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    阿尔及利亚12ALG12α-1,6-核糖基转移酶[小家鼠（家鼠）]

    基因ID:223774，更新日期2024年3月5日

    总结

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    官方符号
    阿尔及利亚12由提供管理信息
    官方全名
    ALG12α-1,6-核糖基转移酶由提供管理信息
    主要来源
    MGI:MGI:2385025
    参见相关内容
    乐团：ENSMUSG00000035845 联盟基因组：MGI:2385025
    基因类型
    蛋白质编码
    RefSeq状态
    已验证
    有机体
    小家鼠
    血统
    真核生物；后生动物；脊索动物；克兰亚塔；脊椎动物；真造口术；哺乳动物；Eutheria；尤阿古托格利尔斯；闪光；啮齿动物；肌形态；鼠形目；鼠科；穆里奈；穆斯；穆斯
    也称为
    电子商务39
    总结
    预计可激活α-1,6-甘露糖转移酶活性。预计参与蛋白质N-连接糖基化。预计作用于多利考键低聚糖生物合成过程的上游或内部。预计位于内质网腔和膜。预计为膜的组成部分。预计在内质网膜中具有活性。该基因的人类同源基因与先天性糖基化免疫球蛋白紊乱有关。与人ALG12同源（ALG12α-1,6-甘露糖转移酶）。【由基因组资源联盟提供，2022年4月】
    表达式
    卵巢成体（RPKM 11.5）、睾丸成体（RTKM 11.0）和28个其他组织中普遍表达查看更多
    直系同源
    人类 全部的
    新的
    尝试新的基因表
    尝试新的成绩单表

    基因组背景

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    参见中的Alg12基因组数据查看器
    位置：
    15 E3；15 44.3立方厘米
    外显子计数：
    10
    注释发布 状态 装配 Chr公司 位置
    RS_2024_02号 现在的 GRCm39型(GCF_000001635.27号) 15 NC_000081.7（88689448..88703498，补码）
    108.20200622 上一个程序集 GRCm38.p6型(GCF_000001635.26号) 15 NC_000081.6（88805243..88819318，补码）

    染色体15-NC_000081.7描述邻近基因的基因组背景 Neighboring gene bromodomain containing 1 Neighboring gene STARR-seq mESC enhancer starr_39439 Neighboring gene STARR-positive B cell enhancer ABC_E9918 Neighboring gene STARR-positive B cell enhancer ABC_E5507 Neighboring gene zinc finger, BED type containing 4 Neighboring gene STARR-seq mESC enhancer starr_39444 Neighboring gene STARR-positive B cell enhancer ABC_E391 Neighboring gene cysteine-rich with EGF-like domains 2 Neighboring gene predicted gene, 23144

    基因组区域、转录物和产物

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    表达式

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    • 项目名称：小鼠ENCODE转录组数据
    • 描述：鼠标ENCODE项目生成的RNA分析数据集。
    • 生物项目：PRJNA66167型
    • 出版物：PMID 25409824
    • 分析日期：无

    参考文献

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    PubMed中的相关文章

    1. 小鼠天冬酰胺连接糖基化12同源基因5’侧翼区域的特征。 哦，哈希K，等《细胞分子生物学快报》，2013年9月，PMID 23818223，免费PMC文章
    2. 内质网应激反应元件在调节小鼠CRELD2-ALG12基因对双向启动子中的作用。 哦，哈希K，等BMC基因组学，2010年11月25日。PMID 21106106，免费PMC文章
    3. 先天性糖基化型Ig疾病定义为多利基-P-甘露糖：Man7GlcNAc2-PP-甘露糖苷转移酶缺乏。 Chantret一世，等.生物化学杂志，2002年7月12日。PMID 11983712号
    4. 使用Dol-P-单糖作为供体底物的糖基转移酶的共同起源和进化。 Oriol R、，等《分子生物学进化》，2002年9月，PMID 12200473
    5. GenePaint.org：小鼠胚胎基因表达模式图谱。 Visel A公司，等《核酸研究》，2004年1月1日。PMID 14681479，免费PMC文章

    查看PubMed中的所有（20）引文

    GeneRIFs：功能的基因引用

    变更

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    等位基因

    这类等位基因在《小鼠基因组信息学》上有记载（MGI）
    • 核酸内切酶介导（3）

    PubChem的途径

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    一般基因信息

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    同源性

    克隆名称

    • MGC29374型

    基因本体论 由MGI提供

    功能 证据代码 酒吧
    激活α-1,6-甘露糖基转移酶活性 国际律师协会
    从祖先的生物学角度推断
    更多信息
    		  
    启用dolichyl-P-Man:Man（7）GlcNAc（2）-PP-Polichol alpha-1,6-甘露糖转移酶 国际能源署
    从电子注释推断
    更多信息
    		  
    使糖基转移酶具有活性 国际能源署
    从电子注释推断
    更多信息
    		  
    激活甘露糖基转移酶活性 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
    		 公共医学 
    激活转移酶活性 国际能源署
    从电子注释推断
    更多信息
    		  
    过程 证据代码 酒吧
    acts上游of或在杜利考链低聚糖生物合成过程中 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
    		 公共医学 
    involved_in蛋白N-连接糖基化 国际律师协会
    从祖先的生物学角度推断
    更多信息
    		  
    组件 证据代码 酒吧
    定位内质网 国际能源署
    从电子注释推断
    更多信息
    		  
    内质网膜is_active 国际律师协会
    从祖先的生物学角度推断
    更多信息
    		  
    定位膜 国际能源署
    从电子注释推断
    更多信息
    		  

    一般蛋白质信息

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    首选名称
    dol-P-Man:Man（7）GlcNAc（2）-PP-dolα-1,6-甘露糖基转移酶
    姓名
    天冬酰胺连接糖基化12（α-1,6-甘露糖基转移酶）
    天冬酰胺连接的糖基化12同源物（酵母，α-1,6-甘露糖基转移酶）
    天冬酰胺连接糖基化蛋白12同源物
    dolichyl-P-Man:Man（7）GlcNAc（2）-PP-寡酰基-α-1,6-甘露糖转移酶
    甘露糖转移酶ALG12同源物
    NP_001135829.1号
    NP_001402946.1号
    NP_001402947.1
    NP_001402948.1
    NP_663452.1号

    NCBI参考序列（参考序列）

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    新的 尝试新的成绩单表

    独立于注释维护的参考序列基因组

    这些参考序列独立于基因组构建而存在。解释

    这些参考序列独立于基因组进行筛选注释循环，因此其版本可能与当前的RefSeq版本不匹配基因组构建。通过比较中RefSeq的版本来确定版本不匹配本节至中报告的那一节基因组区域，成绩单和产品以上。

    mRNA和蛋白质

    1. NM_001142357.2→NP_001135829.1号dol-P-Man:Man（7）GlcNAc（2）-PP-dolα-1,6-甘露糖基转移酶亚型1

      参见NP_001135829.1的相同蛋白质及其注释位置

      状态：已验证

      描述
      转录变体：该变体（1）代表较长的转录，编码较长的亚型（1）。
      源序列
      AC117700型
      共识CDS
      CCDS49694.1号文件
      UniProtKB/Swiss-Prot公司
      Q3UQK8号,Q8VDB2型
      相关的
      ENSMUSP00000123935.2号,ENSMUST0000012183.8号
      保守领域（1）总结
      第21590条
      位置：17→405
      PMT_2；磷酸Dolichyl甘露糖蛋白甘露糖基转移酶

    2. NM_001416017.1→NP_001402946.1号dol-P-Man:Man（7）GlcNAc（2）-PP-dolα-1,6-甘露糖基转移酶亚型1

      状态：已验证

      源序列
      AC117700型
      UniProtKB/Swiss-Prot公司
      Q3UQK8号,Q8VDB2型

    3. NM_001416018.1号→NP_001402947.1dol-P-Man:Man（7）GlcNAc（2）-PP-dolα-1,6-甘露糖基转移酶亚型1

      状态：已验证

      源序列
      AC117700型
      UniProtKB/Swiss-Prot公司
      Q3UQK8号,Q8VDB2型

    4. NM_001416019.1→NP_001402948.1dol-P-Man:Man（7）GlcNAc（2）-PP-dolα-1,6-甘露糖基转移酶亚型3

      状态：已验证

      源序列
      AC117700型

    5. 45477.3纳米→NP_663452.1号dol-P-Man:Man（7）GlcNAc（2）-PP-dolα-1,6-甘露糖基转移酶亚型2

      参见NP_663452.1的相同蛋白质及其注释位置

      状态：已验证

      描述
      转录变异体：与变异体1相比，该变异体（2）使用一个替代剪接位点，在中央编码区缺少两个外显子。与亚型1相比，编码亚型（2）较短。
      源序列
      AC117700型
      共识CDS
      CCDS27732.1号
      UniProtKB/TrEMBL公司
      Q8VCA2问题
      相关的
      ENSMUSP00000043480.9号,ENSMUST00000043087.15号
      保守领域（1）总结
      第21590条
      位置：17→232
      PMT_2；磷酸Dolichyl甘露糖蛋白甘露糖基转移酶

    核糖核酸

    1. 编号_183241.1RNA序列

      状态：已验证

      源序列
      AC117700型

    2. 编号：183242.1RNA序列

      状态：已验证

      源序列
      AC117700型

    3. 编号：183243.1RNA序列

      状态：已验证

      源序列
      AC117700型

    注释基因组的参考序列：GCF_000001635.27-RS_2024_02

    以下部分包含属于特定的基因组构建。解释

    参考GRCm39 C57BL/6J

    基因组学

    1. NC_000081.7参考GRCm39 C57BL/6J

      范围
      88689448.88703498补码
      下载
      GenBank（基因银行）,美国金融服务贸易协会,序列查看器（图形）
    核苷酸 蛋白质 应变
    标题 访问和版本
    蛋白质接入 链接
    GenPept链接 UniProtKB链接
    问题8VDB2.2 GenPept公司 UniProtKB/Swiss-Prot:Q8VDB2

    基因链接输出

    以下内容链接输出资源由外部提供者提供。这些提供者负责维护链接。

    化学信息
    分子生物学数据库
    研究材料
    工具
    其他