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    22美元泛素特异性肽酶22[小家鼠(家鼠)]

    基因ID:216825,更新日期2024年5月12日

    总结

    官方符号
    22美元由提供MGI公司
    官方全名
    泛素特异性肽酶22由提供MGI公司
    主要来源
    MGI:MGI:2144157
    请参阅相关
    恩森布尔:ENSMUSG0000042506 联盟基因组:MGI:2144157
    基因类型
    蛋白质编码
    RefSeq状态
    已验证
    有机体
    小家鼠
    血统
    真核生物;后生动物;脊索动物;克兰亚塔;脊椎动物;真造口术;哺乳动物;Eutheria;Euarchontoglires语;闪光;啮齿动物;变形肌;鼠形目;鼠科;穆里奈;穆斯;穆斯
    总结
    启用硫醇依赖性氘化酶。作用于蛋白质去泛素化的上游或内部。预计位于核内。预计为SAGA复合体的一部分。以多种结构表达,包括消化系统;中枢神经系统;眼睛;泌尿生殖系统;和呼吸系统。与人类USP22同源(泛素特异性肽酶22)。【由基因组资源联盟提供,2022年4月】
    表达式
    在中枢神经系统E18(RPKM 112.1)、全脑E14.5(RPKM 101.1)和其他27种组织中广泛表达查看更多
    直系同源
    新款
    尝试新的基因表
    尝试新的成绩单表

    基因组背景

    请参阅中的Usp22基因组数据查看器
    位置:
    11 B2;11 37.96立方厘米
    外显子计数:
    13
    注释发布 状态 装配 Chr公司 位置
    RS_2024_02号 现在的 GRCm39型(GCF_000001635.27号) 11 NC_000077.7(61042607..61065885,补码)
    108.20200622 上一个程序集 GRCm38.p6型(GCF_000001635.26号) 11 NC_000077.6(61151781..61175059,补遗)

    染色体11-NC_000077.7描述邻近基因的基因组背景 Neighboring gene potassium inwardly-rectifying channel, subfamily J, member 12 Neighboring gene STARR-positive B cell enhancer ABC_E8878 Neighboring gene STARR-positive B cell enhancer ABC_E5234 Neighboring gene STARR-positive B cell enhancer ABC_E8412 Neighboring gene tumor necrosis factor receptor superfamily, member 13b Neighboring gene STARR-positive B cell enhancer ABC_E3956 Neighboring gene CapStarr-seq enhancer MGSCv37_chr11:60973670-60973823 Neighboring gene STARR-positive B cell enhancer ABC_E374 Neighboring gene STARR-seq mESC enhancer starr_29671 Neighboring gene predicted gene, 42080 Neighboring gene ribosomal protein S13, pseudogene 5

    基因组区域、转录物和产物

    表达式

    • 项目名称:鼠标ENCODE转录组数据
    • 描述:鼠标ENCODE项目生成的RNA分析数据集。
    • 生物项目:PRJNA66167型
    • 出版物:PMID 25409824
    • 分析日期:无

    参考文献

    GeneRIFs:功能的基因引用

    什么是GeneRIF?

    变更

    等位基因

    这类等位基因在《小鼠基因组信息学》上有记载(MGI)

    互动

    产品 交互作用剂 其他基因 综合体 来源 酒吧 说明

    一般基因信息

    标记

    克隆名称

    • KIAA1063、MGC91200

    基因本体论 由MGI提供

    组件 证据代码 酒吧
    SAGA复合体的一部分 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    SAGA复合体的一部分 北美
    不可追踪的作者声明
    更多信息
    公共医学 
    位于核内 国际能源署
    从电子注释推断
    更多信息
     
    部分转录因子TFTC复合物 北美
    不可追踪的作者声明
    更多信息
    公共医学 

    一般蛋白质信息

    首选名称
    泛素羧基末端水解酶22
    姓名
    去泛素酶22
    泛素特异性蛋白酶22
    泛素硫酯酶22
    泛素硫酯酶22
    泛素特异性加工蛋白酶22
    NP_001004143.2号

    NCBI参考序列(RefSeq)

    新款 尝试新的成绩单表

    独立于注释的RefSeq维护基因组

    这些参考序列独立于基因组构建而存在。解释

    这些参考序列与基因组无关注释循环,因此其版本可能与当前的RefSeq版本不匹配基因组构建。通过比较中RefSeq的版本来确定版本不匹配本节为中报告的基因组区域,成绩单和产品以上。

    mRNA和蛋白质

    1. NM_001004143.4号NP_001004143.2号泛素羧基末端水解酶22

      参见NP_001004143.2的相同蛋白质及其注释位置

      状态:已验证

      源序列
      AK160992,AL646093
      共识CDS
      CCDS24807.1号文件
      UniProtKB/Swiss-Prot公司
      Q3TU34问题,问题3U2W4,Q5DU02型,Q5SU81型,Q66JV8型,Q6PDX3,Q8BJG3问题
      相关的
      ENSMUSP000000041263.9号,ENSMUST00000041683.9号
      保守领域(2)总结
      cd02660
      位置:176518
      肽酶_C19D;肽酶C19的一个亚科。肽酶C19含有泛素水解酶。它们是细胞内肽酶,通过裂解异肽键,从多泛素肽中去除泛素分子。它们水解涉及羧基的键。。。
      pfam02148型
      位置:63123
      zf-UBP;泛素水解酶和其他蛋白质中的Zn-finger

    注释基因组的参考序列:GCF_000001635.27-RS_2024_02

    以下部分包含属于特定基因组构建。解释

    参考GRCm39 C57BL/6J

    基因组学

    1. NC_000077.7参考GRCm39 C57BL/6J

      范围
      61042607..61065885补充
      下载
      发电厂银行,美国金融服务贸易协会,序列查看器(图形)