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    草皮1可溶性超氧化物歧化酶1[小家鼠(家鼠)]

    基因ID:20655,更新日期2024年6月4日

    摘要

    官方符号
    草皮1由提供MGI公司
    官方全名
    可溶性超氧化物歧化酶1由提供MGI公司
    主要来源
    MGI:MGI:98351
    请参阅相关
    乐团:ENSMUSG00000022982 联盟基因组:MGI:98351
    基因类型
    蛋白质编码
    RefSeq状态
    已验证
    有机体
    小家鼠
    血统
    真核生物;后生动物;脊索动物;克兰亚塔;脊椎动物;真造口术;哺乳动物;Eutheria;尤阿古托格利尔斯;闪光;啮齿动物;肌形态;鼠形目;鼠科;Murinae公司;穆斯;Mus公司
    也称为
    Ipo1;SODC;Ipo-1;草皮-1;CuZnSOD;铜锌超氧化物歧化酶;B430204E11里克
    摘要
    启用超氧化物歧化酶活性。参与轴突运输;炎症反应负调控;以及吞噬作用的正向调节。作用于几个过程的上游或内部,包括过氧化氢生物合成过程;肌细胞内稳态;和神经发生。位于细胞外空间。以多种结构表达,包括消化系统;脑;泌尿生殖系统;呼吸系统;和感觉器官。用于研究肌萎缩侧索硬化1型;干眼综合征;和低眼压性青光眼。该基因的人类同源基因与多种疾病有关,包括唐氏综合征;动脉疾病(多发性);眼病(多发);糖代谢病(多发性);和神经变性疾病(多发性)。与人SOD1同源(超氧化物歧化酶1)。【由基因组资源联盟提供,2022年4月】
    表达式
    在成人肝组织(RPKM 521.8)、E14肝组织(RTKM 341.6)和28个其他组织中普遍表达查看更多
    直系同源
    新款
    尝试新的基因表
    尝试新的成绩单表

    基因组背景

    请参阅中的Sod1基因组数据查看器
    位置:
    16 C3.3;16 51.56立方厘米
    外显子计数:
    5
    注释发布 状态 装配 Chr公司 位置
    RS_2024_02版本 现在的 GRC立方米39(GCF_000001635.27号) 16 NC_000082.7(90017650..900221)
    108.20200622 上一个程序集 GRCm38.p6型(GCF_000001635.26号) 16 NC_000082.6(90220762..90226333)

    染色体16-NC_000082.7描述邻近基因的基因组背景 Neighboring gene STARR-seq mESC enhancer starr_41438 Neighboring gene ferritin light chain 1 pseudogene Neighboring gene STARR-seq mESC enhancer starr_41441 Neighboring gene predicted gene, 35714 Neighboring gene SR-related CTD-associated factor 4 Neighboring gene STARR-seq mESC enhancer starr_41449 Neighboring gene STARR-positive B cell enhancer ABC_E9936 Neighboring gene STARR-seq mESC enhancer starr_41451 Neighboring gene STARR-positive B cell enhancer mm9_chr16:90341938-90342239 Neighboring gene STARR-seq mESC enhancer starr_41453 Neighboring gene STARR-seq mESC enhancer starr_41454 Neighboring gene hormonally upregulated Neu-associated kinase Neighboring gene VISTA enhancer mm1672 Neighboring gene predicted gene, 35882

    基因组区域、转录物和产物

    表达式

    • 项目名称:鼠标ENCODE转录组数据
    • 描述:由Mouse ENCODE项目生成的RNA分析数据集。
    • 生物项目:PRJNA66167型
    • 出版物:邮编25409824
    • 分析日期:无

    参考文献

    GeneRIFs:功能的基因引用

    什么是GeneRIF?

    变更

    等位基因

    这类等位基因在《小鼠基因组信息学》上有记载(MGI)
    • 化学诱导(ENU)(1)
    • 核酸内切酶介导(9)
    • 目标(9)1条引文

    PubChem的途径

    互动

    产品 交互作用剂 其他基因 复杂 来源 酒吧 说明

    一般基因信息

    标记

    克隆名称

    • MGC107553型

    基因本体论 由MGI提供

    功能 证据代码 酒吧
    具有抗氧化活性 国际能源署
    从电子注释推断
    更多信息
     
    启用铜离子绑定 国际律师协会
    从祖先的生物学角度推断
    更多信息
     
    启用铜离子绑定 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    启用酶结合 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    能够实现相同的蛋白质结合 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    启用金属离子绑定 国际能源署
    从电子注释推断
    更多信息
     
    激活氧化还原酶活性 国际能源署
    从电子注释推断
    更多信息
     
    实现蛋白质结合 IPI公司
    从物理相互作用推断
    更多信息
    公共医学 
    使蛋白磷酸酶2B结合 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    实现蛋白折叠伴侣结合 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    启用小GTPase绑定 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    激活超氧化物歧化酶活性 国际律师协会
    从祖先的生物学角度推断
    更多信息
     
    激活超氧化物歧化酶活性 国际开发协会
    根据直接分析推断
    更多信息
    公共医学 
    激活超氧化物歧化酶活性 进口
    根据突变表型推断
    更多信息
    公共医学 
    激活超氧化物歧化酶活性 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    激活超氧化物歧化酶活性 TAS公司
    可追溯作者声明
    更多信息
    公共医学 
    实现锌离子结合 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    过程 证据代码 酒吧
    动作_上游_of_or动作电位启动内 进口
    根据突变表型推断
    更多信息
    公共医学 
    参与顺行轴突运输 进口
    根据突变表型推断
    更多信息
    公共医学 
    凋亡过程上游因子 进口
    根据突变表型推断
    更多信息
    公共医学 
    听觉受体细胞立体纤毛组织内的acts上游 进口
    根据突变表型推断
    更多信息
    公共医学 
    acts_upstream_of_or成人寿命测定范围内 进口
    根据突变表型推断
    更多信息
    公共医学 
    异位生殖细胞程序性细胞死亡的上游因素 进口
    根据突变表型推断
    更多信息
    公共医学 
    acts上游of或胚胎着床内 进口
    根据突变表型推断
    更多信息
    公共医学 
    acts上游of或基因表达内 进口
    根据突变表型推断
    更多信息
    公共医学 
    acts上游of或谷胱甘肽代谢过程中 进口
    根据突变表型推断
    更多信息
    公共医学 
    心脏收缩上游或内部活动 进口
    根据突变表型推断
    更多信息
    公共医学 
    参与心脏收缩 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    过氧化氢生物合成过程中的上游效应 进口
    根据突变表型推断
    更多信息
    公共医学 
    参与过氧化氢生物合成过程 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    acts上游或细胞内铁离子稳态 进口
    根据突变表型推断
    更多信息
    公共医学 
    动作_上游_of_或在运动行为内 进口
    根据突变表型推断
    更多信息
    公共医学 
    acts上游of或肌细胞内细胞内稳态 进口
    根据突变表型推断
    更多信息
    公共医学 
    acts上游of或髓样细胞内稳态 IGI公司
    从遗传相互作用推断
    更多信息
    公共医学 
    acts上游of或髓样细胞内稳态 进口
    根据突变表型推断
    更多信息
    公共医学 
    acts_upstream_of_or在凋亡过程的负调控中 国际开发协会
    根据直接分析推断
    更多信息
    公共医学 
    acts_upstream_of_or在凋亡过程的负调控中 进口
    根据突变表型推断
    更多信息
    公共医学 
    参与凋亡过程的负调控 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    参与胆固醇生物合成过程的负调控 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    acts_upstream_of_or在发育过程的负调控中 进口
    根据突变表型推断
    更多信息
    公共医学 
    参与炎症反应的负调控 IGI公司
    从遗传相互作用推断
    更多信息
    公共医学 
    acts_upstream_of_or_within对神经元凋亡过程的负调控 进口
    根据突变表型推断
    更多信息
    公共医学 
    acts_upstream_of_or内生殖过程负调控 进口
    根据突变表型推断
    更多信息
    公共医学 
    acts上游of或神经丝细胞骨架组织内 IGI公司
    从遗传相互作用推断
    更多信息
    公共医学 
    acts上游of或神经丝细胞骨架组织内 进口
    根据突变表型推断
    更多信息
    公共医学 
    acts上游of或神经元动作电位内 进口
    根据突变表型推断
    更多信息
    公共医学 
    acts上游或卵泡内发育 进口
    根据突变表型推断
    更多信息
    公共医学 
    acts上游of或周围神经系统内髓鞘维持 进口
    根据突变表型推断
    更多信息
    公共医学 
    acts_upstream_of_or_within MAPK级联的正调节 国际开发协会
    根据直接分析推断
    更多信息
    公共医学 
    参与催化活性的正调节 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    参与细胞因子产生的正调控 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    参与氧化应激诱导的内源性凋亡信号通路的正调控 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    参与吞噬作用的正调控 IGI公司
    从遗传相互作用推断
    更多信息
    公共医学 
    参与超氧阴离子生成的正调控 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    参与活性氧代谢过程 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    参与GTPase活性的调节 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    acts_upstream_of_or血压调节范围内 进口
    根据突变表型推断
    更多信息
    公共医学 
    线粒体膜电位的调控 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    acts_upstream_of_or对多细胞生物生长的调节 进口
    根据突变表型推断
    更多信息
    公共医学 
    蛋白激酶活性的调控 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    acts_upstream_of_of_within血管相关平滑肌松弛 进口
    根据突变表型推断
    更多信息
    公共医学 
    参与清除超氧自由基 国际律师协会
    从祖先的生物学角度推断
    更多信息
     
    acts_upstream_of_or内清除超氧自由基 IGI公司
    从遗传相互作用推断
    更多信息
    公共医学 
    acts_upstream_of_or内清除超氧自由基 进口
    根据突变表型推断
    更多信息
    公共医学 
    参与清除超氧自由基 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    acts_upstream_of_or内清除超氧自由基 TAS公司
    可追溯作者声明
    更多信息
    公共医学 
    actits_upstream_of_or对轴突损伤的反应 进口
    根据突变表型推断
    更多信息
    公共医学 
    参与对铜离子的反应 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    acts_upstream_of_or对乙醇的反应 进口
    根据突变表型推断
    更多信息
    公共医学 
    acts_upstream_of_or在热响应范围内 进口
    根据突变表型推断
    更多信息
    公共医学 
    动作_上游_of_或在对过氧化氢的响应范围内 进口
    根据突变表型推断
    更多信息
    公共医学 
    与营养水平有关 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    参与对有机物的反应 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    acts_upstream_of_or对氧化应激的反应 国际开发协会
    根据直接分析推断
    更多信息
    公共医学 
    acts_upstream_of_or对氧化应激的反应 进口
    根据突变表型推断
    更多信息
    公共医学 
    参与氧化应激反应 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    acts_upstream_of_or对活性氧物种的反应 进口
    根据突变表型推断
    更多信息
    公共医学 
    超氧化物反应中的上游行为 进口
    根据突变表型推断
    更多信息
    公共医学 
    参与对超氧化物的反应 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    对外来刺激的反应中的上游行为 进口
    根据突变表型推断
    更多信息
    公共医学 
    acts上游of或视网膜内稳态 进口
    根据突变表型推断
    更多信息
    公共医学 
    参与逆行轴突运输 进口
    根据突变表型推断
    更多信息
    公共医学 
    acts_upstream_of_or或在声音的感官感知范围内 进口
    根据突变表型推断
    更多信息
    公共医学 
    精子发生中的上游活动 进口
    根据突变表型推断
    更多信息
    公共医学 
    超氧化物阴离子生成中的上游行为 国际开发协会
    根据直接分析推断
    更多信息
    公共医学 
    超氧化物代谢过程中的上游行为 进口
    根据突变表型推断
    更多信息
    公共医学 
    参与超氧化物代谢过程 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    神经冲动传递中的上游动作 进口
    根据突变表型推断
    更多信息
    公共医学 
    组件 证据代码 酒吧
    位于细胞质中 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
    公共医学 
    位于细胞质中 TAS公司
    可追溯作者声明
    更多信息
    公共医学 
    定位于细胞质小泡 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    胞浆中的活性 国际律师协会
    从祖先的生物学角度推断
    更多信息
     
    定位于胞浆中 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    位于树突细胞质中 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    定位于致密核心颗粒 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    位于细胞外区域 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    位于细胞外间隙 HDA公司 公共医学 
    位于细胞外间隙 国际开发协会
    根据直接分析推断
    更多信息
    公共医学 
    位于细胞外间隙 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    定位于溶酶体 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    定位于线粒体膜间隙 TAS公司
    可追溯作者声明
    更多信息
     
    位于线粒体内 HDA公司 公共医学 
    线粒体内有活性 国际律师协会
    从祖先的生物学角度推断
    更多信息
     
    位于线粒体内 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    位于髓鞘内 HDA公司 公共医学 
    定位于神经元细胞体 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    核质定位 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    在核心中是活动的 国际律师协会
    从祖先的生物学角度推断
    更多信息
     
    位于核内 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    过氧化物酶体中的活性 国际律师协会
    从祖先的生物学角度推断
    更多信息
     
    定位于过氧化物酶体 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    与质膜共定位 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    蛋白质复合物的一部分 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    定位分泌颗粒 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     

    一般蛋白质信息

    首选名称
    超氧化物歧化酶
    姓名
    Cu(2+)-Zn2+超氧化物歧化酶
    NP_035564.1号

    NCBI参考序列(RefSeq)

    新款 尝试新的成绩单表

    独立于注释的RefSeq维护基因组学

    这些参考序列独立于基因组构建而存在。解释

    这些参考序列与基因组无关注释循环,因此其版本可能与当前的RefSeq版本不匹配基因组构建。通过比较中RefSeq的版本来确定版本不匹配本节至中报告的那一节基因组区域,成绩单和产品以上。

    mRNA和蛋白质

    1. NM_011434.2NP_035564.1号超氧化物歧化酶

      参见NP_035564.1的相同蛋白质及其注释位置

      状态:已验证

      源序列
      BC048874、BE989579
      共识CDS
      CCDS37395.1号文件
      UniProtKB/Swiss-Prot公司
      P08228号
      相关的
      ENSMUSP000000023707.10,ENSMUST00000023707.11号
      保守领域(1)总结
      cd00305号
      位置:147
      Cu-Zn_超氧化物歧化酶;铜/锌超氧化物歧化酶(SOD)。超氧化物歧化酶催化超氧化物自由基转化为分子氧。已知SOD的三个进化上不同的家族,其中铜/锌结合家族是其中之一。…中的缺陷。。。

    注释基因组的参考序列:GCF_000001635.27-RS_2024_02

    以下部分包含属于特定基因组构建。解释

    参考GRCm39 C57BL/6J

    基因组学

    1. NC_000082.7参考GRCm39 C57BL/6J

      范围
      90017650..90023221
      下载
      GenBank(基因银行),美国金融服务贸易协会,序列查看器(图形)