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    Zbtb20型锌指和含20的BTB结构域[小家鼠（家鼠）]

    基因ID:56490，更新日期2024年5月28日

    总结

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    官方符号
    Zbtb20型由提供管理信息
    官方全名
    含20的锌指和BTB结构域由提供管理信息
    主要来源
    MGI:MGI:1929213
    参见相关内容
    乐团：ENSMUSG00000022708 联盟基因组：MGI:1929213
    基因类型
    蛋白质编码
    RefSeq状态
    已验证
    有机体
    小家鼠
    血统
    真核生物；后生动物；脊索动物；克兰亚塔；脊椎动物；真造口术；哺乳动物；Eutheria；尤阿古托格利尔斯；闪光；啮齿动物；变形肌；鼠形目；鼠科；穆里奈；穆斯；穆斯
    也称为
    HOF；J20；DPZF；奥达8；ODA-8S；Zfp288；D16Wsu73e；1300017A20Rik；7330412A13Rik；A930017C21Rik；Tg（PDGFB-APPSwInd）20升
    总结
    启用DNA结合转录阻遏物活性、RNA聚合酶II特异性和转录调控区结合活性。参与多个过程，包括细胞对葡萄糖刺激的反应；糖酵解过程的正调控；基因表达的调控。作用于RNA聚合酶II转录负调控的上游或内部。位于细胞质和细胞核中。以多种结构表达，包括消化系统；心血管系统；泌尿生殖系统；神经系统；和感觉器官。与人同源的ZBTB20（锌指和BTB结构域包含20）。【由基因组资源联盟提供，2022年4月】
    表达式
    生殖道脂肪垫成人（RPKM 5.3）、心脏成人（RPKM 4.7）和26个其他组织中普遍表达查看更多
    直系同源
    人类 全部的
    新的
    尝试新的基因表
    尝试新的成绩单

    基因组背景

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    参见中的Zbtb20基因组数据查看器
    位置：
    16 B4；16 28.44立方厘米
    外显子计数：
    14
    注释发布 状态 装配 Chr公司 位置
    RS_2024_02号 现在的 GRCm39型(GCF_000001635.27号) 16 NC_000082.7（42728008..43462981）
    108.20200622 上一个程序集 GRCm38.p6型(GCF_000001635.26号) 16 NC_000082.6（42875689..43634392）

    染色体16-NC_000082.7描述邻近基因的基因组背景 Neighboring gene RIKEN cDNA 4932412D23 gene Neighboring gene predicted gene, 29960 Neighboring gene STARR-seq mESC enhancer starr_40870 Neighboring gene STARR-positive B cell enhancer mm9_chr16:42836127-42836428 Neighboring gene STARR-seq mESC enhancer starr_40871 Neighboring gene STARR-positive B cell enhancer ABC_E52 Neighboring gene predicted gene, 19522 Neighboring gene STARR-seq mESC enhancer starr_40874 Neighboring gene NADH:ubiquinone oxidoreductase core subunit S5, pseudogene Neighboring gene STARR-seq mESC enhancer starr_40875 Neighboring gene STARR-seq mESC enhancer starr_40877 Neighboring gene STARR-seq mESC enhancer starr_40878 Neighboring gene predicted gene, 25873 Neighboring gene ribosomal protein L3 pseudogene Neighboring gene STARR-seq mESC enhancer starr_40879 Neighboring gene RAN guanine nucleotide release factor pseudogene Neighboring gene predicted gene 9968 Neighboring gene STARR-seq mESC enhancer starr_40880 Neighboring gene predicted gene 15713 Neighboring gene STARR-seq mESC enhancer starr_40881 Neighboring gene STARR-positive B cell enhancer mm9_chr16:43507109-43507410 Neighboring gene STARR-seq mESC enhancer starr_40882 Neighboring gene STARR-seq mESC enhancer starr_40883 Neighboring gene STARR-seq mESC enhancer starr_40885 Neighboring gene STARR-positive B cell enhancer ABC_E7450 Neighboring gene STARR-positive B cell enhancer ABC_E4170 Neighboring gene CapStarr-seq enhancer MGSCv37_chr16:43690256-43690365 Neighboring gene microRNA 568 Neighboring gene predicted gene, 53956 Neighboring gene T cell immunoreceptor with Ig and ITIM domains

    基因组区域、转录物和产物

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    表达式

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    • 项目名称：小鼠ENCODE转录组数据
    • 描述：鼠标ENCODE项目生成的RNA分析数据集。
    • 生物项目：PRJNA66167型
    • 出版物：PMID 25409824
    • 分析日期：无

    参考文献

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    PubMed中的相关文章

    1. ZBTB20对小鼠的耳蜗成熟和听力至关重要。 谢Z，等美国国家科学院院刊，2023年6月13日。PMID 37279265，免费PMC文章
    2. 兴奋-抑制失衡会破坏淀粉样蛋白和非病理条件下的视觉熟悉性。 尼劳拉·S，等Cell Rep，2023年1月31日。PMID 36640331，免费PMC文章
    3. 基于iTRAQ的APP转基因小鼠尿液外显子蛋白质组分析。 周X，等《国际分子科学杂志》，2022年12月30日。PMID 36614115，免费PMC文章
    4. ZBTB20调节成年小鼠催乳素的表达和泌乳激素功能。 韩Q，等《内分泌学》，2022年10月23日。PMID 36288554号
    5. ZBTB20通过NF-кB介导的炎症在小鼠心脏移植中调节心脏移植排斥反应。 Lu L，等Transpl Immunol，2022年10月PMID 35872083

    查看PubMed中的所有（335）引文

    GeneRIFs：功能的基因引用

    什么是GeneRIF？
    1. ZBTB20通过磷蛋白调节SERCA2a活性和心肌收缩。
      标题：ZBTB20通过磷蛋白调节SERCA2a活性和心肌收缩。
    2. ZBTB20对小鼠的耳蜗成熟和听力至关重要。
      标题：ZBTB20对小鼠的耳蜗成熟和听力至关重要。
    3. ZBTB20调节成年小鼠催乳素的表达和泌乳激素功能。
      标题：ZBTB20调节成年小鼠催乳素的表达和促乳激素的功能。
    4. ZBTB20通过NFsmall ka，CyrillicB介导的小鼠心脏移植炎症调节同种异体心脏排斥反应。
      标题：ZBTB20通过NF-кB介导的炎症在小鼠心脏移植中调节心脏移植排斥反应。
    5. Zbtb20识别并控制胸腺衍生的调节性T细胞群，这些调节性T淋巴细胞在肠道内稳态中发挥作用。
      标题：Zbtb20识别并控制胸腺衍生的调节性T细胞群，在肠道内稳态中发挥作用。
    6. 锌指和含BTB结构域的蛋白ZBTB20通过抑制肝细胞中脂蛋白脂肪酶基因的转录来调节血浆甘油三酯代谢。
      标题：含有锌指和BTB结构域的蛋白ZBTB20通过抑制肝细胞中脂蛋白脂肪酶基因转录来调节血浆甘油三酯代谢。
    7. 在新皮质发育期间，表观遗传回路控制着神经生成程序。
      标题：表观遗传回路在新皮质发育期间控制神经生成程序。
    8. ZBTB20对于哺乳动物新皮质中胼胝体投射神经元和星形胶质细胞亚群的规范至关重要。
      标题：ZBTB20对哺乳动物新皮层胼胝体投射神经元和星形胶质细胞亚群的规范至关重要。
    9. 锌指蛋白ZBTB20通过ROS-TNFalph/ASK1/JNK通路调节保护心肌梗死后心脏重塑。
      标题：锌指蛋白ZBTB20通过ROS-TNFα/ASK1/JNK通路调节防止心肌梗死后心脏重塑。
    10. Zbtb20缺乏会导致小鼠心脏收缩功能障碍。
      标题：Zbtb20缺乏导致小鼠心脏收缩功能障碍。
    提交： 新GenerRIF 更正 查看所有GeneRIF（35）

    变更

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    等位基因

    这类等位基因在《小鼠基因组信息学》上有记载（MGI）
    • 核酸内切酶介导（5）
    • 捕获的基因（1）
    • 目标（5）1条引文
    • 转基因（1）1条引文

    互动

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    产品 交互作用剂 其他基因 复杂 来源 酒吧 描述

    一般基因信息

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    标记

    同源性

    基因本体论 由MGI提供

    功能 证据代码 酒吧
    启用DNA绑定 伊达
    根据直接分析推断
    更多信息
    		 公共医学 
    使DNA结合转录阻遏物活性，RNA聚合酶II特异性 国际律师协会
    从祖先的生物学角度推断
    更多信息
    		  
    使DNA结合转录阻遏物活性，RNA聚合酶II特异性 国际开发协会
    根据直接分析推断
    更多信息
    		 公共医学 
    使RNA聚合酶II顺调控区序列特异性DNA结合 国际律师协会
    从祖先的生物学角度推断
    更多信息
    		  
    启用金属离子绑定 国际能源署
    从电子注释推断
    更多信息
    		  
    实现序列特异性双链DNA结合 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
    		  
    启用转录顺调控区结合 国际开发协会
    根据直接分析推断
    更多信息
    		 公共医学 
    过程 证据代码 酒吧
    参与细胞对葡萄糖刺激的反应 进口
    根据突变表型推断
    更多信息
    		 公共医学 
    参与脂质稳态 进口
    根据突变表型推断
    更多信息
    		 公共医学 
    参与DNA模板转录的负调控 伊达
    根据直接分析推断
    更多信息
    		 公共医学 
    参与基因表达的负调控 进口
    根据突变表型推断
    更多信息
    		 公共医学 
    参与RNA聚合酶II对转录的负调控 国际律师协会
    从祖先的生物学角度推断
    更多信息
    		  
    acts_upstream_of_or内RNA聚合酶II对转录的负调控 进口
    根据突变表型推断
    更多信息
    		 公共医学 
    参与糖酵解过程的正调控 进口
    根据突变表型推断
    更多信息
    		 公共医学 
    参与干扰素-β产生的正调控 国际开发协会
    根据直接分析推断
    更多信息
    		 公共医学 
    参与干扰素-β产生的正调控 进口
    根据突变表型推断
    更多信息
    		 公共医学 
    参与白细胞介素-6产生的正调控 国际开发协会
    根据直接分析推断
    更多信息
    		 公共医学 
    参与白细胞介素-6产生的正调控 进口
    根据突变表型推断
    更多信息
    		 公共医学 
    参与脂质生物合成过程的正调控 进口
    根据突变表型推断
    更多信息
    		 公共医学 
    参与肿瘤坏死因子产生的正调控 国际开发协会
    根据直接分析推断
    更多信息
    		 公共医学 
    参与肿瘤坏死因子产生的正调控 进口
    根据突变表型推断
    更多信息
    		 公共医学 
    参与细胞因子产生的调节 国际律师协会
    从祖先的生物学角度推断
    更多信息
    		  
    参与免疫系统过程的调节 国际律师协会
    从祖先的生物学角度推断
    更多信息
    		  
    组件 证据代码 酒吧
    位于细胞质中 国际开发协会
    根据直接分析推断
    更多信息
    		 公共医学 
    定位于核体 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
    		  
    核质中的is_active_ 国际律师协会
    从祖先的生物学角度推断
    更多信息
    		  
    核质定位 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
    		  
    位于核内 国际开发协会
    根据直接分析推断
    更多信息
    		 公共医学 

    一般蛋白质信息

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    首选名称
    锌指和BTB结构域蛋白20
    姓名
    应用程序Tg
    BTB/POZ域锌指因子HOF
    PDGF-APPSwInd公司
    PDGF-hAPP695751770V171F，KM670/671NL
    POZ/锌指转录因子ODA-8
    锌指蛋白288

    NCBI参考序列（参考序列）

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    新的 尝试新的成绩单

    独立于注释维护的参考序列基因组

    这些参考序列独立于基因组构建而存在。解释

    这些参考序列独立于基因组进行筛选注释循环，因此其版本可能与当前的RefSeq版本不匹配基因组构建。通过比较中RefSeq的版本来确定版本不匹配本节至中报告的那一节基因组区域，成绩单和产品以上。

    mRNA和蛋白质

    1. NM_001285805.1→NP_001272734.1号锌指和BTB结构域蛋白20亚型L

      参见NP_001272734.1的相同蛋白质及其注释位置

      状态：已验证

      描述
      成绩单变体：与变体1相比，该变体（3）在5'UTR上有所不同。变体1和3编码相同的亚型（L）。
      源序列
      BC056446，BI659024
      共识CDS
      CCDS28178.1号
      UniProtKB/Swiss-Prot公司
      A6X916型,Q8K0L9型,问题9DBD4,Q9QZ87型
      UniProtKB/TrEMBL公司
      问题9QZF3
      保守领域（5）总结
      sd00017（美元）
      位置：580→600
      ZF_C2H2；C2H2锌指[结构图案]
      cd18208
      位置：79→195
      BTB_POZ_ZBTB20_DPZF；锌指和BTB结构域包含蛋白20（ZBTB20）中发现的BTB（宽复合体、Tramtrack和Bric a brac）/POZ（痘病毒和锌指）结构域
      pfam00096型
      位置：634→656
      zf-C2H2；锌指，C2H2型
      pfam13465型
      位置：648→673
      zf-H2C2_2；锌纤维双畴
      cd20908
      位置：608→657
      SUF4类；水稻转录因子抑制因子FRI 4（OsSUF4）、拟南芥SUF4（AtSUF4

    2. 纳米_001393397.1→NP_001380326.1号锌指和BTB结构域蛋白20亚型L

      状态：已验证

      源序列
      AC120871、CT010512、CT010517
      UniProtKB/Swiss-Prot公司
      A6X916型,Q8K0L9型,问题9DBD4,Q9QZ87型
      UniProtKB/TrEMBL公司
      问题9QZF3
      相关的
      ENSMUSP00000110342.3,ENSMUST00000114694.9号
      保守领域（5）总结
      sd00017（美元）
      位置：580→600
      ZF_C2H2；C2H2锌指[结构图案]
      cd18208
      位置：79→195
      BTB_POZ_ZBTB20_DPZF；锌指和BTB结构域包含蛋白20（ZBTB20）中发现的BTB（宽复合体、Tramtrack和Bric a brac）/POZ（痘病毒和锌指）结构域
      pfam00096型
      位置：634→656
      zf-C2H2；锌指，C2H2型
      pfam13465型
      位置：648→673
      zf-H2C2_2；锌纤维双畴
      cd20908
      位置：608→657
      SUF4类；水稻转录因子抑制因子FRI 4（OsSUF4）、拟南芥SUF4（AtSUF4

    3. NM_001393398.1→NP_001380327.1号锌指和BTB结构域蛋白20亚型L

      状态：已验证

      源序列
      AC120871、CT010512、CT010517
      UniProtKB/Swiss-Prot公司
      A6X916型,Q8K0L9型,第9季度第4季度,Q9QZ87型
      UniProtKB/TrEMBL公司
      问题9QZF3
      保守领域（5）总结
      sd00017（美元）
      位置：580→600
      ZF_C2H2；C2H2锌指[结构图案]
      cd18208
      位置：79→195
      BTB_POZ_ZBTB20_DPZF；锌指和BTB结构域包含蛋白20（ZBTB20）中发现的BTB（宽复合体、Tramtrack和Bric a brac）/POZ（痘病毒和锌指）结构域
      pfam00096型
      位置：634→656
      zf-C2H2；锌指，C2H2型
      pfam13465型
      位置：648→673
      zf-H2C2_2；锌纤维双畴
      cd20908
      位置：608→657
      SUF4类；水稻转录因子抑制因子FRI 4（OsSUF4）、拟南芥SUF4（AtSUF4

    4. NM_001393399.1号→NP_001380328.1号锌指和BTB结构域蛋白20亚型S

      状态：已验证

      源序列
      AC120871、CT010512、CT010517
      UniProtKB/TrEMBL公司
      问题9QZF3
      保守领域（6）总结
      COG5048公司
      位置：432→574
      COG5048；FOG:Zn-finger[仅适用于一般功能预测]
      sd00017（美元）
      位置：507→527
      ZF_C2H2；C2H2锌指[结构图案]
      cd18208
      位置：6→122
      BTB_POZ_ZBTB20_DPZF；锌指和BTB结构域包含蛋白20（ZBTB20）中发现的BTB（宽复合体、Tramtrack和Bric a brac）/POZ（痘病毒和锌指）结构域
      pfam00096型
      位置：561→583
      zf-C2H2；锌指，C2H2型
      pfam13465型
      位置：575→600
      zf-H2C2_2；锌指双结构域
      cd20908
      位置：535→584
      SUF4类；水稻转录因子抑制因子FRI 4（OsSUF4）、拟南芥SUF4（AtSUF4

    5. NM_019778.2号→NP_062752.2型锌指和BTB结构域蛋白20亚型L

      参见NP_062752.2的相同蛋白质及其注释位置

      状态：已验证

      描述
      转录变体：该变体（1）代表较长的转录，编码较长的亚型（L）。
      源序列
      AK005028、BC056446
      共识CDS
      CCDS28178.1号
      UniProtKB/Swiss-Prot公司
      A6X916型,Q8K0L9型,问题9DBD4,第9季度第87季度
      UniProtKB/TrEMBL公司
      问题9QZF3
      相关的
      ENSMUSP00000078410.7号,ENSMUST00000079441.13号
      保守领域（5）总结
      sd00017（美元）
      位置：580→600
      ZF_C2H2；C2H2锌指[结构图案]
      cd18208
      位置：79→195
      BTB_POZ_ZBTB20_DPZF；锌指和BTB结构域包含蛋白20（ZBTB20）中发现的BTB（宽复合体、Tramtrack和Bric a brac）/POZ（痘病毒和锌指）结构域
      pfam00096型
      位置：634→656
      zf-C2H2；锌指，C2H2型
      pfam13465型
      位置：648→673
      zf-H2C2_2；锌纤维双畴
      cd20908
      位置：608→657
      SUF4类；水稻转录因子抑制因子FRI 4（OsSUF4）、拟南芥SUF4（AtSUF4

    6. NM_181058.1号→NP_851401.1号锌指和BTB结构域蛋白20亚型S

      参见NP_851401.1的相同蛋白质及其注释位置

      状态：已验证

      描述
      转录变异体：与变异体1相比，该变异体（2）缺乏替代的5'UTR外显子和包含翻译起始位点的替代外显子。与亚型L相比，生成的亚型（S）在N末端较短。
      源序列
      AK005028、BC056446
      共识CDS
      CCDS49851.1号文件
      UniProtKB/TrEMBL公司
      问题9QZF3
      相关的
      ENSMUSP00000110339.2,ENSMUST00000114691.8号
      保守领域（6）总结
      COG5048公司
      位置：432→574
      COG5048；FOG:Zn-finger[仅适用于一般功能预测]
      sd00017（美元）
      位置：507→527
      ZF_C2H2；C2H2锌指[结构图案]
      cd18208
      位置：6→122
      BTB_POZ_ZBTB20_DPZF；锌指和BTB结构域包含蛋白20（ZBTB20）中发现的BTB（宽复合体、Tramtrack和Bric a brac）/POZ（痘病毒和锌指）结构域
      pfam00096型
      位置：561→583
      zf-C2H2；锌指，C2H2型
      pfam13465型
      位置：575→600
      zf-H2C2_2；锌纤维双畴
      cd20908
      位置：535→584
      SUF4类；水稻转录因子抑制因子FRI 4（OsSUF4）、拟南芥SUF4（AtSUF4

    注释基因组的参考序列：GCF_000001635.27-RS_2024_02

    以下部分包含属于特定基因组构建。解释

    参考GRCm39 C57BL/6J

    基因组学

    1. NC_000082.7参考GRCm39 C57BL/6J

      范围
      42728008..43462981
      下载
      GenBank（基因银行）,美国金融服务贸易协会,序列查看器（图形）
    核苷酸 蛋白质 应变
    标题 访问和版本
    蛋白质接入 链接
    GenPept链接 UniProtKB链接
    Q8K0L9.1型 GenPept公司 UniProtKB/Swiss-Prot:Q8K0L9

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