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    Ret公司ret原癌基因[小家鼠(家鼠)]

    基因ID:19713,更新日期2024年5月21日

    总结

    官方符号
    Ret公司由提供MGI公司
    官方全名
    ret原癌基因由提供MGI公司
    主要来源
    MGI:MGI:97902
    请参阅相关
    乐团:ENSMUSG00000030110 联盟基因组:MGI:97902
    基因类型
    蛋白质编码
    RefSeq状态
    已验证
    有机体
    小家鼠
    血统
    真核生物;后生动物;弦线;颅亚目;脊椎动物;真造口术;哺乳动物;Eutheria;尤阿古托格利尔斯;闪光;啮齿动物;肌形态;鼠形目;鼠科;穆里奈;穆斯;穆斯
    也称为
    PTC;RET9;RET51;c-Ret公司
    总结
    激活跨膜受体蛋白酪氨酸激酶活性。参与多个过程,包括派尔斑形成;神经元细胞粘附;积极调节后肾小球的发育。多个过程的上游或内部行为,包括动物器官发育;神经系统发育;积极调节大分子代谢过程。预计位于几个细胞成分中,包括内体;膜筏;和神经元细胞体。预测为质膜蛋白复合物和受体复合物的一部分。预测在轴突中有活性。预测为质膜的组成部分。表现为多种结构,包括鳃弓;泌尿生殖系统;肠道;神经系统;和感觉器官。用于研究先天性巨结肠;马蹄内翻足;多发性内分泌肿瘤2B型;嗜铬细胞瘤。该基因的人类直系同源物与先天性巨结肠有关;家族性甲状腺髓样癌;多发性内分泌腺瘤2A型;多发性内分泌肿瘤2B型;嗜铬细胞瘤。与人类RET(RET原癌基因)同源。【由基因组资源联盟提供,2022年4月】
    表达式
    在成人小脑(RPKM 5.3)、成人皮下脂肪垫(RPKM4.5)和18个其他组织中广泛表达查看更多
    直系同源
    新款
    尝试新的基因表
    尝试新的成绩单表

    基因组背景

    请参见中的Ret基因组数据查看器
    位置:
    6层;655.86立方厘米
    外显子计数:
    19
    注释发布 状态 装配 Chr公司 位置
    RS_2024_02号 现在的 GRCm39型(GCF_000001635.27号) 6 NC_000072.7(118128709..118174705,补码)
    108.20200622 上一个程序集 GRCm38.p6型(GCF_000001635.26号) 6 NC_000072.6(118151748..118197744,补体)

    染色体6-NC_000072.7描述邻近基因的基因组背景 Neighboring gene RasGEF domain family, member 1A Neighboring gene microRNA 7044 Neighboring gene chondroitin sulfate N-acetylgalactosaminyltransferase 2 Neighboring gene predicted gene, 23908 Neighboring gene STARR-positive B cell enhancer ABC_E6475 Neighboring gene CapStarr-seq enhancer MGSCv37_chr6:118117270-118117379 Neighboring gene STARR-positive B cell enhancer ABC_E2800 Neighboring gene STARR-seq mESC enhancer starr_17135 Neighboring gene RIKEN cDNA 1700069P05 gene Neighboring gene predicted gene, 30557

    基因组区域、转录物和产物

    表达式

    • 项目名称:小鼠ENCODE转录组数据
    • 描述:由Mouse ENCODE项目生成的RNA分析数据集。
    • 生物项目:PRJNA66167型
    • 出版物:PMID 25409824
    • 分析日期:无

    参考文献

    GeneRIFs:功能的基因引用

    什么是GeneRIF?

    变更

    等位基因

    这类等位基因在《小鼠基因组信息学》上有记载(MGI)

    PubChem的途径

    互动

    产品 交互作用剂 其他基因 复杂 来源 酒吧 描述

    一般基因信息

    标记

    基因本体论 由MGI提供

    过程 证据代码 酒吧
    acts_upstream_of_or_within MAPK级联 IGI公司
    从遗传相互作用推断
    更多信息
    公共医学 
    参与派尔斑形成 进口
    根据突变表型推断
    更多信息
    公共医学 
    参与凋亡过程的半胱氨酸型内肽酶活性激活 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    acts上游of或解剖结构内形态发生 TAS公司
    可追溯作者声明
    更多信息
    公共医学 
    acts_upstream_of_or细胞内粘附 国际能源署
    从电子注释推断
    更多信息
     
    参与细胞表面受体蛋白酪氨酸激酶信号通路 国际律师协会
    从祖先的生物学角度推断
    更多信息
     
    acts上游of或细胞内表面受体蛋白酪氨酸激酶信号通路 IGI公司
    从遗传相互作用推断
    更多信息
    公共医学 
    参与细胞对维甲酸的反应 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    acts上游of或胚胎上皮管形成内 IGI公司
    从遗传相互作用推断
    更多信息
    公共医学 
    肠神经系统发育中的上游活动 进口
    根据突变表型推断
    更多信息
    公共医学 
    参与神经胶质细胞源性神经营养因子受体信号通路 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    通过质膜粘附分子参与嗜同性细胞粘附 国际能源署
    从电子注释推断
    更多信息
     
    牵涉神经支配 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    参与膜蛋白水解 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    参与多细胞生物的发育 国际律师协会
    从祖先的生物学角度推断
    更多信息
     
    神经系统发育中的上游行为 进口
    根据突变表型推断
    更多信息
    公共医学 
    acts上游of或神经嵴细胞内迁移 进口
    根据突变表型推断
    更多信息
    公共医学 
    参与神经元细胞间粘附 国际开发协会
    根据直接分析推断
    更多信息
    公共医学 
    参与神经元细胞间粘附 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    神经元分化内的上游行为 进口
    根据突变表型推断
    更多信息
    公共医学 
    神经元成熟过程中的上游行为 进口
    根据突变表型推断
    更多信息
    公共医学 
    actits_upstream_of_or内磷酸化 国际能源署
    从电子注释推断
    更多信息
     
    参与DNA模板转录的正调控 进口
    根据突变表型推断
    更多信息
    公共医学 
    参与MAPK级联的正调控 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    整合素介导的细胞粘附正调控 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    参与细胞迁移的正调控 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    acts_upstream_of_or内细胞大小的正调节 进口
    根据突变表型推断
    更多信息
    公共医学 
    在缺乏配体的情况下参与外源性凋亡信号通路的正调控 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    acts_upstream_of_or内基因表达的正调控 进口
    根据突变表型推断
    更多信息
    公共医学 
    参与激酶活性的正调控 国际律师协会
    从祖先的生物学角度推断
    更多信息
     
    参与后肾小球发育的正调控 进口
    根据突变表型推断
    更多信息
    公共医学 
    参与神经元成熟的正调控 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    参与神经元投射发育的正调控 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    acts_upstream_of_or_within STAT蛋白肽基-氨基酸磷酸化的正向调节 进口
    根据突变表型推断
    更多信息
    公共医学 
    参与磷脂酰肌醇3-激酶/蛋白激酶B信号转导的正调控 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    参与蛋白磷酸化 国际能源署
    从电子注释推断
    更多信息
     
    acts_upstream_of_or在轴突发生调控中 进口
    根据突变表型推断
    更多信息
    公共医学 
    参与细胞粘附的调节 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    参与疼痛反应 进口
    根据突变表型推断
    更多信息
    公共医学 
    acts上游或输尿管内成熟 进口
    根据突变表型推断
    更多信息
    公共医学 
    acts上游或输尿管芽内发育 进口
    根据突变表型推断
    更多信息
    公共医学 

    一般蛋白质信息

    首选名称
    原癌基因酪氨酸蛋白激酶受体Ret
    姓名
    原癌基因c-Ret
    NP_001074249.1号
    NP_033076.2号

    NCBI参考序列(RefSeq)

    新款 尝试新的成绩单表

    独立于注释的RefSeq维护基因组

    这些参考序列独立于基因组构建而存在。解释

    这些参考序列与基因组无关注释循环,因此其版本可能与当前的RefSeq版本不匹配基因组构建。通过比较中RefSeq的版本来确定版本不匹配本节至中报告的那一节基因组区域,成绩单和产品以上。

    mRNA和蛋白质

    1. NM_001080780.1号NP_001074249.1号原癌基因酪氨酸蛋白激酶受体Ret亚型c前体

      参见NP_001074249.1的相同蛋白质及其注释位置

      状态:已验证

      描述
      转录变体:这个变体(4)代表较长的转录,但编码较短的亚型(c)。这种亚型也称为Ret9。
      源序列
      AC135861、AC156396、BC059012
      共识CDS
      CCDS39608.1号文件
      UniProtKB/Swiss-Prot公司
      第35546页
      相关的
      ENSMUSP000000086169.4,ENSMUST00000088790.9
      保守领域(3)总结
      cd05045
      位置:7241013
      PTKc_RET;蛋白酪氨酸激酶的催化结构域,在转染蛋白期间重新排列
      pfam00028型
      位置:173262
      卡德林;Cadherin域
      pfam07714型
      位置:7251006
      激酶_年;蛋白酪氨酸激酶
    2. NM_009050.2号NP_033076.2号原癌基因酪氨酸蛋白激酶受体Ret亚型a前体

      参见NP_033076.2的相同蛋白质及其注释位置

      状态:已验证

      描述
      转录变体:与变体4相比,该变体(2)在3'编码区中缺少替代片段。与亚型C相比,产生的蛋白质(亚型a)具有更长、独特的C末端。该亚型也称为Ret51。
      源序列
      AC135861、AC156396、BC059012
      共识CDS
      CCDS20470.1号文件
      UniProtKB/Swiss-Prot公司
      第35546页,第8季度第34季度,第9季度第9季度
      相关的
      ENSMUSP00000032201.6,ENSMUST00000032201.8号
      保守领域(5)总结
      cd05045
      位置:7241013
      PTKc_RET;蛋白酪氨酸激酶的催化结构域,在转染蛋白期间重新排列
      pfam00028型
      位置:173262
      钙粘蛋白;Cadherin域
      pfam17756型
      位置:29154
      RET_CLD1;RET Cadherin样结构域1
      pfam17812型
      位置:266380
      RET_CLD3;RET Cadherin样结构域3
      pfam17813型
      位置:409508
      RET_CLD4;RET Cadherin样结构域4

    注释基因组的参考序列:GCF_000001635.27-RS_2024_02

    以下部分包含属于特定基因组构建。解释

    参考GRCm39 C57BL/6J

    基因组学

    1. NC_000072.7参考GRCm39 C57BL/6J

      范围
      118128709..118174705补码
      下载
      GenBank(基因银行),美国金融服务贸易协会,序列查看器(图形)