VIM波形蛋白[智人（人类）]-基因-NCBI

总结

官方符号: 振动由提供HGNC公司
官方全名: 波形蛋白由提供HGNC公司
主要来源: HGNC:HGNC:12692
请参阅相关: 乐团：ENSG0000026025 MIM:193060；联盟基因组：HGNC:12692
基因类型: 蛋白质编码
RefSeq状态: 已审核
有机体: 智人
血统: 真核生物；后生动物；脊索动物；克兰亚塔；脊椎动物；真造口术；哺乳动物；Eutheria；尤阿古托格利尔斯；灵长类；Haplorhini；卡塔里尼；人科；人类
总结: 该基因编码一种III型中间丝蛋白。中间丝与微管和肌动蛋白微丝一起构成细胞骨架。编码的蛋白质负责维持细胞形状和细胞质的完整性，并稳定细胞骨架的相互作用。该蛋白参与神经生成和胆固醇转运，并作为许多其他关键蛋白的组织者，参与细胞粘附、迁移和信号传递。细菌和病毒病原体已被证明附着在宿主细胞表面的这种蛋白质上。该基因的突变与人类患者的先天性白内障有关。[由RefSeq提供，2017年8月]
表达式: 卵巢（RPKM 1051.1）、脂肪（RPKM720.1）和22个其他组织中普遍表达查看更多
直系同源: 鼠标全部的
新款: 尝试新的基因表
尝试新的成绩单表

基因组背景

位置：: 第10页，共13页

外显子计数：: 10

注释发布	状态	装配	Chr公司	位置
RS_2023_10号	现在的	GRCh38.p14型(GCF_000001405.40)	10	NC_000010.11（17228241..17237593）
RS_2023_10号	现在的	T2T-CHM13v2.0(GCF_009914755.1号)	10	NC_060934.1（17246786.17256137）
105.20220307	上一个程序集	GRCh37.p13型(GCF_000001405.25号)	10	NC_000010.10（17270240..17279592）

染色体10-NC_000010.11 描述邻近基因的基因组背景

基因组区域、转录物和产物

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基因组序列：

转到核苷酸： 绘图美国金融服务贸易协会 GenBank（基因银行）

表达式

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项目名称：HPA RNA-seq正常组织
描述：对代表27种不同组织的95名人类个体的组织样本进行RNA-seq，以确定所有蛋白编码基因的组织特异性
生物项目：项目编号：4337
出版物：项目管理标识号24309898
分析日期：2018年4月4日星期三07:08:55

参考文献

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PubMed中的相关文章

支持细胞波形蛋白丝的免疫组织化学分析是预测生精功能障碍的有力工具。斋藤H，等《组织化学学报》，2023年7月，PMID 37224719
低阶段子宫内膜癌的单细胞分析确定上皮波形蛋白表达低是复发性疾病的标志。连合，等EBioMedicine，2023年6月，PMID 37146405，免费PMC文章
膀胱癌中波形蛋白表观遗传失调与通过上皮向间充质转化获得侵袭性和转移性表型有关。 Monteiro-Reis S，等《国际生物科学杂志》，2023年。PMID 36594099，免费PMC文章
转录组分析显示，波形蛋白诱导的细胞-细胞关联的破坏增加了乳腺癌细胞的迁移。乌斯曼S，等细胞，2022年12月13日。PMID 36552797，免费PMC文章
体外单核细胞增生性李斯特菌侵入血脑和血脑脊液屏障时波形蛋白的不同参与。巴诺维奇F，等国际分子科学杂志，2022年10月26日。PMID 36361697，免费PMC文章

查看PubMed中的所有（819）引文

GeneRIFs：功能的基因引用

什么是GeneRIF？

EP300通过上调波形蛋白的表达促进脊索瘤的进展。
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探索新的前沿：细胞表面波形蛋白作为循环肿瘤细胞的新标记物和进展期胃癌的有希望的治疗靶点。
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幼稚前列腺癌中E-cadherin/beta-catenin、Vimentin表达、临床病理特征和耐药性预测之间的相关性：一项分子和临床研究。
标题：早期前列腺癌中E-cadherin/β-catenin、Vimentin表达、临床病理特征和耐药性预测之间的相关性：一项分子和临床研究。
以波形蛋白为靶点：对抗癌症转移和耐药性的多方面方法。
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波形蛋白是伤口愈合的核心。
标题：Vimentin是伤口愈合的核心。
CircGLIS3通过调节miR-1343-3p/PGK1通路和抑制波形蛋白磷酸化促进胃癌进展。
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唾液IgA和波形蛋白在体外区分SARS-CoV-2感染：对290名恢复期新冠肺炎患者的研究。
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circKEAP1编码的肿瘤抑制蛋白通过促进波形蛋白蛋白酶体降解和激活抗肿瘤免疫抑制骨肉瘤细胞的干细胞和转移。
标题：由circKEAP1编码的肿瘤抑制蛋白通过促进波形蛋白蛋白酶体降解和激活抗肿瘤免疫抑制骨肉瘤细胞的干细胞和转移。
狼疮性肾炎患者血清72磷酸化波形蛋白与上皮-间质转化相关。
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环状RNA cVIM通过miR-122-5p/miR-9-5p介导的TGF-β信号级联促进肝纤维化中的肝星状细胞活化。
标题：环状RNA cVIM通过miR-122-5p/miR-9-5p介导的TGF-β信号级联促进肝纤维化中的肝星状细胞激活。

提交：新GenerRIF 更正查看所有GenerRIF（442）

表型

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在NIH基因检测注册中心（GTR）查找该基因的测试

使用PheGenI回顾该区域的eQTL和表型关联数据

描述	测验
白内障30 MedGen公司：C3805411号 OMIM公司：116300 基因审查：无法使用的	比较实验室

EBI GWAS目录

描述
发现并完善与脂质水平相关的基因座。 EBI GWAS目录 EBI GWAS目录公共医学

变更

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基因型

HIV-1相互作用

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蛋白质相互作用

蛋白质	基因	互动	酒吧
包膜表面糖蛋白gp120	环境价值	串联亲和纯化和质谱分析鉴定从HIV-1表达细胞分离的Staufen1 RNP复合物中并入的波形蛋白（VIM）、HIV-1 Gag、Gag/Pol、gp120和Nef	公共医学
	环境价值	星形胶质细胞中的HIV-1 gp120部分阻止了通常由异丙肾上腺素刺激的两种主要细胞骨架蛋白波形蛋白和GFAP的磷酸化	公共医学
Gag-Pol公司	gag-pol公司	串联亲和纯化和质谱分析鉴定从HIV-1表达细胞分离的Staufen1 RNP复合物中并入的波形蛋白（VIM）、HIV-1 Gag、Gag/Pol、gp120和Nef	公共医学
奈夫	nef（奈夫）	串联亲和纯化和质谱分析鉴定从HIV-1表达细胞分离的Staufen1 RNP复合物中并入的波形蛋白（VIM）、HIV-1 Gag、Gag/Pol、gp120和Nef	公共医学
Pr55（间隙）	阻塞	LGALS3BP（M2BP）抑制HIV-1 Gag向质膜的转运，LGALS3BP的抑制依赖于波形蛋白	公共医学
	堵住	串联亲和纯化和质谱分析鉴定从HIV-1表达细胞分离的Staufen1 RNP复合物中并入的波形蛋白（VIM）、HIV-1 Gag、Gag/Pol、gp120和Nef	公共医学
振动频率	振动频率	据报道，Vif与细胞质中的波形蛋白细丝共定位，并导致中间细丝网络崩溃为核周聚集物，但在其他报告中未观察到这种共定位	公共医学
Vpr（Vpr）	虚拟专用数据库	细胞培养中氨基酸的稳定同位素标记结合基于质谱的蛋白质组学确定了HIV-1 Vpr在Vpr转导的巨噬细胞中下调波形蛋白（VIM）表达	公共医学
	虚拟专用数据库	来自表达Vpr的HTLV-1转化细胞的蛋白质组分析揭示了与凋亡相关的蛋白质变化，例如CASP3活性指示蛋白（波形蛋白和Rho-GDP解离抑制剂2）	公共医学
矩阵	堵住	HIV-1 MA治疗人类星状细胞上调CXCR2、syndecan-2、胶原蛋白I、α-SMA、波形蛋白和内皮素-1的表达	公共医学
反胃蛋白酶	gag-pol公司	HIV-1蛋白酶在51-52、60-61和92-93位置切割波形蛋白的三个次级位点。	公共医学
	gag-pol公司	HIV-1蛋白酶在体外裂解中间丝蛋白波形蛋白（人和鼠的波形蛋白都在亮氨酸-422和精氨酸-423之间裂解）、结蛋白和胶质纤维酸性蛋白	公共医学
	gag-pol公司	波形蛋白头部结构域的两个区域，即残基17-60和68-92，被HIV-1蛋白酶裂解后释放，导致染色质分布发生改变	公共医学
	gag-pol公司	人类皮肤成纤维细胞暴露于HIV-1蛋白酶诱导波形蛋白纤维网降解和原肌球蛋白亚型微丝网消失	公共医学
	gag-pol公司	PKC磷酸化人重组波形蛋白抑制HIV-1蛋白酶对波形蛋白头部结构域的裂解	公共医学

转到HIV-1人类交互数据库

PubChem的途径

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互动

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产品	交互作用剂	其他基因	复杂	来源	酒吧	描述

一般基因信息

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标记

VIM（e-PCR）
- 大学：253717

RH11024（e-PCR）
- 大学：32309

GDB:193876（e-PCR）
- 大学：155784

VIM（e-PCR）
- 大学：527007

Vim（e-PCR），检测多态性
- 大学：527007

Vim（e-PCR），检测多态性
- 大学：507308

G43223（e-PCR）
- 大学：94898

VIM_2538（电子聚合酶链式反应）
- 大学：281077

同源性

NCBI正交测井

OrthoDB的Orthologs

克隆名称

FLJ36605型

基因本体论 GOA提供

功能	证据代码	酒吧
支持双链RNA结合	伊达从直接测定推断更多信息	公共医学
实现相同的蛋白质结合	IPI公司从物理相互作用推断更多信息	公共医学
使角蛋白丝结合	IPI公司从物理相互作用推断更多信息	公共医学
启用分子适配器活动	经验根据实验推断更多信息	公共医学
实现蛋白质结合	IPI公司从物理相互作用推断更多信息	公共医学
实现蛋白质域特异性结合	IPI公司从物理相互作用推断更多信息	公共医学
使支架蛋白结合	IPI公司从物理相互作用推断更多信息	公共医学
使细胞骨架的结构成分成为可能	国际律师协会从祖先的生物学角度推断更多信息
使细胞骨架的结构成分成为可能	伊达从直接测定推断更多信息	公共医学
使眼睛晶状体的结构成分	国际原子能机构从电子注释推断更多信息

过程	证据代码	酒吧
参与Bergmann胶质细胞分化	国际原子能机构从电子注释推断更多信息
参与星形胶质细胞发育	国际原子能机构从电子注释推断更多信息
参与细胞对脂多糖的反应	进口根据突变表型推断更多信息	公共医学
参与细胞对胞壁二肽的反应	进口根据突变表型推断更多信息	公共医学
参与II型干扰素的细胞反应	国际原子能机构从电子注释推断更多信息
涉及中间纤维组织	国际律师协会从祖先的生物学角度推断更多信息
涉及中间纤维组织	国际空间站根据序列或结构相似性推断更多信息
晶状体纤维细胞的研制	国际原子能机构从电子注释推断更多信息
参与神经元投射发育的负调控	国际原子能机构从电子注释推断更多信息
参与神经元投射发育	国际原子能机构从电子注释推断更多信息
参与胶原生物合成过程的正调控	进口根据突变表型推断更多信息	公共医学
参与基因表达的正调控	国际原子能机构从电子注释推断更多信息
参与mRNA稳定性的调节	进口根据突变表型推断更多信息	公共医学

组件	证据代码	酒吧
轴突活动	国际律师协会从祖先的生物学角度推断更多信息
位于单元格前缘	国际原子能机构从电子注释推断更多信息
细胞质中有活性	国际律师协会从祖先的生物学角度推断更多信息
位于细胞质中	伊达从直接测定推断更多信息	公共医学
定位于细胞骨架	伊达从直接测定推断更多信息	公共医学
定位于细胞骨架	TAS公司可追溯作者声明更多信息	公共医学
定位于胞浆中	伊达从直接测定推断更多信息	公共医学
定位于胞浆中	TAS公司可追溯作者声明更多信息
定位于胞外外体	HDA公司更多信息	公共医学
局部粘着	HDA公司更多信息	公共医学
中间灯丝中的is_active	国际律师协会从祖先的生物学角度推断更多信息
位于中间灯丝中	伊达从直接测定推断更多信息	公共医学
定位于中间丝细胞骨架	伊达从直接测定推断更多信息
位于微管组织中心	TAS公司可追溯作者声明更多信息
在核矩阵中定位	国际原子能机构从电子注释推断更多信息
位于过氧化物酶体中	伊达从直接测定推断更多信息	公共医学
位于吞噬小泡内	国际原子能机构从电子注释推断更多信息
血浆中的is_active	国际律师协会从祖先的生物学角度推断更多信息
定位于质膜	国际空间站根据序列或结构相似性推断更多信息