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    • 显示当前项目。

    卢比2复制蛋白A2[肌肉(家鼠)]

    基因ID:19891,更新日期2024年6月6日

    总结

    官方符号
    卢比2由提供MGI公司
    官方全名
    复制蛋白A2由提供MGI公司
    主要来源
    管理机构:管理机构:1339939
    请参阅相关
    乐团:ENSMUSG00000028884 联盟基因组:MGI:1339939
    基因类型
    蛋白质编码
    RefSeq状态
    已验证
    有机体
    肌肉
    血统
    真核生物;后生动物;脊索动物;克兰亚塔;脊椎动物;真造口术;哺乳动物;Eutheria;尤阿古托格利尔斯;闪光;啮齿动物;肌形态;鼠形目;鼠科;穆里奈;穆斯;穆斯
    也称为
    RPA34;射频-A2
    总结
    启用DNA结合活性。预计参与多个过程,包括DNA代谢过程;有丝分裂G1 DNA损伤检查点信号;和调节对DNA损伤刺激的反应。预测作用于细胞对DNA损伤刺激反应的上游或内部。预测位于PML体和染色质中。预测为DNA复制因子A复合体的一部分。预测在染色体、端粒区域有活性;细胞核;以及双绞线断裂的位置。在胚泡中表达;脑;致密桑椹;和精母细胞。与人类RPA2同源(复制蛋白A2)。【由基因组资源联盟提供,2022年4月】
    表达式
    在肝脏E14(RPKM 35.0)、肝脏E14.5(RPKM32.2)和27个其他组织中广泛表达查看更多
    直系同源
    新款
    尝试新的基因表
    尝试新的成绩单表

    基因组背景

    参见中的Rpa2基因组数据查看器
    位置:
    4 D2.3;4 65.88立方厘米
    外显子计数:
    9
    注释发布 状态 装配 Chr公司 位置
    RS_2024_02号 现在的 GRCm39型(合同通用条款000001635.27) 4 NC_000070.7(132495671..132506057)
    108.20200622 上一个程序集 GRC第38页第6页(GCF_000001635.26号) 4 NC_000070.6(132768360..132778746)

    4号染色体-NC_000070.7描述相邻基因的基因组上下文 Neighboring gene STARR-positive B cell enhancer ABC_E9241 Neighboring gene X-linked Kx blood group related 8 Neighboring gene sphingomyelin phosphodiesterase, acid-like 3B Neighboring gene STARR-positive B cell enhancer ABC_E426 Neighboring gene STARR-positive B cell enhancer ABC_E6229 Neighboring gene thymocyte selection associated family member 2 Neighboring gene STARR-positive B cell enhancer ABC_E2125 Neighboring gene STARR-positive B cell enhancer ABC_E4675 Neighboring gene STARR-positive B cell enhancer ABC_E3521 Neighboring gene protein phosphatase 1, regulatory subunit 8 Neighboring gene predicted gene, 22767

    基因组区域、转录物和产物

    表达式

    • 项目名称:鼠标ENCODE转录组数据
    • 描述:鼠标ENCODE项目生成的RNA分析数据集。
    • 生物项目:PRJNA66167型
    • 出版物:PMID 25409824
    • 分析日期:无

    变更

    等位基因

    这类等位基因在《小鼠基因组信息学》上有记载(MGI)
    • 核酸内切酶介导(1)

    PubChem的途径

    互动

    产品 交互作用剂 其他基因 复杂 来源 酒吧 描述

    一般基因信息

    标记

    基因本体论 由MGI提供

    过程 证据代码 酒吧
    acts_upstream_of_or_within DNA损伤响应 国际能源署
    从电子注释推断
    更多信息
     
    acts_upstream_of_of_winDNA重组 国际能源署
    从电子注释推断
    更多信息
     
    参与DNA重组 国际能源署
    从电子注释推断
    更多信息
     
    acts_upstream_of_or_in-DNA修复 国际能源署
    从电子注释推断
    更多信息
     
    参与DNA修复 国际能源署
    从电子注释推断
    更多信息
     
    参与DNA复制 国际律师协会
    从祖先的生物学角度推断
    更多信息
     
    参与DNA复制 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    涉及基础切口维修 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    同源重组参与双链断裂修复 国际律师协会
    从祖先的生物学角度推断
    更多信息
     
    同源重组参与双链断裂修复 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    involved_in不匹配修复 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    参与有丝分裂G1 DNA损伤检查点信号 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    涉及核苷酸切除修复 国际律师协会
    从祖先的生物学角度推断
    更多信息
     
    参与核苷酸切除修复 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    参与蛋白在染色体上的定位 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    参与DNA损伤检查点的调控 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    同源重组参与双链断裂修复的调控 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    参与端粒维持 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     

    一般蛋白质信息

    首选名称
    复制蛋白A 32kDa亚基
    姓名
    30-kDa蛋白质
    RF-A蛋白2
    RP-A第32页
    RP-A第34页
    复制因子A蛋白2
    复制蛋白A 34kDa亚基

    NCBI参考序列(RefSeq)

    新款 尝试新的成绩单表

    独立于注释的RefSeq维护基因组

    这些参考序列独立于基因组构建而存在。解释

    这些参考序列与基因组无关注释循环,因此其版本可能与当前的RefSeq版本不匹配基因组构建。通过比较中RefSeq的版本来确定版本不匹配本节至中报告的那一节基因组区域,成绩单和产品以上。

    mRNA和蛋白质

    1. NM_001429787.1NP_001416716.1复制蛋白A 32kDa亚基亚型2

      状态:已验证

      源序列
      AL627130型
      UniProtKB/TrEMBL公司
      Q99KL9型
    2. NM_011284.4号NP_035414.3号复制蛋白A 32kDa亚基亚型1

      参见NP_035414.3的相同蛋白质及其注释位置

      状态:已验证

      源序列
      AL627130型
      共识CDS
      CCDS18734.1号
      UniProtKB/Swiss-Prot公司
      Q3TE40型,Q62193问题
      UniProtKB/TrEMBL公司
      Q99KL9型
      相关的
      ENSMUSP00000099621.5,ENSMUST00000102561.11号
      保守领域(3)总结
      COG5235公司
      位置:6267
      RFA2;单品牌DNA-结合复制蛋白A(RPA),培养基(30 kD)亚单位[DNA复制、重组和修复]
      cd04478
      位置:73167
      RPA2_DBD_D;RPA2_DBD_D:与人类RPA2(也称为RPA32)的中央ssDNA-结合域(DBD)-D的OB折叠相对应的OB褶皱亚家族。RPA2是复制蛋白a(RPA)的一个亚单位。RPA是一种核ssDNA结合蛋白(SSB),出现于。。。
      pfam08784型
      位置:166262
      RPA_C;复制蛋白A C末端

    注释基因组的参考序列:GCF_000001635.27-RS_2024_02

    以下部分包含属于特定基因组构建。解释

    参考GRCm39 C57BL/6J

    基因组学

    1. NC_000070.7参考GRCm39 C57BL/6J

      范围
      132495671..132506057
      下载
      GenBank(基因银行),美国金融服务贸易协会,序列查看器(图形)