排序

序列数据生物导体简介

生物导体版本：释放（3.19）

生物导体能够分析和理解高通量基因组数据。我们有大量的软件包，允许对大数据进行严格的统计分析，同时牢记技术工件。Bioconductor帮助用户将其分析结果置于生物环境中，并提供丰富的可视化机会。再现性是生物导体分析的一个重要目标。例如，可以使用生物导体进行不同类型的分析；测序：RNASeq、ChIPSeq、变体、拷贝号等。；微阵列：表达、SNP等。；特定领域分析：流式细胞术、蛋白质组学等。对于这些分析，通常导入并使用不同的序列相关文件类型，包括fasta、fastq、BAM、gtf、bed和wig文件等。生物导体包支持导入、普通和高级序列操作，如修剪、转换和对齐，包括质量评估。

作者：Sonali Arora[aut]，Martin Morgan[aut]，生物导体封装维护商[cre]

维护人员：Bioconductor Package Maintainer＜维护人员在Bioconductor.org＞

引文（从R中输入引文（“排序”）):

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“4.4”）并输入：

if（！require（“生物管理器”，悄悄=TRUE））install.packages（“BiocManager”）BiocManager:：安装（“排序”）

对于R的旧版本，请参阅相应的生物导体释放.

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档，请启动R并输入：

浏览幻影（“排序”）

序列数据生物导体简介

HTML格式

R脚本

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细节

生物视图	基本工作流,免疫肿瘤学工作流,工作流
版本	1.28.0
许可证	艺术-2.0
取决于	R（>=3.3.0），基因组范围,基因组比对,生物串,Rsamtools软件,短读,生物并行,rtracklayer公司,变量注释,批注中心,英国基因组。哈皮恩斯。加州大学圣保罗分校hg19,RNAseq数据。HNRNPC.bam.chr14号机组
进口
系统要求
统一资源定位地址	https://www.bioconductor.org/help/workflows/sequencing/

建议	针织物,rmarkdown公司,生物风格
链接到
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取决于我
导入我
建议我
指向我的链接

程序包档案

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包	序列号_1.28.0.tar.gz
Windows二进制
macOS二进制（x86_64）
macOS二进制（arm64）
源码库信息	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/sequenting
源存储库（开发人员访问）	git克隆git@git.bioconductor.org：包装/排序
包短Url	https://bioconductor.org/packages/sequenting/
软件包下载报告	下载统计信息