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    案例3半胱氨酸天冬氨酸蛋白酶3[小家鼠(家鼠)]

    基因ID:12367,更新日期2024年6月4日

    总结

    官方符号
    案例3由提供MGI公司
    官方全名
    半胱氨酸天冬氨酸蛋白酶3由提供MGI公司
    主要来源
    MGI:MGI:107739
    请参阅相关
    乐团:ENSMUSG00000031628 联盟基因组:MGI:107739
    基因类型
    蛋白质编码
    RefSeq状态
    检验过的
    有机体
    小家鼠
    血统
    真核生物;后生动物;脊索动物;克兰亚塔;脊椎动物;真造口术;哺乳动物;Eutheria;尤阿古托格利尔斯;闪光;啮齿动物;肌形态;鼠形目;鼠科;穆里奈;穆斯;穆斯
    也称为
    CC3;AC-3;Lice公司;雅玛;mldy;CPP32;SCA-1;CASP-3;CPP-32;半胱氨酸天冬氨酸蛋白酶-3;A830040C14瑞克
    总结
    该基因编码一种蛋白质,该蛋白质属于半胱氨酰天冬氨酸特异性蛋白酶的高度保守家族,该蛋白酶通过细胞凋亡作为程序性细胞死亡的重要调节因子。这个家族的成员含有一个N末端的前结构域,需要在特定的天冬氨酸残基上进行切割才能成熟。该基因编码的蛋白质属于半胱氨酸天冬氨酸特异性蛋白酶的一个亚群,该蛋白酶由启动子半胱天冬酶激活,并对凋亡靶蛋白进行蛋白水解裂解。该基因缺陷的小鼠表现出多种表型,包括神经细胞凋亡减少,导致增生、听力损失、骨髓基质干细胞成骨分化减弱,以及产前和产后死亡。选择性剪接导致多个转录变体。[由RefSeq提供,2015年9月]
    表达式
    在CNS E18(RPKM 54.1)、CNS E14(RPKM37.8)和16个其他组织中广泛表达查看更多信息
    直系同源
    新款
    尝试新的基因表
    尝试新的成绩单表

    基因组背景

    参见中的Casp3基因组数据查看器
    位置:
    8 B1.1;826.39立方厘米
    外显子计数:
    8
    注释发布 状态 装配 Chr公司 位置
    RS_2024_02号 现在的 GRCm39型(GCF_000001635.27号) 8 NC_000074.7(47070326..47092733)
    108.20200622 上一个程序集 GRCm38.p6型(GCF_000001635.26号) 8 NC_000074.6(46617291..46639698)

    染色体8-NC_000074.7描述邻近基因的基因组背景 Neighboring gene CapStarr-seq enhancer MGSCv37_chr8:47637172-47637355 Neighboring gene centromere protein U Neighboring gene primase and polymerase (DNA-directed) Neighboring gene predicted gene 45607 Neighboring gene STARR-positive B cell enhancer ABC_E1365 Neighboring gene predicted gene, 31111 Neighboring gene STARR-positive B cell enhancer ABC_E6636 Neighboring gene STARR-seq mESC enhancer starr_21392 Neighboring gene STARR-positive B cell enhancer mm9_chr8:47824808-47825109 Neighboring gene predicted gene, 16675

    基因组区域、转录物和产物

    表达式

    • 项目名称:鼠标ENCODE转录组数据
    • 描述:鼠标ENCODE项目生成的RNA分析数据集。
    • 生物项目:PRJNA66167型
    • 出版物:PMID 25409824
    • 分析日期:无

    参考文献

    GeneRIFs:功能的基因引用

    什么是GeneRIF?

    变更

    等位基因

    这类等位基因在《小鼠基因组信息学》上有记载(MGI)

    PubChem的途径

    互动

    产品 交互作用剂 其他基因 复杂 来源 酒吧 描述

    一般基因信息

    标记

    基因本体论 由MGI提供

    功能 证据代码 酒吧
    激活天冬氨酸型内肽酶活性 国际开发协会
    根据直接分析推断
    更多信息
    公共医学 
    激活细胞周期蛋白依赖性蛋白丝氨酸/苏氨酸激酶抑制剂活性 进口
    根据突变表型推断
    更多信息
    公共医学 
    激活半胱氨酸型内肽酶活性 国际开发协会
    根据直接分析推断
    更多信息
    公共医学 
    激活半胱氨酸型内肽酶活性 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    使半胱氨酸型内肽酶活性参与凋亡过程 国际开发协会
    根据直接分析推断
    更多信息
    公共医学 
    使半胱氨酸型内肽酶活性参与凋亡过程 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    使半胱氨酸型内肽酶活性参与凋亡信号通路 国际律师协会
    从祖先的生物学角度推断
    更多信息
     
    使半胱氨酸型内肽酶活性参与凋亡信号通路 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    使半胱氨酸型内肽酶活性参与细胞凋亡的执行阶段 国际律师协会
    从祖先的生物学角度推断
    更多信息
     
    使半胱氨酸型内肽酶活性参与细胞凋亡的执行阶段 国际开发协会
    根据直接分析推断
    更多信息
    公共医学 
    使半胱氨酸型内肽酶活性参与细胞凋亡的执行阶段 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    激活半胱氨酸型肽酶活性 国际开发协会
    根据直接分析推断
    更多信息
    公共医学 
    激活半胱氨酸型肽酶活性 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    使死亡受体结合 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    激活内肽酶活性 国际开发协会
    根据直接分析推断
    更多信息
    公共医学 
    激活酶激活剂活性 国际律师协会
    从祖先的生物学角度推断
    更多信息
     
    启用水解酶活性 国际能源署
    从电子注释推断
    更多信息
     
    激活肽酶活性 国际开发协会
    根据直接分析推断
    更多信息
    公共医学 
    使肽酶具有活性 进口
    根据突变表型推断
    更多信息
    公共医学 
    激活肽酶活性 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    激活肽酶活性 区域协调机构
    根据已审查的计算分析推断
    更多信息
    公共医学 
    激活磷脂酶A2激活剂活性 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    启用蛋白酶绑定 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    实现蛋白质结合 IPI公司
    从物理相互作用推断
    更多信息
    公共医学 
    实现含蛋白复合物结合 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    过程 证据代码 酒吧
    acts_upstream_of_or_in B细胞内稳态 进口
    根据突变表型推断
    更多信息
    公共医学 
    acts_upstream_of_or_within DNA损伤响应 国际开发协会
    根据直接分析推断
    更多信息
    公共医学 
    acts_upstream_of_or_ T细胞内稳态 进口
    根据突变表型推断
    更多信息
    公共医学 
    acts上游of或前神经管闭合内 进口
    根据突变表型推断
    更多信息
    公共医学 
    参与凋亡过程 国际律师协会
    从祖先的生物学角度推断
    更多信息
     
    acts上游of或在凋亡过程中 进口
    根据突变表型推断
    更多信息
    公共医学 
    参与凋亡过程 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    参与轴突束 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    acts_upstream_of_or细胞内命运承诺 进口
    根据突变表型推断
    更多信息
    公共医学 
    acts上游of或细胞内对有机物质的反应 国际开发协会
    根据直接分析推断
    更多信息
    公共医学 
    staurosporine参与细胞反应 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    上皮细胞凋亡过程中上游的acts 国际开发协会
    根据直接分析推断
    更多信息
    公共医学 
    参与红细胞分化 国际律师协会
    从祖先的生物学角度推断
    更多信息
     
    参与红细胞分化 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    参与细胞凋亡的执行阶段 国际律师协会
    从祖先的生物学角度推断
    更多信息
     
    acts_upstream_of_or凋亡执行期内 国际开发协会
    根据直接分析推断
    更多信息
    公共医学 
    acts_upstream_of_or_在细胞凋亡执行阶段 IGI公司
    从遗传相互作用推断
    更多信息
    公共医学 
    acts_upstream_of_or凋亡执行期内 进口
    根据突变表型推断
    更多信息
    公共医学 
    参与细胞凋亡的执行阶段 进口
    根据突变表型推断
    更多信息
    公共医学 
    参与细胞凋亡的执行阶段 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    成纤维细胞凋亡过程中上游的acts 国际开发协会
    根据直接分析推断
    更多信息
    公共医学 
    acts_upstream_of_of_win成纤维细胞凋亡过程 进口
    根据突变表型推断
    更多信息
    公共医学 
    胶质细胞凋亡过程中上游的acts 进口
    根据突变表型推断
    更多信息
    公共医学 
    心脏发育的上游活动 IGI公司
    从遗传相互作用推断
    更多信息
    公共医学 
    参与细胞内信号转导 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    参与内在凋亡信号通路 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    内质网应激对内源性凋亡信号通路的影响 北美
    不可追踪的作者声明
    更多信息
    公共医学 
    渗透胁迫下内源性凋亡信号通路的参与 国际开发协会
    根据直接分析推断
    更多信息
    公共医学 
    参与角质形成细胞分化 国际律师协会
    从祖先的生物学角度推断
    更多信息
     
    acts上游of或角质形成细胞分化内 进口
    根据突变表型推断
    更多信息
    公共医学 
    参与学习或记忆 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    acts_upstream_of_or_within B细胞增殖负调控 进口
    根据突变表型推断
    更多信息
    公共医学 
    acts_upstream_of_or内激活T细胞增殖的负调节 进口
    根据突变表型推断
    更多信息
    公共医学 
    acts_upstream_of_or在凋亡过程的负调控中 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    acts_upstream_of_or细胞周期负调控 进口
    根据突变表型推断
    更多信息
    公共医学 
    actits_upstream_of_or对细胞周期依赖蛋白丝氨酸/苏氨酸激酶活性的负调控 进口
    根据突变表型推断
    更多信息
    公共医学 
    参与细胞因子产生的负调控 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    神经元凋亡过程中的上游活动 国际开发协会
    根据直接分析推断
    更多信息
    公共医学 
    神经元凋亡过程中的上游活动 IGI公司
    从遗传相互作用推断
    更多信息
    公共医学 
    神经元凋亡过程中的上游动作 进口
    根据突变表型推断
    更多信息
    公共医学 
    参与神经元分化 国际律师协会
    从祖先的生物学角度推断
    更多信息
     
    acts_upstream_of_or内神经营养素TRK受体信号通路 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
    公共医学 
    参与淀粉样β形成的正调控 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    参与凋亡过程的正调控 国际开发协会
    根据直接分析推断
    更多信息
    公共医学 
    参与凋亡过程的正调控 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    参与神经元凋亡过程的正调控 国际律师协会
    从祖先的生物学角度推断
    更多信息
     
    参与神经元凋亡过程的阳性调节 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    参与细胞凋亡的正调控 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    参与蛋白质分解代谢过程 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    参与蛋白质成熟 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    蛋白质加工中的上游行为 国际开发协会
    根据直接分析推断
    更多信息
    公共医学 
    参与蛋白质加工 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    参与蛋白质水解 国际律师协会
    从祖先的生物学角度推断
    更多信息
     
    参与蛋白质水解 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    蛋白质水解中的上游作用 区域协调机构
    根据已审查的计算分析推断
    更多信息
    公共医学 
    参与性焦下垂 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    参与蛋白质稳定性的调节 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    参与突触小泡周期的调控 国际开发协会
    根据直接分析推断
    更多信息
    公共医学 
    参与突触小泡周期的调控 进口
    根据突变表型推断
    更多信息
    公共医学 
    acts_upstream_of_or_in对紫外线的响应 国际开发协会
    根据直接分析推断
    更多信息
    公共医学 
    acts_upstream_of_or_in对紫外线的响应 IGI公司
    从遗传相互作用推断
    更多信息
    公共医学 
    参与葡萄糖反应 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    与过氧化氢反应有关 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    对有机物的反应中的上游行为 国际开发协会
    根据直接分析推断
    更多信息
    公共医学 
    动作_上游_of_或在受伤反应范围内 国际开发协会
    根据直接分析推断
    更多信息
    公共医学 
    acts_upstream_of_or或在声音的感官感知范围内 进口
    根据突变表型推断
    更多信息
    公共医学 

    一般蛋白质信息

    首选名称
    半胱氨酸天冬氨酸蛋白酶-3
    姓名
    SREBP裂解活性1
    凋亡素
    caspase3,凋亡相关半胱氨酸蛋白酶
    半胱氨酸蛋白酶CPP32
    蛋白质Yama
    NP_001271338.1号
    NP_033940.1号
    XP_017168032.1号
    XP_030099126.1号

    NCBI参考序列(RefSeq)

    新款 尝试新的成绩单表

    独立于注释维护的参考序列基因组

    这些参考序列独立于基因组构建而存在。解释

    这些参考序列与基因组无关注释循环,因此其版本可能与当前的RefSeq版本不匹配基因组构建。通过比较中RefSeq的版本来确定版本不匹配本节至中报告的那一节基因组区域,成绩单和产品以上。

    mRNA和蛋白质

    1. NM_001284409.1号NP_001271338.1号半胱氨酸天冬氨酸蛋白酶-3

      参见NP_001271338.1的相同蛋白质及其注释位置

      状态:已审阅

      描述
      成绩单变体:此变体(1)表示较长的成绩单。变体1和2编码相同的蛋白质。
      源序列
      AC119267型
      共识CDS
      CCDS22294.1号
      UniProtKB/Swiss-Prot公司
      O08668号,第70677页,Q8CHV5型,问题9QWI4
      相关的
      ENSMUSP00000147767.2,ensmust公司00000211115.2
      保守领域(1)总结
      智能00115
      位置:37277
      CASc;半胱氨酸天冬氨酸酶、白介素-1β转化酶(ICE)同系物
    2. NM_009810.3号NP_033940.1型半胱氨酸天冬氨酸蛋白酶-3

      参见NP_033940.1的相同蛋白质及其注释位置

      状态:已审阅

      描述
      成绩单变体:与变体1相比,该变体(2)在5'UTR上有所不同。变体1和变体2都编码相同的蛋白质。
      源序列
      AC119267型
      共识CDS
      CCDS22294.1号
      UniProtKB/Swiss-Prot公司
      O08668号,第70677页,Q8CHV5型,问题9QWI4
      相关的
      ENSMUSP000000091238.6号,ENSMUST00000093517.7号
      保守领域(1)总结
      智能00115
      位置:37277
      CASc;半胱氨酸天冬氨酸酶、白介素-1β转化酶(ICE)同系物

    注释基因组的参考序列:GCF_000001635.27-RS_2024_02

    以下部分包含属于特定基因组构建。解释

    参考GRCm39 C57BL/6J

    基因组学

    1. NC_000074.7参考GRCm39 C57BL/6J

      范围
      47070326..47092733
      下载
      GenBank(基因银行),美国金融服务贸易协会,序列查看器(图形)

    mRNA和蛋白质

    1. XM_017312543.3号XP_017168032.1号caspase-3亚型X1

      UniProtKB/Swiss-Prot公司
      O08668号,第70677页,Q8CHV5型,问题9QWI4
      保守领域(1)总结
      智能00115
      位置:37277
      CASc;半胱氨酸天冬氨酸酶、白介素-1β转化酶(ICE)同系物
    2. XM_030243266.1号XP_030099126.1号caspase-3亚型X1

      UniProtKB/Swiss-Prot公司
      O08668号,第70677页,Q8CHV5型,问题9QWI4
      保守领域(1)总结
      智能00115
      位置:37277
      CASc;半胱氨酸天冬氨酸酶、白介素-1β转化酶(ICE)同系物