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    坡道1受体(降钙素)活性修饰蛋白1[肌肉(家鼠)]

    基因ID:51801,更新日期2024年5月12日

    总结

    官方符号
    坡道1由提供MGI公司
    官方全名
    受体(降钙素)活性修饰蛋白1由提供MGI公司
    主要来源
    MGI:MGI:1858418
    请参阅相关
    乐团:ENSMUSG00000034353 联盟基因组:MGI:1858418
    基因类型
    蛋白质编码
    RefSeq状态
    已验证
    有机体
    肌肉
    血统
    真核生物;后生动物;脊索动物;克兰亚塔;脊椎动物;真造口术;哺乳动物;Eutheria;尤阿古托格利尔斯;闪光;啮齿动物;肌形态;鼠形目;鼠科;穆里奈;穆斯;穆斯
    也称为
    9130218E19瑞克
    总结
    启用协同受体活动。作用于G蛋白偶联受体信号通路的上游或内部。预计位于细胞外空间。预测为CGRP受体复合物和胰淀素受体复合物1的一部分。预计在细胞表面有活性。预计与质膜共定位。在多种结构中表达,包括肾上腺;消化系统;骨;脑;和生殖系统。与人类RAMP1同源(受体活性修饰蛋白1)。【由基因组资源联盟提供,2022年4月】
    表达式
    在成人胸腺(RPKM 23.9)、成人结肠(RPKM15.0)和16个其他组织中广泛表达查看更多
    直系同源
    新款
    尝试新的基因表
    尝试新的成绩单表

    基因组背景

    参见中的斜坡1基因组数据查看器
    位置:
    1 D;146.08立方厘米
    外显子计数:
    6
    注释发布 状态 装配 Chr公司 位置
    RS_2024_02号 现在的 GRCm39型(合同通用条款000001635.27) 1 NC_000067.7(91107544..91152918)
    108.20200622 上一个程序集 GRC第38页第6页(GCF_000001635.26号) 1 NC_000067.6(91179822..91225196)

    染色体1-NC_000067.7描述相邻基因的基因组上下文 Neighboring gene predicted gene, 35443 Neighboring gene RNA binding motif protein 44 Neighboring gene CapStarr-seq enhancer MGSCv37_chr1:93080001-93080198 Neighboring gene proteasome (prosome, macropain) 28 subunit, alpha pseudogene Neighboring gene CapStarr-seq enhancer MGSCv37_chr1:93089975-93090287 Neighboring gene STARR-positive B cell enhancer ABC_E9471 Neighboring gene STARR-positive B cell enhancer ABC_E498 Neighboring gene ubiquitin-conjugating enzyme E2F (putative) Neighboring gene zinc finger protein 330 pseudogene

    基因组区域、转录物和产物

    表达式

    • 项目名称:小鼠ENCODE转录组数据
    • 描述:由Mouse ENCODE项目生成的RNA分析数据集。
    • 生物项目:PRJNA66167型
    • 出版物:PMID 25409824
    • 分析日期:无

    参考文献

    PubMed中的相关文章

    GeneRIFs:功能的基因引用

    什么是GeneRIF?

    变更

    等位基因

    这类等位基因在《小鼠基因组信息学》上有记载(MGI)
    • 核酸内切酶介导(5)
    • 目标(7)1条引文

    PubChem的途径

    一般基因信息

    克隆名称

    • MGC38240型

    基因本体论 由MGI提供

    过程 证据代码 酒吧
    参与G蛋白偶联受体信号通路 国际律师协会
    从祖先的生物学角度推断
    更多信息
     
    acts_upstream_of_or_within G蛋白偶联受体信号通路 IPI公司
    从物理相互作用推断
    更多信息
    公共医学 
    参与腺苷酸环化酶激活G蛋白偶联受体信号通路 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    参与胰淀素受体信号通路 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    参与血管生成 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    降钙素基因相关肽受体信号通路的参与 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    参与钙离子转运 国际律师协会
    从祖先的生物学角度推断
    更多信息
     
    参与钙离子转运 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    参与细胞对激素刺激的反应 国际律师协会
    从祖先的生物学角度推断
    更多信息
     
    参与细胞内蛋白质转运 国际能源署
    从电子注释推断
    更多信息
     
    参与蛋白质糖基化的正调控 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    参与蛋白在质膜上的定位 国际律师协会
    从祖先的生物学角度推断
    更多信息
     
    参与蛋白在质膜上的定位 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    参与蛋白质转运 国际律师协会
    从祖先的生物学角度推断
    更多信息
     
    参与蛋白质转运 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    参与受体内化 国际律师协会
    从祖先的生物学角度推断
    更多信息
     
    参与受体内化 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    参与G蛋白偶联受体信号通路的调节 国际能源署
    从电子注释推断
    更多信息
     

    一般蛋白质信息

    首选名称
    受体活性修饰蛋白1

    NCBI参考序列(RefSeq)

    新款 尝试新的成绩单表

    独立于注释的RefSeq维护基因组

    这些参考序列独立于基因组构建而存在。解释

    这些参考序列与基因组无关注释循环,因此其版本可能与当前的RefSeq版本不匹配基因组构建。通过比较中RefSeq的版本来确定版本不匹配本节至中报告的那一节基因组区域,成绩单和产品以上。

    mRNA和蛋白质

    1. NM_001168392.1NP_001161864.1号受体活性修饰蛋白1亚型3前体

      状态:已验证

      描述
      转录变体:与变体1相比,该变体(3)在3’UTR和编码区域上有所不同。与亚型1相比,编码的亚型(3)较短,并且具有独特的C末端。
      源序列
      AC102874、BY707433、CB522711
      共识CDS
      CCDS48321.1号文件
      UniProtKB/TrEMBL公司
      A0A087WPC6型
      相关的
      ENSMUSP00000139720.2公司,ENSMUST00000188475.7号
      保守领域(1)总结
      pfam04901型
      位置:3763
      斜坡;受体活性修饰家族
    2. NM_016894.3号NP_058590.1型受体活性修饰蛋白1亚型1前体

      参见NP_058590.1的相同蛋白质及其注释位置

      状态:已验证

      描述
      转录变体:该变体(1)编码最长的亚型(1)。
      源序列
      AC102874、AK165238、BY733497
      共识CDS
      CCDS15158.1号文件
      UniProtKB/Swiss-Prot公司
      问题9WTJ5
      UniProtKB/TrEMBL公司
      Q3TNJ3号
      相关的
      ENSMUSP000000095253.5,ENSMUST00000097648.6
      保守领域(1)总结
      pfam04901型
      位置:38145
      斜坡;受体活性修饰家族
    3. NM_178401.3号NP_848488.2号受体活性修饰蛋白1亚型2前体

      状态:已验证

      描述
      转录变体:与变体1相比,该变体(2)有一个替代的3'外显子。与亚型1相比,产生的亚型(2)具有较短且独特的C末端。
      源序列
      BY733497,CB522711
      共识CDS
      CCDS78648.1号文件
      UniProtKB/TrEMBL公司
      E9Q915型
      相关的
      ENSMUSP00000128679.3号,ENSMUST00000165855.8号
      保守领域(1)总结
      pfam04901型
      位置:3763
      斜坡;受体活性修饰家族

    注释基因组的参考序列:GCF_000001635.27-RS_2024_02

    以下部分包含属于特定基因组构建。解释

    参考GRCm39 C57BL/6J

    基因组学

    1. NC_000067.7参考GRCm39 C57BL/6J

      范围
      91107544..91152918
      下载
      GenBank(基因银行),美国金融服务贸易协会,序列查看器(图形)

    mRNA和蛋白质

    1. XM_017321671.1号XP_017177160.1号受体活性修饰蛋白1异构体X1

      保守领域(1)总结
      辉瑞04901
      位置:15123
      斜坡;受体活性修饰家族