作用。我们认为,组织特异性致癌和抑瘤转录程序的同等变化在其他UTX突变癌症中起作用。
 
总体设计 两种组蛋白修饰(H3K27me3和H3K27 Ac)的ChIP-Seq分析和ATAC-Seq-组蛋白脱甲基酶UTX(UTX-/-)缺陷小鼠与野生型(UTX+/+)小鼠之间的比较。
 
贡献者 亨特利B瓦西里奥G
引文 29736013
提交日期 2016年9月6日
上次更新日期 2019年5月15日
联系人姓名 布赖恩·亨特利
电子邮件 bjph2@cam.ac.uk
组织名称 剑桥大学
部门 血液学系
街道地址 Hills路
西蒂 剑桥
邮政编码 CB2 0AW型
国家 大不列颠联合王国
 
平台(1)
GPL13112型 Illumina HiSeq 2000(小家鼠)
样品(6)
GSM2304483标准 KAMX-WT1型
GSM2304484标准 KAMX-WT2型
GSM2304485克 KAMX-WT3型
此子系列是超级系列的一部分:
GSE86490型 UTX介导的增强子和染色质重塑通过ETS和GATA程序的非催化逆调节抑制髓系白血病的发生
关系
生物项目 PRJNA342032型
SRA公司 SRP086850型

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