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    编号3NMD3核糖体输出适配器[小家鼠（家鼠）]

    基因ID:97112，更新日期2024年3月5日

    总结

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    官方符号
    编号3由提供MGI公司
    官方全名
    NMD3核糖体输出适配器由提供MGI公司
    主要来源
    MGI:MGI:2140103
    请参阅相关
    乐团：ENSMUSG00000027787 联盟基因组：MGI:2140103
    基因类型
    蛋白质编码
    RefSeq状态
    已验证
    有机体
    小家鼠
    血统
    真核生物；后生动物；脊索动物；克兰亚塔；脊椎动物；真造口术；哺乳动物；Eutheria；尤阿古托格利尔斯；闪光；啮齿动物；肌形态；鼠形目；鼠科；穆里奈；穆斯；穆斯
    总结
    预计可启用蛋白质大分子适配器活性和核糖体大亚单位结合活性。预测参与几个过程，包括蛋白质结合活性的正向调节；蛋白质核仁定位的正调控；核糖体大亚基从细胞核输出。预计作用于蛋白质转运的上游或内部。预测位于核仁和核质中。预计在细胞质和细胞核中活跃。与人类NMD3同源（NMD3核糖体输出适配器）。【由基因组资源联盟提供，2022年4月】
    表达式
    在成人胎盘（RPKM 13.4）、CNS E11.5（RPKM10.0）和28个其他组织中普遍表达查看更多
    直系同源
    人类 全部的
    新款
    尝试新的基因表
    尝试新的成绩单表

    基因组背景

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    请参阅中的Nmd3基因组数据查看器
    地点：
    3 E1-E2；3 32.25立方厘米
    外显子计数：
    16
    注释发布 状态 装配 氯代甲烷 位置
    RS_2024_02号 现在的 GRC立方米39(GCF_000001635.27号) 三 NC_000069.7（69629354..69656380）
    108.20200622 上一个程序集 GRCm38.p6型(GCF_000001635.26号) 三 NC_000069.6（69722055..69749047）

    3号染色体-NC_000069.7描述邻近基因的基因组背景 Neighboring gene predicted gene, 57714 Neighboring gene STARR-seq mESC enhancer starr_07930 Neighboring gene STARR-positive B cell enhancer ABC_E9552 Neighboring gene ribosomal protein L32, pseudogene Neighboring gene predicted gene, 52662 Neighboring gene STARR-seq mESC enhancer starr_07931 Neighboring gene ribosome production factor 2 homolog pseudogene Neighboring gene serine palmitoyltransferase, small subunit B Neighboring gene predicted gene, 52608

    基因组区域、转录物和产物

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    表达式

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    • 项目名称：鼠标ENCODE转录组数据
    • 描述：鼠标ENCODE项目生成的RNA分析数据集。
    • 生物项目：PRJNA66167型
    • 出版物：邮编25409824
    • 分析日期：无

    参考文献

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    PubMed中的相关文章

    1. 通过功能方法鉴定蛋白质相互作用域的配体。 克拉·G，等《分子细胞蛋白质组学》，2007年2月，PMID 17124247
    2. 使用类亲和素蛋白Tamavidin 2-REV对生物素化位点进行BioID筛选，确定干扰素基因刺激物（STING）的全球相互作用物。 莫塔尼·K，等生物化学杂志，2020年8月7日。PMID 32554809，免费PMC文章
    3. ALS相关的细胞周期蛋白F功能丧失影响HSP90。 西伯特A，等生命科学联盟，2022年9月16日。PMID 36114006，免费PMC文章
    4. EUCOMM——欧洲条件小鼠诱变计划。 弗里德尔RH，等《功能基因组蛋白质组简介》，2007年9月，PMID 17967808
    5. 用于小鼠基因组功能分析的大规模基因驱动突变方法。 汉森J，等美国国家科学院院刊，2003年8月19日。PMID 12904583，免费PMC文章

    查看PubMed中的所有（22）引文

    GeneRIFs：功能的基因引用

    互动

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    产品 交互作用者 其他基因 复杂 来源 酒吧 描述

    一般基因信息

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    标记

    同源性

    基因本体论 由MGI提供

    功能 证据代码 酒吧
    激活蛋白质-大分子适配器活性 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
    		  
    使核糖体大亚单位结合 国际律师协会
    从祖先的生物学角度推断
    更多信息
    		  
    使核糖体大亚单位结合 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
    		  
    过程 证据代码 酒吧
    参与RNA生物合成过程的正调控 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
    		  
    参与蛋白质结合的正调控 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
    		  
    参与蛋白在核仁中定位的正调控 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
    		  
    蛋白质转运中的上游作用 国际能源署
    从电子注释推断
    更多信息
    		  
    核糖体大亚基核输出的参与 国际律师协会
    从祖先的生物学角度推断
    更多信息
    		  
    核糖体大亚基从细胞核输出的上游或内部acts 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
    		  
    核糖体大亚基核输出的参与 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
    		  
    组件 证据代码 酒吧
    细胞质中有活性 国际律师协会
    从祖先的生物学角度推断
    更多信息
    		  
    位于细胞质中 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
    		  
    核仁定位 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
    		  
    核质定位 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
    		  
    在核心中是活动的 国际律师协会
    从祖先的生物学角度推断
    更多信息
    		  
    位于核内 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
    		  

    一般蛋白质信息

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    首选名称
    60S核糖体输出蛋白NMD3
    姓名
    NMD3同源物

    NCBI参考序列（RefSeq）

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    新款 尝试新的成绩单表

    独立于注释维护的参考序列基因组

    这些参考序列独立于基因组构建而存在。解释

    这些参考序列与基因组无关注释循环，因此它们的版本可能与当前的RefSeq版本不匹配基因组构建。通过比较中RefSeq的版本来确定版本不匹配本节至中报告的那一节基因组区域，成绩单和产品以上。

    mRNA和蛋白质

    1. NM_00141121.1号→NP_001398141.1号60S核糖体输出蛋白NMD3亚型2

      状态：已验证

      源序列
      AC115035、AC162790

    2. NM_001411213.1号→NP_001398142.1号60S核糖体输出蛋白NMD3亚型3

      状态：已验证

      源序列
      AC115035、AC162790

    3. NM_001411214.1号→NP_001398143.160S核糖体输出蛋白NMD3亚型4

      状态：已验证

      源序列
      AC115035、AC162790

    4. 纳米_001411215.1→NP_001398144.160S核糖体输出蛋白NMD3亚型5

      状态：已验证

      源序列
      AC115035、AC162790

    5. NM_001411216.1号→NP_001398145.160S核糖体输出蛋白NMD3亚型6

      状态：已验证

      源序列
      AC115035、AC162790

    6. NM_001411217.1号→NP_001398146.1型60S核糖体输出蛋白NMD3亚型6

      状态：已验证

      源序列
      AC115035、AC162790

    7. NM_001411218.1号→NP_001398147.1型60S核糖体输出蛋白NMD3亚型6

      状态：已验证

      源序列
      AC115035、AC162790

    8. NM_00141121.9号→NP_001398148.160S核糖体输出蛋白NMD3亚型6

      状态：已验证

      源序列
      AC115035、AC162790

    9. NM_00141120.1号→NP_001398149.1号60S核糖体输出蛋白NMD3亚型6

      状态：已验证

      源序列
      AC115035、AC162790

    10. NM_001411221.1号→NP_001398150.1号60S核糖体输出蛋白NMD3亚型6

      状态：已验证

      源序列
      AC115035、AC162790

    11. NM_001411222.1号→NP_001398151.1号60S核糖体输出蛋白NMD3亚型6

      状态：已验证

      源序列
      AC115035、AC162790

    12. NM_001411223.1号→NP_001398152.160S核糖体输出蛋白NMD3亚型6

      状态：已验证

      源序列
      AC115035、AC162790

    13. NM_001411224.1号→NP_001398153.1号60S核糖体输出蛋白NMD3亚型7

      状态：已验证

      源序列
      AC115035、AC162790

    14. NM_001411225.1号→NP_001398154.160S核糖体输出蛋白NMD3亚型7

      状态：已验证

      源序列
      AC115035、AC162790

    15. NM_133787.3号→NP_598548.160S核糖体输出蛋白NMD3亚型1

      参见NP_598548.1的相同蛋白质及其注释位置

      状态：已验证

      源序列
      AC115035、AC162790
      共识CDS
      CCDS17407.1号文件
      UniProtKB/Swiss-Prot公司
      问题3UPR1，第8季度第61季度，Q99L48号
      相关的
      ENSMUSP00000029358.9，ENSMUST00000029358.15号
      保守领域（1）总结
      pfam04981型
      地点：17→246
      NMD3；NMD3系列

    注释基因组的参考序列：GCF_000001635.27-RS_2024_02

    以下部分包含属于特定基因组构建。解释

    参考GRCm39 C57BL/6J

    基因组学

    1. NC_000069.7参考GRCm39 C57BL/6J

      范围
      69629354..69656380
      下载
      GenBank（基因银行），美国金融服务贸易协会，序列查看器（图形）
    核苷酸 蛋白质 应变
    标题 访问和版本
    蛋白质接入 链接
    GenPept链接 UniProtKB链接
    Q99L48.1 GenPept公司 UniProtKB/Swiss-Prot:Q99L48

    基因链接

    以下内容链接输出资源由外部提供者提供。这些提供者负责维护链接。

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    研究材料
    工具
    其他