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    大号a4a微管蛋白α4a[智人(人类)]

    基因ID:7277,更新日期2024年6月6日

    总结

    官方符号
    TUBA4A型由提供HGNC公司
    官方全名
    微管蛋白α4a由提供HGNC公司
    主要来源
    HGNC:HGNC:12407
    请参阅相关
    乐团:ENSG00000127824 MIM:191110; 联盟基因组:HGNC:12407
    基因类型
    蛋白质编码
    RefSeq状态
    检验过的
    有机体
    智人
    血统
    真核生物;后生动物;弦线;颅亚目;脊椎动物;真造口术;哺乳动物;Eutheria;尤阿古托格利尔斯;灵长类;Haplorhini;卡塔里尼;人科;人类
    也称为
    ALS22;TUBA1;H2-ALPHA
    总结
    真核细胞骨架的微管具有重要的多种功能,由α和β微管蛋白的异二聚体组成。编码这些微管成分的基因是微管蛋白超家族的一部分,该家族由六个不同的家族组成。所有真核生物中都存在来自α、β和γ微管蛋白家族的基因。α和β微管蛋白是微管的主要成分,而γ微管蛋白在微管组装成核中起着关键作用。有多个α和β微管蛋白基因,它们在物种之间高度保守。该基因编码一种α-微管蛋白,它是大鼠睾丸特异性α-微管蛋白的高度保守同源物。此外,还发现了编码该基因不同亚型的剪接转录变体。[由RefSeq提供,2013年6月]
    表达式
    在皮肤(RPKM 72.2)、大脑(RPKM48.6)和20个其他组织中广泛表达查看更多
    直系同源
    新款
    尝试新的基因表
    尝试新的成绩单表

    基因组背景

    参见中的TUBA4A基因组数据查看器
    位置:
    第2季度35
    外显子计数:
    5
    注释发布 状态 装配 Chr公司 位置
    RS_2023_10号 现在的 GRCh38.p14型(GCF_000001405.40) 2 NC_000002.12(219249710..219254740,补码)
    2003年10月10日 现在的 T2T-CHM13v2.0(GCF_009914755.1号) 2 NC_060926.1(219734477.219739787,补码)
    105.20220307 上一个程序集 GRCh37.0p13型(GCF_000001405.25号) 2 NC_000002.11(220114432..220119462,补码)

    染色体2-NC_000002.12描述邻近基因的基因组背景 Neighboring gene autophagy related 9A Neighboring gene H3K27ac-H3K4me1 hESC enhancer GRCh37_chr2:220093298-220093846 Neighboring gene H3K27ac-H3K4me1 hESC enhancer GRCh37_chr2:220093847-220094394 Neighboring gene H3K27ac hESC enhancer GRCh37_chr2:220094395-220094942 Neighboring gene ankyrin repeat and zinc finger peptidyl tRNA hydrolase 1 Neighboring gene H3K27ac hESC enhancer GRCh37_chr2:220109882-220110464 Neighboring gene galactosidase beta 1 like Neighboring gene ATAC-STARR-seq lymphoblastoid active region 17144 Neighboring gene ATAC-STARR-seq lymphoblastoid active region 17145 Neighboring gene ATAC-STARR-seq lymphoblastoid active region 17146 Neighboring gene ATAC-STARR-seq lymphoblastoid active region 17147 Neighboring gene ATAC-STARR-seq lymphoblastoid silent region 12351 Neighboring gene serine/threonine kinase 16 Neighboring gene ATAC-STARR-seq lymphoblastoid active region 17148 Neighboring gene tubulin alpha 4b Neighboring gene H3K27ac-H3K4me1 hESC enhancer GRCh37_chr2:220142208-220142912 Neighboring gene ATAC-STARR-seq lymphoblastoid silent region 12352 Neighboring gene H3K27ac-H3K4me1 hESC enhancer GRCh37_chr2:220150891-220151858 Neighboring gene DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member B2 Neighboring gene protein tyrosine phosphatase receptor type N Neighboring gene microRNA 153-1

    基因组区域、转录物和产物

    表达式

    • 项目名称:HPA RNA-seq正常组织
    • 描述:对代表27种不同组织的95名人类个体的组织样本进行RNA-seq,以确定所有蛋白编码基因的组织特异性
    • 生物项目:项目编号:4337
    • 出版物:项目管理标识号24309898
    • 分析日期:2018年4月4日星期三07:08:55

    参考文献

    PubMed中的相关文章

    GeneRIFs:功能的基因引用

    什么是GeneRIF?

    HIV-1相互作用

    蛋白质相互作用

    蛋白质 基因 互动 酒吧
    包膜表面糖蛋白gp120 环境价值 串联亲和纯化和质谱分析鉴定从HIV-1表达细胞分离的staufen1 RNP复合物中并入的微管蛋白α4a蛋白(TUBA4A)、HIV-1 Gag、Gag/Pol、gp120和Nef 公共医学
    环境价值 HIV-1 gp120治疗后,人类神经细胞中α-管蛋白、TRADD、IFN-gamma R2、GAS1、MADD、NF-kappaB、I-kappa B、14-3-3蛋白、APaf1、PARP、IGF-1受体、RB1、Rb2/p130、ARC和caspase 6的mRNA表达水平上调 公共医学
    环境价值 HIV-1 gp120与CD4+容许细胞的结合以CD4依赖的方式增加乙酰化α-管蛋白的水平;组蛋白脱乙酰化酶6(HDAC6)的过度表达抑制α-管蛋白的乙酰化并阻止HIV-1细胞融合 公共医学
    包膜表面糖蛋白gp160前体 环境价值 用肌动蛋白解聚剂或微管蛋白聚合抑制剂处理细胞,可大大降低HIV-1 Gag和Env带帽细胞的百分比,这表明有效组装HIV-1需要完整的肌动蛋白和微管蛋白细胞骨架 公共医学
    包膜跨膜糖蛋白gp41 环境价值 HIV-1 gp41胞质域的表达降低乙酰化微管蛋白α并干扰病毒细胞融合 公共医学
    Gag-Pol公司 gag-pol公司 串联亲和纯化和质谱分析鉴定从HIV-1表达细胞分离的staufen1 RNP复合物中并入的微管蛋白α4a蛋白(TUBA4A)、HIV-1 Gag、Gag/Pol、gp120和Nef 公共医学
    奈夫 nef(奈夫) 串联亲和纯化和质谱分析鉴定从HIV-1表达细胞分离的staufen1 RNP复合物中并入的微管蛋白α4a蛋白(TUBA4A)、HIV-1 Gag、Gag/Pol、gp120和Nef 公共医学
    Pr55(间隙) 堵住 串联亲和纯化和质谱分析鉴定从HIV-1表达细胞分离的staufen1 RNP复合物中并入的微管蛋白α4a蛋白(TUBA4A)、HIV-1 Gag、Gag/Pol、gp120和Nef 公共医学
    堵住 用肌动蛋白解聚剂或微管蛋白聚合抑制剂处理细胞,可大大降低HIV-1 Gag和Env带帽细胞的百分比,这表明有效组装HIV-1需要完整的肌动蛋白和微管蛋白细胞骨架 公共医学
    利润 转速 HIV-1 Rev相互作用蛋白,微管蛋白α4a(TUBA4A),通过体外结合实验(涉及HeLa细胞的胞浆或核提取物)进行鉴定 公共医学
    转速 Rev作用于微管蛋白形成的微管解聚,这种作用在HIV-1感染期间观察到 公共医学
    Tat公司 塔特 与野生型相比,HIV-1 Tat K29A、K50R和K51R赖氨酸突变下调了细胞中可溶性微管蛋白的比例,而大多数其他赖氨酸变异上调了可溶性微管蛋白质的比例 公共医学
    塔特 HIV-1 Tat导致α-管蛋白染色显著减少,这表明人类肠上皮细胞的细胞骨架组织受到破坏 公共医学
    塔特 HIV-1 Tat(特别是氨基酸38-72)增强微管蛋白聚合并触发线粒体途径诱导T细胞凋亡,如离体线粒体释放细胞色素c所示 公共医学
    塔特 HIV-1 Tat(氨基酸36-39)结合微管蛋白α/β二聚体和聚合微管,导致微管动力学的改变和线粒体依赖性凋亡途径的激活,而Bcl-2相关的Bim促进了该途径的激活 公共医学
    整合酶 gag-pol公司 免疫共沉淀显示HIV-1 IN与α-微管蛋白的相互作用 公共医学

    转到HIV-1人类交互数据库

    PubChem的途径

    互动

    产品 交互作用剂 其他基因 综合体 来源 酒吧 描述

    一般基因信息

    标记

    克隆名称

    • FLJ30169型

    一般蛋白质信息

    首选名称
    微管蛋白α-4A链
    姓名
    微管蛋白H2α
    微管蛋白α-1链
    微管蛋白,α1(睾丸特异性)

    NCBI参考序列(RefSeq)

    新款 尝试新的成绩单表

    独立于注释的RefSeq维护基因组

    这些参考序列独立于基因组构建而存在。解释

    这些参考序列与基因组无关注释循环,因此其版本可能与当前的RefSeq版本不匹配基因组构建。通过比较中RefSeq的版本来确定版本不匹配本节至中报告的那一节基因组区域,成绩单和产品以上。

    基因组学

    1. NG_029913.1参考序列基因

      范围
      4999..9207
      下载
      GenBank(基因银行),美国金融服务贸易协会,序列查看器(图形)

    mRNA和蛋白质

    1. NM_001278552.2号NP_001265481.1号微管蛋白α-4A链亚型2

      参见NP_001265481.1的相同蛋白质及其注释位置

      状态:已审阅

      描述
      转录变体:与变体1相比,该变体(2)包含一个替代的5'外显子,这导致翻译起始于下游起始密码子。与亚型1相比,得到的亚型(2)具有较短的N末端。
      源序列
      AC068946、AK054731、AK299958
      共识CDS
      CCDS63131.1标准
      UniProtKB/TrEMBL公司
      A8JZY9型
      相关的
      ENSP00000375938.2号文件,ENST00000392088.6号
      保守领域(1)总结
      PTZ00335型
      位置:1433
      PTZ00335;微管蛋白α链;临时的
    2. NM_006000.3号NP_005991.1号微管蛋白α-4A链亚型1

      参见NP_005991.1的相同蛋白质及其注释位置

      状态:已审阅

      描述
      转录变体:该变体(1)编码较长的亚型(1)。
      源序列
      AC068946、AK054731、BP346611
      共识CDS
      CCDS2438.1标准
      UniProtKB/Swiss-Prot公司
      A8MUB1型,B3KNQ6型,P05215号,第68366页
      UniProtKB/TrEMBL公司
      A8JZY9型
      相关的
      ENSP0000248437.4号,ENST00000248437.9号机组
      保守领域(1)总结
      PTZ00335型
      位置:1448
      PTZ00335;微管蛋白α链;临时的

    注释基因组的参考序列:GCF_000001405.40-RS_2023_10

    以下部分包含属于特定基因组构建。解释

    参考GRCh38.p14一次组件

    基因组学

    1. NC_000002.12参考GRCh38.p14初级组件

      范围
      219249710..219254740补码
      下载
      GenBank(基因银行),美国金融服务贸易协会,序列查看器(图形)

    mRNA和蛋白质

    1. XM_047445674.1XP_047301630.1号微管蛋白α-4A链亚型X1

      UniProtKB/TrEMBL公司
      A8JZY9型

    备选T2T-CHM13v2.0

    基因组学

    1. NC_060926.1替代T2T-CHM13v2.0

      范围
      219734477..219739787补码
      下载
      GenBank(基因银行),美国金融服务贸易协会,序列查看器(图形)

    mRNA和蛋白质

    1. XM_054343669.1号XP_054199644.1号微管蛋白α-4A链亚型X1

      UniProtKB/TrEMBL公司
      A8JZY9型