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    结束1含有1的内切酶结构域[小家鼠(家鼠)]

    基因ID:71946,更新日期2024年3月5日

    总结

    官方符号
    结束1由提供管理信息
    官方全名
    含有1的内切酶结构域由提供管理信息
    主要来源
    MGI:MGI:1919196
    参见相关内容
    乐团:ENSMUSG00000037419 联盟基因组:MGI:1919196
    基因类型
    蛋白质编码
    RefSeq状态
    已验证
    有机体
    小家鼠
    血统
    真核生物;后生动物;脊索动物;克兰亚塔;脊椎动物;真造口术;哺乳动物;Eutheria;Euarchontoglires语;闪光;啮齿动物;变形肌;鼠形目;鼠科;穆里奈;穆斯;穆斯
    也称为
    2210414F18里亚克;2310067E08里亚克
    总结
    预计可激活核酸内切酶活性;金属离子结合活性;和核酸结合活性。预计位于细胞外区域。在肝脏中表达;后肾;神经系统;神经视网膜;和嗅觉上皮。与人ENDOD1同源(内切酶域包含1)。【由基因组资源联盟提供,2022年4月】
    表达式
    在结肠成体(RPKM 61.0)、小脑成体(PRKM 29.5)和24个其他组织中广泛表达查看更多
    直系同源
    新的
    尝试新的基因表
    尝试新的成绩单

    基因组背景

    参见中的Endod1基因组数据查看器
    位置:
    9 A1;9 3.96立方厘米
    外显子计数:
    注释发布 状态 装配 Chr公司 位置
    RS_2024_02号 现在的 GRCm39型(GCF_000001635.27号) 9 NC_000075.7(14265286..14292538,补遗)
    108.20200622 上一个程序集 GRCm38.p6型(GCF_000001635.26号) 9 NC_000075.6(14353990..14381242,补体)

    染色体9-NC_000075.7描述邻近基因的基因组背景 Neighboring gene STARR-seq mESC enhancer starr_23346 Neighboring gene predicted gene, 34069 Neighboring gene STARR-positive B cell enhancer ABC_E247 Neighboring gene sestrin 3 Neighboring gene predicted gene, 34156 Neighboring gene STARR-seq mESC enhancer starr_23348 Neighboring gene lysine (K)-specific demethylase 4D-like Neighboring gene lysine (K)-specific demethylase 4D Neighboring gene STARR-positive B cell enhancer ABC_E248

    基因组区域、转录物和产物

    表达式

    • 项目名称:小鼠ENCODE转录组数据
    • 描述:鼠标ENCODE项目生成的RNA分析数据集。
    • 生物项目:PRJNA66167型
    • 出版物:PMID 25409824
    • 分析日期:无

    变更

    等位基因

    这类等位基因在《小鼠基因组信息学》上有记载(MGI)
    • 核酸内切酶介导(3)

    互动

    产品 交互作用剂 其他基因 综合体 来源 酒吧 描述

    一般蛋白质信息

    首选名称
    内切酶结构域1蛋白

    NCBI参考序列(参考序列)

    新的 尝试新的成绩单

    独立于注释维护的参考序列基因组

    这些参考序列独立于基因组构建而存在。解释

    这些参考序列独立于基因组进行筛选注释循环,因此其版本可能与当前的RefSeq版本不匹配基因组构建。通过比较中RefSeq的版本来确定版本不匹配本节至中报告的那一节基因组区域,成绩单和产品以上。

    mRNA和蛋白质

    1. NM_028013.3NP_082289.2号内切酶结构域1蛋白前体

      参见NP_082289.2的相同蛋白质及其注释位置

      状态:已验证

      源序列
      AK173036、BY483505
      共识CDS
      邮编:22821.1
      UniProtKB/Swiss-Prot公司
      第4季度第96季度,问题8C522,Q8C5M1型,Q8VE35型
      UniProtKB/TrEMBL公司
      Q69ZY2型
      相关的
      ENSMUSP00000127751.2号,ENSMUST00000167549.2号
      保守领域(1)总结
      cd00091
      位置:65281
      NUC;DNA/RNA非特异性核酸内切酶;原核和真核双链和单链DNA和RNA内切酶也存在于磷酸二酯酶中。它们以单体和同二聚体的形式存在。

    注释基因组的参考序列:GCF_000001635.27-RS_2024_02

    以下部分包含属于特定基因组构建。解释

    参考GRCm39 C57BL/6J

    基因组学

    1. NC_000075.7参考GRCm39 C57BL/6J

      范围
      14265286..14292538补码
      下载
      发电厂银行,美国金融服务贸易协会,序列查看器(图形)

    mRNA和蛋白质

    1. 圣诞节_017313601.2XP_017169090.1号内切酶域1蛋白亚型X1

      UniProtKB/TrEMBL公司
      第三季度UQH3
      保守领域(2)总结
      pfam15070型
      位置:123172
      GOLGA2L5;推测高尔夫球蛋白亚家族A成员2样蛋白5
      第00089条
      位置:1127
      NUC;DNA/RNA非特异性核酸内切酶;原核和真核双链和单链DNA和RNA内切酶也存在于磷酸二酯酶中。它们以单体和同二聚体的形式存在。