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状态 |
2018年5月1日公开 |
标题 |
UTX介导的染色质重塑通过ETS和GATA转录程序的非催化逆调控抑制髓系白血病的发生(ATAC-Seq) |
有机体 |
小家鼠 |
实验类型 |
高通量测序的基因组结合/占有率分析
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总结 |
H3K27赖氨酸特异性去甲基酶UTX是多种癌症中功能丧失突变的靶点。在这里,我们证明UTX通过非催化功能抑制髓系白血病的发生,这一特性与其催化不活跃的Y染色体副序列UTY相同。与此相一致,我们证明了多种人类癌症中UTX和UTY的伴随缺失/突变。从机制上讲,全球基因组分析显示H3K27Me3仅发生微小变化,但H3K27 Ac和染色质可及性发生显著双向变化,ETS和GATA因子结合发生变化,Utx缺失后基因表达发生改变。通过整合蛋白质组学和基因组分析,我们将这些变化与ATP依赖的染色质重塑的UTX协调以及UTX和ETS因子在关键DNA序列上结合的竞争联系起来。总之,我们的发现揭示了UTX通过抑制致癌ETS和上调抑瘤GATA程序在抑制急性髓性白血病中的双重作用。我们认为,组织特异性致癌和抑瘤转录程序的同等变化在其他UTX突变癌症中起作用。
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总体设计 |
两种组蛋白修饰(H3K27me3和H3K27 Ac)的ChIP-Seq分析和ATAC-Seq-组蛋白脱甲基酶UTX(UTX-/-)缺陷小鼠与野生型(UTX+/+)小鼠之间的比较。
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贡献者 |
亨特利B,瓦西里奥G |
引文 |
29736013 |
提交日期 |
2016年9月6日 |
上次更新日期 |
2019年5月15日 |
联系人姓名 |
布赖恩·亨特利 |
电子邮件 |
bjph2@cam.ac.uk
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组织名称 |
剑桥大学
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部门 |
血液学系
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街道地址 |
Hills路
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西蒂 |
剑桥 |
邮政编码 |
CB2 0AW型 |
国家 |
大不列颠联合王国 |
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平台(1) |
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样品(6)
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此子系列是超级系列的一部分: |
GSE86490型 |
UTX介导的增强子和染色质重塑通过ETS和GATA程序的非催化逆调节抑制髓系白血病的发生 |
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关系 |
生物项目 |
PRJNA342032型 |
SRA公司 |
SRP086850型 |