组织Treg

小鼠组织T调节细胞的TWGBS和RNA-seq数据

生物导体版本：释放（3.19）

该软件包提供了研究中获得的各种组织的现成表观基因组（从TWGBS获得）和转录组（RNA-seq）（Delacher and Imbusch 2017，PMID:28783152）。调节性T细胞（Treg细胞）执行两个不同的功能：它们维持自我耐受，并通过分化为专门的组织Treg电池来支持器官内稳态。基础数据集描述了特化组织Treg细胞的表观遗传和转录组修饰。

作者：Charles Imbusch[aut，cre]，Michael Delacher[aut]，Markus Feuerer[aut]Benedikt Brors[aut]

维护人员：查尔斯·伊姆布希（Charles Imbusch）<c.Imbusch at dkfz.de>

引文（从R中输入引文（“tissueTreg”）):

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“4.4”）并输入：

如果（！require（“BiocManager”，悄悄地=TRUE））install.packages（“BiocManager”）BiocManager:：安装（“tissueTreg”）

对于R的旧版本，请参阅相应的生物导体释放.

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档，请启动R并输入：

浏览幻影（“tissueTreg”）

组织Treg	HTML格式	R脚本
参考手册	PDF格式
新闻	文本

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细节

生物视图	实验数据,Mus_肌肉_数据,RNASeq数据,排序数据,组织
版本	1.24.0
许可证	GPL（>=2）
取决于	R（>=3.5）
进口
系统要求
统一资源定位地址	https://github.com/cimbusch/tissueTreg

建议	仿生风格,针织物,市场营销,测试那个,实验中心,bsseq公司,总结性实验,ggplot2,重塑2
链接到
增强功能
取决于我
导入我
建议我	DMR类别
指向我的链接
生成报告	生成报告

程序包档案

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包	组织Treg_1.24.0.tar.gz
Windows二进制
macOS二进制（x86_64）
macOS二进制（arm64）
源码库信息	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/tissueTreg网站
源存储库（开发人员访问）	git克隆git@git.bioconductor.org：包/tissueTreg
包短Url	https://bioconductor.org/packages/tissueTreg网站/
软件包下载报告	下载统计信息