Ap5s1适配器相关蛋白5复合体，σ1亚单位[小家鼠（家鼠）]-基因-NCBI

总结

官方符号: 应用程序5s1由提供管理信息
官方全名: 适配器相关蛋白5复合物sigma1亚单位由提供管理信息
主要来源: MGI:MGI:1916846
参见相关内容: 乐团：ENSMUSG00000068264 联盟基因组：MGI:1916846
基因类型: 蛋白质编码
RefSeq状态: 已验证
有机体: 小家鼠
血统: 真核生物；后生动物；脊索动物；克兰亚塔；脊椎动物；真造口术；哺乳动物；Eutheria；Euarchontoglires语；闪光；啮齿动物；变形肌；鼠形目；鼠科；穆里奈；穆斯；穆斯
也称为: 西格玛5；0610038L13Rik；2310035K24Rik公司
总结: 预计通过同源重组和内体转运参与双链断裂修复。预测作用于DNA修复和蛋白质转运的上游或内部。预计位于核质中。预计是AP型膜涂层适配器复合体的一部分。预计在胞浆中具有活性；晚期内体；和溶酶体。与人类AP5S1同源（适配器相关蛋白复合物5亚单位sigma 1）。【由基因组资源联盟提供，2022年4月】
表达式: 在成人十二指肠（RPKM 20.9）、成人大肠（RPKM17.3）和28个其他组织中普遍表达查看更多
直系同源: 人类全部的
新的: 尝试新的基因表
尝试新的成绩单

基因组背景

位置：: 2层；2 63.29立方厘米

外显子计数：: 三

注释发布	状态	装配	Chr公司	位置
RS_2024_02号	现在的	GRCm39型(GCF_000001635.27号)	2	NC_000068.8（131052280..131055434）
108.20200622	上一个程序集	GRCm38.p6型(GCF_000001635.26号)	2	NC_000068.7（131210360..131213514）

染色体2-NC_000068.8 描述邻近基因的基因组背景

基因组区域、转录物和产物

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去参考序列详细信息

基因组序列：

转到核苷酸： 绘图美国金融服务贸易协会 GenBank（基因银行）

表达式

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查看详细信息

项目名称：小鼠ENCODE转录组数据
描述：鼠标ENCODE项目生成的RNA分析数据集。
生物项目：PRJNA66167型
出版物：PMID 25409824
分析日期：无

参考文献

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PubMed中的相关文章

第五种衔接蛋白复合物。赫斯特·J，等《公共科学图书馆·生物》，2011年10月，PMID 22022230，免费PMC文章
人类（PEDB）和小鼠（mPEDB）前列腺表达数据库。尼尔森PS，等《核酸研究》，2002年1月1日。PMID 11752298，免费PMC文章
BGEM：一个胚胎和成年小鼠神经系统基因表达的原位杂交数据库。 Magdaleno S公司，等《公共科学图书馆·生物》，2006年4月，PMID 16602821，免费PMC文章
C57BL/6N小鼠胚胎干细胞中的大规模基因捕获。 Hansen总经理，等《基因组研究》，2008年10月，PMID 18799693，免费PMC文章
归一化和减法：促进基因发现的两种方法。博纳尔多MF，等《基因组研究》，1996年9月，PMID 8889548

查看PubMed中的所有（15）引文

GeneRIFs：功能的基因引用

什么是GeneRIF？

提交：新GenerRIF 更正

变更

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等位基因

这类等位基因在《小鼠基因组信息学》上有记载（MGI）

核酸内切酶介导（1）

一般基因信息

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标记

AW060727（e-PCR）
- 大学：178721

同源性

NCBI正交测井

OrthoDB的Orthologs

基因本体论 由MGI提供

功能	证据代码	酒吧
启用molecular_function	ND（无损检测）无可用生物数据更多信息

过程	证据代码	酒吧
acts_upstream_of_or_within DNA损伤响应	国际能源署从电子注释推断更多信息
acts_upstream_of_or_in-DNA修复	国际能源署从电子注释推断更多信息
同源重组参与双链断裂修复	国际标准化组织从序列正畸学推断更多信息
受累的内体转运	国际律师协会从祖先的生物学角度推断更多信息
受累的内体转运	国际标准化组织从序列正畸学推断更多信息
蛋白质转运中的上游作用	国际能源署从电子注释推断更多信息
参与囊泡介导的转运	北美不可追踪的作者声明更多信息	公共医学

组件	证据代码	酒吧
AP-5适配器复合体的一部分	北美不可追踪的作者声明更多信息	公共医学
AP型膜涂层适配器复合体的一部分	国际律师协会从祖先的生物学角度推断更多信息
AP型膜涂层适配器复合体的一部分	国际标准化组织从序列正畸学推断更多信息
位于细胞质中	国际能源署从电子注释推断更多信息
胞浆中的活性	国际律师协会从祖先的生物学角度推断更多信息
定位于胞浆中	国际标准化组织从序列正畸学推断更多信息
定位于内体	国际能源署从电子注释推断更多信息
在晚期内体中是活动的	国际律师协会从祖先的生物学角度推断更多信息
定位于晚期内体	国际标准化组织从序列正畸学推断更多信息
位于晚期内体	北美不可追踪的作者声明更多信息	公共医学
溶酶体中的活性	国际律师协会从祖先的生物学角度推断更多信息
位于溶酶体中	国际标准化组织从序列正畸学推断更多信息
定位膜	国际能源署从电子注释推断更多信息
核质定位	国际标准化组织从序列正畸学推断更多信息

一般蛋白质信息

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首选名称: AP-5复合亚基sigma-1

姓名: 适配器相关蛋白复合物5σ亚基; 适配器相关蛋白复合物5σ亚基; 蛋白质C20orf29同源物

NCBI参考序列（参考序列）

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新的 尝试新的成绩单

独立于注释维护的参考序列基因组

这些参考序列独立于基因组构建而存在。解释

这些参考序列独立于基因组进行筛选注释循环，因此其版本可能与当前的RefSeq版本不匹配基因组构建。通过比较中RefSeq的版本来确定版本不匹配本节至中报告的那一节基因组区域，成绩单和产品以上。

mRNA和蛋白质

NM_001291031.1号→NP_001277960.1AP-5复合亚基sigma-1亚型b

状态：已验证

描述

转录变体：与变体1相比，该变体（2）包括一个额外的片段，该片段导致3'编码区的移码。编码的亚型（b）有一个独特的C末端，比亚型a短。

源序列

AK002807、AW060727、BY264259、DV061712

共识CDS

CCDS71148.1号文件

UniProtKB/TrEMBL公司

A2ANC6型

相关的

ENSMUSP00000105837.2号机组,ENSMUST0000010208.8号

保守领域（1）总结

pfam15001型
位置：1→193

AP-5_子单元_s1；AP-5复合亚基sigma-1
NM_001291032.1号→NP_001277961.1号AP-5复合亚基sigma-1亚型c

参见NP_001277961.1的相同蛋白质及其注释位置

状态：已验证

描述

转录变体：该变体（3）包含一个交替的3'末端外显子，因此与变体1相比，其3'编码区不同。编码的亚型（c）有一个独特的c末端，比亚型a短。

源序列

AK002807、AK009634、AW060727、BY264259

共识CDS

CCDS71147.1号文件

UniProtKB/Swiss-Prot公司

A2ANC8型,问题9D742

UniProtKB/TrEMBL公司

Q8CF73型

相关的

ENSMUSP00000105839.2公司,ENSMUST0000010210.8

保守领域（1）总结

pfam15001型
位置：1→136

AP-5_子单元_s1；AP-5复合亚基sigma-1
NM_001355593.1号→NP_001342522.1型AP-5复合亚基sigma-1亚型d

状态：已验证

描述

转录变体：与变体1相比，该变体（5）保留了一个内含子，并在3'端使用了一个交替的剪接接头，这会导致移码。与同种型a相比，得到的同种型（d）具有更短且不同的C末端。

源序列

AL808128、CX220929

共识CDS

CCDS89557.1号文件

UniProtKB/TrEMBL公司

A2ANC5型

相关的

ENSMUSP00000105835.2号机组,ENSMUST0000010206.2

保守领域（1）总结

pfam15001型
位置：1→59

AP-5_子单元_s1；AP-5复合亚基信号-1
NM_027129.3号→NP_081405.2号AP-5复合亚基sigma-1亚型a

参见NP_081405.2的相同蛋白质及其注释位置

状态：已验证

描述

转录变体：该变体（1）编码最长的亚型（a）。

源序列

AK002807、AK009634、AW060727、BY264259

共识CDS

CCDS16759.1号文件

UniProtKB/TrEMBL公司

Q80V29型

相关的

ENSMUSP000000086933.6号,ENSMUST00000089506.12

保守领域（1）总结

pfam15001型
位置：1→136

AP-5_子单元_s1；AP-5复合亚基sigma-1