美国国旗

美国政府的官方网站

格式

发送至:

选择目的地

来自GEO配置文件的链接

    • 显示当前项目。

    52英尺鞭毛内运输52[小家鼠(家鼠)]

    基因ID:245866,更新于2024年5月4日

    总结

    官方符号
    52英尺由提供管理信息
    官方全名
    鞭毛内运输52由提供管理信息
    主要来源
    MGI:MGI:2387217
    参见相关内容
    乐团:ENSMUSG00000017858 联盟基因组:MGI:2387217
    基因类型
    蛋白质编码
    RefSeq状态
    已验证
    有机体
    小家鼠
    血统
    真核生物;后生动物;脊索动物;克兰亚塔;脊椎动物;真造口术;哺乳动物;Eutheria;尤阿古托格利尔斯;闪光;啮齿动物;肌形态;鼠形目;鼠科;穆里奈;穆斯;穆斯
    也称为
    NGD5型
    总结
    作用于几个过程的上游或内部,包括胚胎形态发生;非活动纤毛组件;畅通信号通路。位于几个细胞成分中,包括睫状体基底部;睫状体尖端;微管组织中心。部分髂内转运颗粒B。该基因的人类同源基因与窒息性胸肌营养不良有关。与人IFT52同源(鞭毛内运输52)。【由基因组资源联盟提供,2022年4月】
    表达式
    在成人睾丸(RPKM 14.3)、成人膀胱(RPKM14.2)和28个其他组织中普遍表达查看更多
    直系同源
    新的
    尝试新的基因表
    尝试新的成绩单

    基因组背景

    参见中的Ift52基因组数据查看器
    位置:
    2; 2氢气
    外显子计数:
    13
    注释发布 状态 装配 Chr公司 位置
    RS_2024_02号 现在的 GRCm39型(GCF_000001635.27号) 2 NC_000068.8(162859200..162888075)
    108.20200622 上一个程序集 GRCm38.p6型(GCF_000001635.26号) 2 NC_000068.7(163017117..163046155)

    染色体2-NC_000068.8描述邻近基因的基因组背景 Neighboring gene glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase pseudogene Neighboring gene serum/glucocorticoid regulated kinase 2 Neighboring gene STARR-seq mESC enhancer starr_06293 Neighboring gene STARR-seq mESC enhancer starr_06295 Neighboring gene STARR-positive B cell enhancer ABC_E6013 Neighboring gene myeloblastosis oncogene-like 2 Neighboring gene STARR-seq mESC enhancer starr_06298 Neighboring gene microRNA 7003 Neighboring gene gametocyte specific factor 1-like

    基因组区域、转录物和产物

    表达式

    • 项目名称:小鼠ENCODE转录组数据
    • 描述:鼠标ENCODE项目生成的RNA分析数据集。
    • 生物项目:PRJNA66167型
    • 出版物:PMID 25409824
    • 分析日期:无

    变更

    等位基因

    这类等位基因在《小鼠基因组信息学》上有记载(MGI)
    • 核酸内切酶介导(4)
    • 转基因(1)

    PubChem的途径

    互动

    产品 交互作用剂 其他基因 复杂 来源 酒吧 描述

    一般基因信息

    标记

    克隆名称

    • MGC47065型

    基因本体论 由MGI提供

    功能 证据代码 酒吧
    实现蛋白质结合 IPI公司
    从物理相互作用推断
    更多信息
    公共医学 
    过程 证据代码 酒吧
    acts_upstream_of_or或在单元投影组织内 国际能源署
    从电子注释推断
    更多信息
     
    卷入纤毛组件 国际律师协会
    从祖先的生物学角度推断
    更多信息
     
    卷入纤毛组件 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    卷入纤毛组件 北美
    不可追踪的作者声明
    更多信息
    公共医学 
    acts_upstream_of_or左右对称性测定范围内 进口
    根据突变表型推断
    更多信息
    公共医学 
    acts_upstream_of_of_或_在背侧/腹侧模式形成中 进口
    根据突变表型推断
    更多信息
    公共医学 
    acts上游of或胚胎手指形态发生内 进口
    根据突变表型推断
    更多信息
    公共医学 
    acts_upstream_of_or心脏循环内 进口
    根据突变表型推断
    更多信息
    公共医学 
    累及髂内顺行运输 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    累及髂内顺行运输 北美
    不可追踪的作者声明
    更多信息
    公共医学 
    累及髂内运输 国际律师协会
    从祖先的生物学角度推断
    更多信息
     
    acts_上游_of_or内运输 集成电路
    由策展人推断
    更多信息
    公共医学 
    角朊细胞增殖上游因子 进口
    根据突变表型推断
    更多信息
    公共医学 
    acts_upstream_of_or对角质形成细胞增殖的负调控 进口
    根据突变表型推断
    更多信息
    公共医学 
    神经管形成中的上游动作 进口
    根据突变表型推断
    更多信息
    公共医学 
    acts_upstream_of_or_在非活动纤毛组件内 进口
    根据突变表型推断
    更多信息
    公共医学 
    acts上游of或蛋白质加工调节范围内 进口
    根据突变表型推断
    更多信息
    公共医学 
    acts_upstream_of_or在平滑的信号通路内 进口
    根据突变表型推断
    更多信息
    公共医学 
    组件 证据代码 酒吧
    在单元格投影中定位 国际能源署
    从电子注释推断
    更多信息
     
    在中心粒中是活动的 国际律师协会
    从祖先的生物学角度推断
    更多信息
     
    位于中心粒中 国际开发协会
    根据直接分析推断
    更多信息
    公共医学 
    位于中心体 国际开发协会
    根据直接分析推断
    更多信息
    公共医学 
    位于睫状体基底部 国际开发协会
    根据直接分析推断
    更多信息
    公共医学 
    位于睫状体基底部 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
    公共医学 
    位于睫状体基底部 国际开发协会
    根据直接分析推断
    更多信息
    公共医学 
    位于睫状体基底部 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    位于睫状体尖端 国际开发协会
    根据直接分析推断
    更多信息
    公共医学 
    在纤毛中是活跃的 国际律师协会
    从祖先的生物学角度推断
    更多信息
     
    位于纤毛中 国际开发协会
    根据直接分析推断
    更多信息
    公共医学 
    位于纤毛中 北美
    不可追踪的作者声明
    更多信息
    公共医学 
    位于纤毛中 TAS公司
    可追溯作者声明
    更多信息
     
    位于枝晶末端 国际开发协会
    根据直接分析推断
    更多信息
    公共医学 
    髂内转运颗粒B部分 国际律师协会
    从祖先的生物学角度推断
    更多信息
     
    髂内转运颗粒B部分 国际开发协会
    根据直接分析推断
    更多信息
    公共医学 
    髂内转运颗粒B部分 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    位于感光细胞纤毛内 国际开发协会
    根据直接分析推断
    更多信息
    公共医学 
    位于连接纤毛的光感受器中 国际开发协会
    根据直接分析推断
    更多信息
    公共医学 
    位于连接纤毛的光感受器中 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     

    一般蛋白质信息

    首选名称
    鞭毛内转运蛋白52同源物
    姓名
    鞭毛内转运52同源物

    NCBI参考序列(参考序列)

    新的 尝试新的成绩单

    独立于注释维护的参考序列基因组

    这些参考序列独立于基因组构建而存在。解释

    这些参考序列独立于基因组进行筛选注释循环,因此其版本可能与当前的RefSeq版本不匹配基因组构建。通过比较中RefSeq的版本来确定版本不匹配本节至中报告的那一节基因组区域,成绩单和产品以上。

    mRNA和蛋白质

    1. NM_001356522.1NP_001343451.1号鞭毛内转运蛋白52同源物

      状态:已验证

      描述
      成绩单变体:此变体(1)表示较长的成绩单。变体1和2编码相同的蛋白质。
      源序列
      AK144188、BG083302
      共识CDS
      CCDS17005.1标准
      UniProtKB/Swiss-Prot公司
      Q3TK21问题,问题62559,问题8BTX3,问题8CI16
      保守领域(1)总结
      第23805条
      位置:28116
      ABC_transp_aux;ABC型非特色运输系统
    2. NM_172150.5NP_742162.2号鞭毛内转运蛋白52同源物

      参见NP_742162.2的相同蛋白质及其注释位置

      状态:已验证

      描述
      成绩单变体:与变体1相比,该变体(2)在5'UTR上有所不同。变体1和2编码相同的蛋白质。
      源序列
      AK167194、BG083302、BU850644
      共识CDS
      CCDS17005.1标准
      UniProtKB/Swiss-Prot公司
      Q3TK21问题,问题62559,问题8BTX3,问题8CI16
      相关的
      ENSMUSP000000018002.7,ENSMUST00000018002.13公司
      保守领域(1)总结
      第23805条
      位置:28116
      ABC_transp_aux;ABC型无特征运输系统

    注释基因组的参考序列:GCF_000001635.27-RS_2024_02

    以下部分包含属于特定的基因组构建。解释

    参考GRCm39 C57BL/6J

    基因组学

    1. NC_000068.8参考GRCm39 C57BL/6J

      范围
      162859200..162888075
      下载
      GenBank(基因银行),美国金融服务贸易协会,序列查看器(图形)

    核糖核酸

    1. XR_374472.5型RNA序列