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    社会保障3细胞因子信号转导抑制因子3[小家鼠(家鼠)]

    基因ID:12702,更新日期2024年5月12日

    总结

    官方符号
    社会保障3由提供MGI公司
    官方全名
    细胞因子信号转导抑制因子3由提供MGI公司
    主要来源
    MGI:MGI:1201791
    请参阅相关
    乐团:ENSMUSG00000053113 联盟基因组:MGI:1201791
    基因类型
    蛋白质编码
    RefSeq状态
    已验证
    有机体
    小家鼠
    血统
    真核生物;后生动物;脊索动物;克兰亚塔;脊椎动物;真造口术;哺乳动物;Eutheria;尤阿古托格利尔斯;闪光;啮齿动物;肌形态;鼠形目;鼠科;穆里奈;穆斯;Mus公司
    也称为
    Cis3;Ef10;Ssi3;顺式半胱氨酸蛋白酶3;EF-10;卫生标准-3
    总结
    启用磷酸酪氨酸残基结合活性。作用于几个过程的上游或内部,包括细胞对白血病抑制因子的反应;胰岛素受体信号通路负调控;和胎盘发育。预计位于细胞质中。预测为磷脂酰肌醇3-激酶复合物的一部分。在多种结构中表达,包括胚外成分;肝脏;胎盘;视网膜;和脾脏。与特应性皮炎4有关的该基因的人类同源基因。与人SOCS3同源(细胞因子信号传导抑制剂3)。【由基因组资源联盟提供,2022年4月】
    表达式
    在成人大肠(RPKM19.8)、成人十二指肠(RPKM16.3)和25个其他组织中广泛表达查看更多
    直系同源
    新款
    尝试新的基因表
    尝试新的成绩单表

    基因组背景

    请参阅中的Socs3基因组数据查看器
    位置:
    11 E2;11 82.96立方厘米
    外显子计数:
    2
    注释发布 状态 装配 Chr公司 位置
    RS_2024_02号 现在的 GRCm39型(GCF_000001635.27号) 11 NC_000077.7(117856905..117860192,补码)
    108.20200622 上一个程序集 GRCm38.p6型(GCF_000001635.26号) 11 NC_000077.6(117966079..117970336,补码)

    染色体11-NC_000077.7描述邻近基因的基因组背景 Neighboring gene VISTA enhancer mm780 Neighboring gene STARR-positive B cell enhancer ABC_E5307 Neighboring gene CapStarr-seq enhancer MGSCv37_chr11:117733294-117733546 Neighboring gene CapStarr-seq enhancer MGSCv37_chr11:117733656-117733839 Neighboring gene transmembrane protein 235 Neighboring gene predicted gene 11725 Neighboring gene threonine aldolase 1 Neighboring gene CapStarr-seq enhancer MGSCv37_chr11:117774097-117774206 Neighboring gene STARR-seq mESC enhancer starr_31285 Neighboring gene STARR-positive B cell enhancer ABC_E8474 Neighboring gene CapStarr-seq enhancer MGSCv37_chr11:117813554-117813821 Neighboring gene STARR-positive B cell enhancer ABC_E5308 Neighboring gene STARR-seq mESC enhancer starr_31288 Neighboring gene STARR-positive B cell enhancer ABC_E7103 Neighboring gene STARR-seq mESC enhancer starr_31291 Neighboring gene phosphatidylglycerophosphate synthase 1 Neighboring gene microRNA 6933 Neighboring gene STARR-positive B cell enhancer ABC_E7104 Neighboring gene STARR-seq mESC enhancer starr_31293 Neighboring gene STARR-seq mESC enhancer starr_31294 Neighboring gene dynein, axonemal, heavy chain 17 Neighboring gene STARR-seq mESC enhancer starr_31295 Neighboring gene CapStarr-seq enhancer MGSCv37_chr11:117947366-117947549 Neighboring gene STARR-positive B cell enhancer ABC_E1438 Neighboring gene predicted gene 11738

    基因组区域、转录物和产物

    表达式

    • 项目名称:鼠标ENCODE转录组数据
    • 描述:鼠标ENCODE项目生成的RNA分析数据集。
    • 生物项目:PRJNA66167型
    • 出版物:PMID 25409824
    • 分析日期:无

    参考文献

    GeneRIFs:功能的基因引用

    什么是GeneRIF?

    变更

    等位基因

    这类等位基因在《小鼠基因组信息学》上有记载(毫克)
    • 核酸内切酶介导(3)
    • 目标(6)1条引文

    PubChem的途径

    互动

    产品 交互作用剂 其他基因 复杂 来源 酒吧 描述

    一般基因信息

    标记

    基因本体论 由MGI提供

    过程 证据代码 酒吧
    acts上游ofor分支内参与迷路层形态发生 进口
    根据突变表型推断
    更多信息
    公共医学 
    细胞分化上游因子 国际开发协会
    根据直接分析推断
    更多信息
    公共医学 
    细胞分化上游因子 IGI公司
    从遗传相互作用推断
    更多信息
    公共医学 
    通过JAK-STAT参与细胞表面受体信号通路 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    白介素-17参与细胞反应 国际开发协会
    根据直接分析推断
    更多信息
    公共医学 
    acts上游of或细胞内对白血病抑制因子的反应 IEP公司
    从表达式模式推断
    更多信息
    公共医学 
    参与细胞内信号转导 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    acts_upstream_of_or内炎症反应的负调控 IGI公司
    从遗传相互作用推断
    更多信息
    公共医学 
    acts上游of或胰岛素受体信号通路负调控 国际开发协会
    根据直接分析推断
    更多信息
    公共医学 
    通过JAK-STAT参与受体信号通路的负调控 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    acts上游ofor信号转导负调控 IGI公司
    从遗传相互作用推断
    更多信息
    公共医学 
    参与STAT蛋白酪氨酸磷酸化的负调控 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    参与磷脂酰肌醇磷酸酯生物合成过程 国际律师协会
    从祖先的生物学角度推断
    更多信息
     
    胎盘血管发育中的上游活动 进口
    根据突变表型推断
    更多信息
    公共医学 
    acts_upstream_of_or在细胞分化的正向调节中 国际开发协会
    根据直接分析推断
    更多信息
    公共医学 
    acts_upstream_of_or在细胞分化的正向调节中 IGI公司
    从遗传相互作用推断
    更多信息
    公共医学 
    acts上游of或蛋白质磷酸化调节范围内 国际开发协会
    根据直接分析推断
    更多信息
    公共医学 
    信号转导的上游作用 IGI公司
    从遗传相互作用推断
    更多信息
    公共医学 
    组件 证据代码 酒吧
    胞膜细胞质侧is_active 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    定位于胞浆中 TAS公司
    可追溯作者声明
    更多信息
     
    磷脂酰肌醇3-激酶复合物的一部分 国际律师协会
    从祖先的生物学角度推断
    更多信息
     

    一般蛋白质信息

    首选名称
    细胞因子信号转导抑制因子3
    姓名
    CIS-3公司
    成纤维细胞中E2a-Pbx1靶基因10
    STAT诱导的STAT抑制剂3
    细胞因子诱导的含SH2蛋白3

    NCBI参考序列(参考序列)

    新款 尝试新的成绩单表

    独立于注释的RefSeq维护基因组

    这些参考序列独立于基因组构建而存在。解释

    这些参考序列与基因组无关注释循环,因此其版本可能与当前的RefSeq版本不匹配基因组构建。通过比较中RefSeq的版本来确定版本不匹配本节至中报告的那一节基因组区域,成绩单和产品以上。

    信使核糖核酸和蛋白质

    1. NM_007707.3号NP_031733.1号细胞因子信号转导抑制因子3

      参见NP_031733.1的相同蛋白质及其注释位置

      状态:已验证

      源序列
      AK152514、AL591433、BC052031
      共识CDS
      CCDS25697.1号文件
      UniProtKB/Swiss-Prot公司
      O35718号,第97803页,Q3U7X5型
      UniProtKB/TrEMBL公司
      Q3U9J8型
      相关的
      ENSMUSP000000059129.4号,恩斯穆斯特00000054002.4
      保守领域(2)总结
      cd10384
      位置:35135
      SH2_SOCS3;细胞因子信号抑制蛋白中发现的Src同源性2(SH2)结构域
      cd03737号
      位置:184225
      SOCS_SOCS3;SOCS3样蛋白的SOCS(细胞因子信号抑制因子)盒。与CIS1一起,CIS/SOCS蛋白质家族的特征是存在C末端SOCS盒和中央SH2结构域。与CIS1和SOCS1一样,SOCS3也参与了。。。

    注释基因组的参考序列:GCF_000001635.27-RS_2024_02

    以下部分包含属于特定基因组构建。解释

    参考GRCm39 C57BL/6J

    基因组学

    1. NC_000077.7参考GRCm39 C57BL/6J

      范围
      117856905..117860192补码
      下载
      GenBank(基因银行),美国金融服务贸易协会,序列查看器(图形)