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    热休克蛋白1热休克蛋白家族D(Hsp60)成员1[智人(人类)]

    基因ID:3329,更新于2024年5月5日

    总结

    官方符号
    热休克蛋白1由提供HGNC公司
    官方全名
    热休克蛋白家族D(Hsp60)成员1由提供HGNC公司
    主要来源
    HGNC:HGNC:5261
    请参阅相关
    乐团:ENSG00000144381 MIM:118190; 联盟基因组:HGNC:5261
    基因类型
    蛋白质编码
    RefSeq状态
    检验过的
    有机体
    智人
    血统
    真核生物;后生动物;脊索动物;克兰亚塔;脊椎动物;真造口术;哺乳动物;Eutheria;尤阿古托格利尔斯;灵长类;Haplorhini;卡塔里尼;人科;人类
    也称为
    HLD4;CPN60;GROEL公司;HSP60;HSP65;SPG13;热休克蛋白-60;呼CHA60
    总结
    该基因编码伴侣蛋白家族的一个成员。编码的线粒体蛋白可能在先天免疫系统中起信号分子的作用。该蛋白对线粒体中新输入蛋白质的折叠和组装至关重要。该基因与相关家族成员相邻,两个基因之间的区域起双向启动子的作用。一些假基因与该基因相关。该基因已鉴定出编码相同蛋白质的两个转录变体。与该基因相关的突变可导致常染色体隐性遗传痉挛性截瘫13。[由RefSeq提供,2010年6月]
    表达式
    肾上腺(RPKM 359.2)、肾脏(RPKM152.5)和24个其他组织中普遍表达查看更多
    直系同源
    新款
    尝试新的基因表
    尝试新的成绩单表

    基因组背景

    参见中的HSPD1基因组数据查看器
    位置:
    第2季度33.1
    外显子计数:
    13
    注释发布 状态 装配 Chr公司 位置
    RS_2023_10号 现在的 GRCh38.p14型(GCF_000001405.40) 2 NC_000002.12(197486584..197500274,补码)
    RS_2023_10号 现在的 T2T-CHM13v2.0(GCF_009914755.1号) 2 NC_060926.1(197970209..197983875,补码)
    105.20220307 上一个程序集 GRCh37.p13型(GCF_000001405.25号) 2 NC_000002.11(198351308..198364998,补码)

    染色体2-NC_000002.12描述邻近基因的基因组背景 Neighboring gene RNA, U6 small nuclear 1029, pseudogene Neighboring gene ATAC-STARR-seq lymphoblastoid active region 16934 Neighboring gene ATAC-STARR-seq lymphoblastoid active region 16935 Neighboring gene H3K27ac hESC enhancer GRCh37_chr2:198317938-198318554 Neighboring gene ATAC-STARR-seq lymphoblastoid active region 16938 Neighboring gene coenzyme Q10B Neighboring gene uncharacterized LOC124907951 Neighboring gene small nucleolar RNA, H/ACA box 105B Neighboring gene ATAC-STARR-seq lymphoblastoid silent region 12213 Neighboring gene ATAC-STARR-seq lymphoblastoid silent region 12214 Neighboring gene ATAC-STARR-seq lymphoblastoid active region 16939 Neighboring gene HSPE1-MOB4 readthrough Neighboring gene heat shock protein family E (Hsp10) member 1 Neighboring gene ATAC-STARR-seq lymphoblastoid silent region 12215 Neighboring gene MOB family member 4, phocein Neighboring gene RNY5 pseudogene 2

    基因组区域、转录物和产物

    表达式

    • 项目名称:HPA RNA-seq正常组织
    • 描述:对代表27种不同组织的95名人类个体的组织样本进行RNA-seq,以确定所有蛋白编码基因的组织特异性
    • 生物项目:项目编号:4337
    • 出版物:项目管理标识号24309898
    • 分析日期:2018年4月4日星期三07:08:55

    参考文献

    PubMed中的相关文章

    GeneRIFs:功能的基因引用

    什么是GeneRIF?

    表型

    相关条件

    描述 测验
    遗传性痉挛性截瘫13
    MedGen公司:1854467元 OMIM公司:605280 基因审查:无法使用的
    比较实验室
    髓鞘减退性脑白质营养不良4
    MedGen公司:C2677109号 OMIM公司:612233 基因审查:无法使用的
    比较实验室

    EBI GWAS目录

    描述
    108个精神分裂症相关基因座的生物学见解。

    HIV-1相互作用

    复制交互

    互动 酒吧
    在稳定表达抗宿主shRNA(IPO7、HSPD1或ATG16)或抗HIV shRNA(Pol、RT或Nef)的PM1细胞中使用抗逆转录病毒化合物(T1249、3TC、RAL或IDV)可获得高水平的加性和协同抗逆转录酶活性 公共医学

    蛋白质相互作用

    蛋白质 基因 互动 酒吧
    包膜表面糖蛋白gp120 环境价值 串联亲和纯化和质谱分析鉴定了热休克60kDa蛋白1(HSPD1)、HIV-1 Gag、Gag/Pol、gp120和Nef并入从HIV-1表达细胞分离的staufen1 RNP复合物中 公共医学
    包膜跨膜糖蛋白gp41 环境价值 HIV-1 gp41通过其胞外结构域(Env氨基酸539-684)与热休克蛋白hsp60结合 公共医学
    Gag-Pol公司 gag-pol公司 串联亲和纯化和质谱分析鉴定了热休克60kDa蛋白1(HSPD1)、HIV-1 Gag、Gag/Pol、gp120和Nef并入从HIV-1表达细胞分离的staufen1 RNP复合物中 公共医学
    奈夫 nef(奈夫) 在稳定表达抗宿主shRNA(IPO7、HSPD1或ATG16)或抗HIV shRNA(Pol、RT或Nef)的PM1细胞中使用抗逆转录病毒化合物(T1249、3TC、RAL或IDV)可获得高水平的加性和协同抗逆转录酶活性 公共医学
    nef(奈夫) 串联亲和纯化和质谱分析鉴定了热休克60kDa蛋白1(HSPD1)、HIV-1 Gag、Gag/Pol、gp120和Nef并入从HIV-1表达细胞分离的staufen1 RNP复合物中 公共医学
    波尔 gag-pol公司 在稳定表达抗宿主shRNA(IPO7、HSPD1或ATG16)或抗HIV shRNA(Pol、RT或Nef)的PM1细胞中使用抗逆转录病毒化合物(T1249、3TC、RAL或IDV)可获得高水平的加性和协同抗逆转录酶活性 公共医学
    Pr55(仪表) 堵住 串联亲和纯化和质谱分析鉴定了热休克60kDa蛋白1(HSPD1)、HIV-1 Gag、Gag/Pol、gp120和Nef并入从HIV-1表达细胞分离的staufen1 RNP复合物中 公共医学
    堵住 Hsp60与Hsp70类似,通过与HIV-1 Gag的相互作用而被并入病毒 公共医学
    Tat公司 塔特 HIV-1 Tat上调Jurkat细胞热休克60kDa蛋白1(HSPD1;HSP60)的表达 公共医学
    振动频率 振动频率 HIV-1 Vif与HSPD1相互作用 公共医学
    Vpr(Vpr) 虚拟专用程序 细胞培养中氨基酸的稳定同位素标记结合基于质谱的蛋白质组学确定HIV-1 Vpr在Vpr转导的巨噬细胞中下调热休克60kDa蛋白1(HSPD1)表达 公共医学
    整合酶 gag-pol公司 HSP60与HIV-1整合酶(IN)的催化核心域(氨基酸48-212)结合,稳定IN活性形式并减少酶的热变性,从而刺激IN活性 公共医学
    反胃蛋白酶 gag-pol公司 位置蛋白质组学分析确定HIV-1蛋白酶在氨基酸残基431-432处切割人类热休克60kDa蛋白1线粒体(HSPD1;伴侣蛋白) 公共医学
    逆转录酶 插科打诨 在稳定表达抗宿主shRNA(IPO7、HSPD1或ATG16)或抗HIV shRNA(Pol、RT或Nef)的PM1细胞中使用抗逆转录病毒化合物(T1249、3TC、RAL或IDV)可获得高水平的加性和协同抗逆转录酶活性 公共医学

    转到HIV-1人类交互数据库

    PubChem的途径

    互动

    产品 交互作用剂 其他基因 复杂 来源 酒吧 描述

    一般基因信息

    标记

    基因本体论 GOA提供

    功能 证据代码 酒吧
    启用ATP绑定 国际能源署
    从电子注释推断
    更多信息
     
    启用ATP水解活性 国际空间站
    根据序列或结构相似性推断
    更多信息
     
    启用ATP依赖性蛋白质折叠伴侣 国际能源署
    从电子注释推断
    更多信息
     
    启用DNA复制源绑定 国际空间站
    根据序列或结构相似性推断
    更多信息
     
    启用RNA结合 高达 公共医学 
    启用载脂蛋白A-I结合 IPI公司
    从物理相互作用推断
    更多信息
    公共医学 
    启用载脂蛋白结合 IPI公司
    从物理相互作用推断
    更多信息
    公共医学 
    支持双链RNA结合 国际开发协会
    从直接测定推断
    更多信息
    公共医学 
    启用酶结合 IPI公司
    从物理相互作用推断
    更多信息
    公共医学 
    实现高密度脂蛋白颗粒结合 国际开发协会
    从直接测定推断
    更多信息
    公共医学 
    启用异构酶活性 国际能源署
    从电子注释推断
    更多信息
     
    使脂多糖结合 国际开发协会
    从直接测定推断
    更多信息
    公共医学 
    启用p53绑定 IPI公司
    从物理相互作用推断
    更多信息
    公共医学 
    实现蛋白质结合 IPI公司
    从物理相互作用推断
    更多信息
    公共医学 
    使蛋白质折叠伴侣结合 国际律师协会
    从祖先的生物学角度推断
    更多信息
     
    实现蛋白折叠伴侣结合 IPI公司
    从物理相互作用推断
    更多信息
    公共医学 
    支持单链DNA结合 国际空间站
    根据序列或结构相似性推断
    更多信息
     
    使泛素蛋白连接酶结合 IPI公司
    从物理相互作用推断
    更多信息
    公共医学 
    实现未折叠蛋白质结合 集成电路
    馆长推断
    更多信息
    公共医学 
    实现未折叠蛋白质结合 国际空间站
    根据序列或结构相似性推断
    更多信息
     
    过程 证据代码 酒吧
    参与“从头开始”蛋白质折叠 国际空间站
    根据序列或结构相似性推断
    更多信息
     
    参与B细胞活化 国际开发协会
    从直接测定推断
    更多信息
    公共医学 
    参与B细胞增殖 国际开发协会
    从直接测定推断
    更多信息
    公共医学 
    参与MyD88依赖性toll样受体信号通路 国际开发协会
    从直接测定推断
    更多信息
    公共医学 
    参与T细胞活化 国际律师协会
    从祖先的生物学角度推断
    更多信息
     
    acts_upstream_of_or_with T细胞激活 国际开发协会
    从直接测定推断
    更多信息
    公共医学 
    参与凋亡过程的半胱氨酸型内肽酶活性激活 国际开发协会
    从直接测定推断
    更多信息
    公共医学 
    不涉及共生体与宿主的粘附 国际开发协会
    从直接测定推断
    更多信息
    公共医学 
    参与线粒体凋亡变化 国际律师协会
    从祖先的生物学角度推断
    更多信息
     
    参与与共生体相互作用的生物过程 进口
    根据突变表型推断
    更多信息
    公共医学 
    白细胞介素-7参与细胞反应 国际能源署
    从电子注释推断
    更多信息
     
    参与伴侣介导的蛋白复合物组装 国际空间站
    根据序列或结构相似性推断
    更多信息
     
    involved_in等型转换为IgG等型 伊达
    从直接测定推断
    更多信息
    公共医学 
    参与线粒体未折叠蛋白反应 IBA公司
    从祖先的生物学角度推断
    更多信息
     
    参与凋亡过程的负调控 进口
    根据突变表型推断
    更多信息
    公共医学 
    参与T细胞活化的正调控 国际律师协会
    从祖先的生物学角度推断
    更多信息
     
    参与T细胞活化的正调控 国际开发协会
    从直接测定推断
    更多信息
    公共医学 
    参与T细胞活化的正调控 国际空间站
    根据序列或结构相似性推断
    更多信息
     
    参与T细胞介导的肿瘤细胞免疫反应的正调控 国际开发协会
    从直接测定推断
    更多信息
    公共医学 
    参与凋亡过程的正调控 进口
    根据突变表型推断
    更多信息
    公共医学 
    参与干扰素α产生的正调控 IBA公司
    从祖先的生物学角度推断
    更多信息
     
    参与干扰素α产生的正调控 国际开发协会
    从直接测定推断
    更多信息
    公共医学 
    参与白细胞介素-10产生的正调控 国际开发协会
    从直接测定推断
    更多信息
    公共医学 
    参与白细胞介素-12产生的正调控 国际开发协会
    从直接测定推断
    更多信息
    公共医学 
    参与白细胞介素-6产生的正调控 国际律师协会
    从祖先的生物学角度推断
    更多信息
     
    参与白细胞介素-6产生的正调控 国际开发协会
    从直接测定推断
    更多信息
    公共医学 
    参与巨噬细胞活化的正调控 国际开发协会
    从直接测定推断
    更多信息
    公共医学 
    参与II型干扰素产生的正向调节 国际律师协会
    从祖先的生物学角度推断
    更多信息
     
    acts_upstream_of_or或在II型干扰素生产的正调节范围内 伊达
    从直接测定推断
    更多信息
    公共医学 
    参与II型干扰素产生的正向调节 伊达
    从直接测定推断
    更多信息
    公共医学 
    参与II型干扰素产生的正向调节 国际空间站
    根据序列或结构相似性推断
    更多信息
     
    参与蛋白质折叠 国际律师协会
    从祖先的生物学角度推断
    更多信息
     
    参与蛋白导入线粒体膜间隙 国际律师协会
    从祖先的生物学角度推断
    更多信息
     
    参与蛋白质成熟 国际空间站
    根据序列或结构相似性推断
    更多信息
     
    参与蛋白复性 国际开发协会
    从直接测定推断
    更多信息
    公共医学 
    参与蛋白质稳定 进口
    根据突变表型推断
    更多信息
    公共医学 
    参与蛋白质稳定 国际空间站
    根据序列或结构相似性推断
    更多信息
     
    参与应对寒冷 国际空间站
    根据序列或结构相似性推断
    更多信息
     
    参与对未折叠蛋白的反应 国际开发协会
    从直接测定推断
    更多信息
    公共医学 
    组件 证据代码 酒吧
    位于单元格表面 国际开发协会
    从直接测定推断
    更多信息
    公共医学 
    位于氯氰菊酯涂层坑内 国际开发协会
    从直接测定推断
    更多信息
    公共医学 
    定位于包被囊泡 国际开发协会
    从直接测定推断
    更多信息
    公共医学 
    位于细胞质中 国际开发协会
    从直接测定推断
    更多信息
    公共医学 
    定位于胞浆中 国际开发协会
    从直接测定推断
    更多信息
    公共医学 
    定位于早期内体 国际开发协会
    从直接测定推断
    更多信息
    公共医学 
    定位于胞外外体 高达 公共医学 
    定位于胞外外体 国际开发协会
    从直接测定推断
    更多信息
    公共医学 
    位于细胞外间隙 伊达
    从直接测定推断
    更多信息
    公共医学 
    脂多糖受体复合物的一部分 伊达
    从直接测定推断
    更多信息
    公共医学 
    定位膜 高达 公共医学 
    位于migrasome 国际能源署
    从电子注释推断
    更多信息
     
    线粒体内膜is_active 国际律师协会
    从祖先的生物学角度推断
    更多信息
     
    定位于线粒体内膜 国际空间站
    根据序列或结构相似性推断
    更多信息
     
    线粒体基质中的is_active 国际律师协会
    从祖先的生物学角度推断
    更多信息
     
    线粒体基质中的is_active 国际开发协会
    从直接测定推断
    更多信息
    公共医学 
    定位于线粒体基质 国际开发协会
    从直接测定推断
    更多信息
    公共医学 
    位于线粒体基质中 TAS公司
    可追溯作者声明
    更多信息
    公共医学 
    位于线粒体内 伊达
    从直接测定推断
    更多信息
    公共医学 
    定位于质膜 国际开发协会
    从直接测定推断
    更多信息
    公共医学 
    蛋白质复合物的一部分 国际开发协会
    从直接测定推断
    更多信息
    公共医学 
    定位分泌颗粒 国际空间站
    根据序列或结构相似性推断
    更多信息
     
    位于精子中段 进口
    根据突变表型推断
    更多信息
    公共医学 
    精子质膜定位 国际能源署
    从电子注释推断
    更多信息
     

    一般蛋白质信息

    首选名称
    60kDa热休克蛋白,线粒体
    姓名
    60kDa伴侣蛋白
    P60淋巴细胞蛋白
    监控蛋白60
    附睾分泌精子结合蛋白
    热休克60kDa蛋白1(伴侣蛋白)
    热休克蛋白65
    线粒体基质蛋白P1
    短热休克蛋白60 Hsp60s1
    NP_002147.2号
    编号955472.1

    NCBI参考序列(RefSeq)

    新款 尝试新的成绩单表

    独立于注释的RefSeq维护基因组学

    这些参考序列独立于基因组构建而存在。解释

    这些参考序列与基因组无关注释循环,因此其版本可能与当前的RefSeq版本不匹配基因组构建。通过比较中RefSeq的版本来确定版本不匹配本节至中报告的那一节基因组区域,成绩单和产品以上。

    基因组学

    1. NG_008915.1参考SeqGene

      范围
      5435.18691年
      下载
      GenBank(基因银行),美国金融服务贸易协会,序列查看器(图形)

    mRNA和蛋白质

    1. NM_002156.5号NP_002147.2号60kDa热休克蛋白,线粒体

      参见NP_002147.2的相同蛋白质及其注释位置

      状态:已审阅

      描述
      成绩单变体:此变体(1)表示较长的成绩单。变体1和2编码相同的蛋白质。
      源序列
      AU098504,BC002676
      共识CDS
      CCDS33357.1号
      UniProtKB/Swiss-Prot公司
      B2R5M6型,B7Z712型,第10809页,问题38L19,问题9UCR6
      UniProtKB/TrEMBL公司
      A0A024R3W0型,A0A024R3X4级,B3GQS7型
      相关的
      ENSP0000373620.3号文件,ENST00000388968.8号
      保守领域(1)总结
      cd03344
      位置:28548
      GroEL;GroEL_like I型伴侣蛋白。伴侣蛋白参与蛋白质的生产性折叠。它们具有共同的一般形态,由两个堆叠的环组成的双环形,每个环由7-9个亚基组成。类型I的对称性是7倍,它们被发现。。。
    2. NM_199440.2NP_955472.1号60kDa热休克蛋白,线粒体

      参见NP_955472.1的相同蛋白质及其注释位置

      状态:已审阅

      描述
      成绩单变体:与变体1相比,该变体(2)在5'UTR上有所不同。变体1和2编码相同的亚型。
      源序列
      BC002676、BG701476
      共识CDS
      CCDS33357.1号
      UniProtKB/Swiss-Prot公司
      B2R5M6型,B7Z712型,第10809页,问题38L19,第9季度ucr6
      UniProtKB/TrEMBL公司
      A0A024R3W0型,A0A024R3X4型,B3GQS7型
      相关的
      ENSP00000340019.2号文件,ENST00000345042.6标准
      保守领域(1)总结
      cd03344
      位置:28548
      GroEL;GroEL_like I型伴侣蛋白。伴侣蛋白参与蛋白质的生产性折叠。它们具有共同的一般形态,由两个堆叠的环组成的双环形,每个环由7-9个亚基组成。类型I的对称性是7倍,它们被发现。。。

    注释基因组的参考序列:GCF_000001405.40-RS_2023_10

    以下部分包含属于特定基因组构建。解释

    参考GRCh38.p14一次组件

    基因组学

    1. NC_000002.12参考GRCh38.p14主要组件

      范围
      197486584..197500274补码
      下载
      GenBank(基因银行),美国金融服务贸易协会,序列查看器(图形)

    备选T2T-CHM13v2.0

    基因组学

    1. NC_060926.1替代T2T-CHM13v2.0

      范围
      197970209.-197983875补码
      下载
      GenBank(基因银行),美国金融服务贸易协会,序列查看器(图形)