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    H2AX型H2A。X变异组蛋白[智人(人类)]

    基因ID:3014,更新日期2024年5月5日

    总结

    官方符号
    h2最大值由提供HGNC公司
    官方全名
    H2A。X变异组蛋白由提供HGNC公司
    主要来源
    HGNC:HGNC:4739
    请参阅相关
    乐团:ENSG00000188486 MIM:601772; 联盟基因组:HGNC:4739
    基因类型
    蛋白质编码
    RefSeq状态
    检验过的
    有机体
    智人
    血统
    真核生物;后生动物;脊索动物;克兰亚塔;脊椎动物;真造口术;哺乳动物;Eutheria属;尤阿古托格利尔斯;灵长类;Haplorrhini公司;卡塔里尼;人科;人类
    也称为
    H2A。X;H2A/X;H2AFX公司
    总结
    组蛋白是真核生物中负责染色体纤维核小体结构的基本核蛋白。四个核心组蛋白(H2A、H2B、H3和H4)中每一个的两个分子形成八聚体,约146 bp的DNA被包裹在重复单元中,称为核小体。连接体组蛋白H1与核小体之间的连接体DNA相互作用,并在染色质压缩成高阶结构中发挥作用。该基因编码组蛋白H2A家族成员的复制独立组蛋白,并通过使用保守的干环终止基序和polyA加成基序生成两个转录物。[由RefSeq提供,2015年10月]
    直系同源
    新款
    尝试新的基因表
    尝试新的成绩单表

    基因组背景

    请参阅中的H2AX基因组数据查看器
    位置:
    11季度23.3
    外显子计数:
    1
    注释发布 状态 装配 Chr公司 位置
    RS_2023_10号 现在的 GRCh38.p14型(GCF_000001405.40) 11 NC_000011.10(119093874..119095465,补遗)
    RS_2023_10号 现在的 T2T-CHM13v2.0(GCF_009914755.1号) 11 NC_060935.1(119114257..119115848,补码)
    105.20220307 上一个程序集 GRCh37.p13型(GCF_000001405.25号) 11 NC_000011.9(118964584..118966175,补体)

    11号染色体-NC_000011.10描述邻近基因的基因组背景 Neighboring gene ATAC-STARR-seq lymphoblastoid active region 5619 Neighboring gene ATAC-STARR-seq lymphoblastoid active region 5620 Neighboring gene VPS11 core subunit of CORVET and HOPS complexes Neighboring gene H3K27ac hESC enhancer GRCh37_chr11:118955192-118955889 Neighboring gene hydroxymethylbilane synthase Neighboring gene H3K4me1 hESC enhancer GRCh37_chr11:118963458-118963970 Neighboring gene NANOG-H3K27ac-H3K4me1 hESC enhancer GRCh37_chr11:118965105-118965668 Neighboring gene NANOG-H3K27ac-H3K4me1 hESC enhancer GRCh37_chr11:118965669-118966232 Neighboring gene NANOG-H3K27ac-H3K4me1 hESC enhancer GRCh37_chr11:118966233-118966796 Neighboring gene H3K27ac hESC enhancer GRCh37_chr11:118966797-118967358 Neighboring gene dolichyl-phosphate N-acetylglucosaminephosphotransferase 1 Neighboring gene BRD4-independent group 4 enhancer GRCh37_chr11:118972216-118973415 Neighboring gene ATAC-STARR-seq lymphoblastoid silent region 3968 Neighboring gene ATAC-STARR-seq lymphoblastoid silent region 3969 Neighboring gene C2CD2 like Neighboring gene ATAC-STARR-seq lymphoblastoid silent region 3970 Neighboring gene histone H4 transcription factor

    基因组区域、转录物和产物

    参考文献

    GeneRIFs:功能的基因引用

    什么是GeneRIF?

    HIV-1相互作用

    蛋白质相互作用

    蛋白质 基因 互动 酒吧
    Tat公司 塔特 HIV-1 Tat肽结合核心组蛋白H2A、H2B、H3和H4,Tat蛋白向HIV-1 LTR启动子招募组蛋白乙酰转移酶,导致组蛋白H3和H4乙酰化,脱去染色质结构并增加NFkappaB反应性 公共医学
    Vpr公司 虚拟专用程序 可溶性HIV-1 Vpr通过形成含H2AX和53BP1的DNA修复灶诱导DNA损伤反应 公共医学
    虚拟专用程序 HIV-1 Vpr在HeLa细胞和人原代CD4+淋巴细胞中的表达诱导H2AFX磷酸化并形成含有H2AFX和BRCA1的核病灶 公共医学
    虚拟专用程序 需要招募催化活性的CRL4A(VPRBP)复合物来观察HIV-1 Vpr相互作用的未知细胞泛素化蛋白。H2AX的磷酸化需要Vpr诱导的K48残基多泛素化 公共医学
    虚拟专用程序 HIV-1 Vpr结合DCAF1并激活肾小管上皮细胞的DNA损伤反应,与对照组相比,肾小管中γ-H2AX阳性细胞核丰富 公共医学
    整合酶 gag-pol公司 HIV-1IN介导的前病毒DNA整合在HIV-1感染期间触发细胞死亡。病毒整合过程中的杀伤机制涉及DNA-PK的激活,这会导致p53和组蛋白γH2AX的磷酸化 公共医学

    转到HIV-1人类交互数据库

    PubChem的途径

    互动

    产品 交互作用剂 其他基因 复杂 来源 酒吧 描述

    一般基因信息

    标记

    基因本体论 GOA提供

    一般蛋白质信息

    首选名称
    组蛋白H2AX
    姓名
    H2A组蛋白家族成员X
    H2AX组蛋白
    组蛋白H2A。x个

    NCBI参考序列(RefSeq)

    新款 尝试新的成绩单表

    独立于注释维护的参考序列基因组

    这些参考序列独立于基因组构建而存在。解释

    这些参考序列与基因组无关注释循环,因此其版本可能与当前的RefSeq版本不匹配基因组构建。通过比较中RefSeq的版本来确定版本不匹配本节至中报告的那一节基因组区域,成绩单和产品以上。

    mRNA和蛋白质

    1. NM_002105.3号NP_002096.1号组蛋白H2AX

      参见NP_002096.1的相同蛋白质及其注释位置

      状态:已审阅

      源序列
      AP003391号
      共识CDS
      CCDS8410.1中
      UniProtKB/Swiss-Prot公司
      第16104页,第4季度第7季度,问题6IAS5
      UniProtKB/TrEMBL公司
      B2R5B3型
      相关的
      ENSP0000434024.1标准,ENST00000530167.2标准
      保守领域(1)总结
      PTZ00017型
      位置:1131
      PTZ00017;组蛋白H2A;临时的

    注释基因组的参考序列:GCF_000001405.40-RS_2023_10

    以下部分包含属于特定基因组构建。解释

    参考GRCh38.p14一次组件

    基因组学

    1. NC_000011.10参考GRCh38.p14初级组件

      范围
      119093874..119095465补码
      下载
      GenBank(基因银行),美国金融服务贸易协会,序列查看器(图形)

    备选T2T-CHM13v2.0

    基因组学

    1. NC_060935.1替代T2T-CHM13v2.0

      范围
      119114257..119115848补码
      下载
      GenBank(基因银行),美国金融服务贸易协会,序列查看器(图形)