单细胞多模式

集成多模式单细胞实验数据集

生物导体版本：释放（3.19）

SingleCellMultiModal是一个ExperimentHub包，用于处理从GEO和其他来源获得的多个数据集，并将其表示为MultiAssayExperiment对象。我们提供了几个多模态数据集，包括scNMT、10X Multiome、seqFISH、CITEseq、SCoPE2等。该包的范围是为基准测试和分析提供数据。

作者：马塞尔·拉莫斯[aut，cre]、里卡德·阿格拉盖[aut]、阿尔·阿巴迪[ctb]、达里奥·里盖利[aut'、克里斯托夫·万德拉[ctb]]、凯利·埃克诺德[aut]]、路德维希·盖斯林格[aut4]、列维·瓦尔德龙[aut]

维护人员：Marcel Ramos＜Marcel.Ramos at roswellpark.org＞

引文（从R中输入引文（“SingleCellMultiModal”）):

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“4.4”）并输入：

如果（！require（“BiocManager”，悄悄地=TRUE））install.packages（“BiocManager”）BiocManager:：安装（“单细胞多模式”）

对于R的旧版本，请参阅相应的生物导体释放.

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档，请启动R并输入：

浏览幻影（“单细胞多模式”）

CITEseq脐血	HTML格式	R脚本
ECCITEseq外周血	HTML格式	R脚本
GT-seq小鼠胚胎	HTML格式	R脚本
scMultiome 10x PBMC系列	HTML格式	R脚本
scNMT小鼠胃化	HTML格式	R脚本
SCoPE2：巨噬细胞与单核细胞	HTML格式	R脚本
seqFISH小鼠视觉皮层	HTML格式	R脚本
单细胞多模式简介	HTML格式	R脚本
参考手册	PDF格式
新闻	文本

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细节

生物视图	实验数据,实验中心,地理位置,可复制研究,单细胞数据
版本	1.16.0
许可证	艺术-2.0
取决于	R（>=4.2.0），多重分析实验
进口	批注中心,BiocBaseUtils公司,生物文件缓存,实验中心、图形、，HDF5阵列,S4载体,单细胞实验,空间实验,总结性实验,矩阵、方法、实用程序
系统要求
统一资源定位地址
错误报告	https://github.com/waldronlab/SingleCellMultiModal/issues

建议	仿生风格,ggplot2,针织物,Ragged实验,rmarkdown公司,散射,尖叫声,UpSetR（升级程序）,超高速
链接到
增强功能
取决于我
导入我
建议我	解译X,多数据
指向我的链接
生成报告	生成报告

程序包档案

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包	单细胞多模式_1.16.0.tar.gz
Windows二进制
macOS二进制（x86_64）
macOS二进制（arm64）
源码库信息	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/SingleCellMultiModal网站
源存储库（开发人员访问）	git克隆git@git.bioconductor.org：软件包/单细胞多模式
包短Url	https://bioconductor.org/packages/SingleCellMultiModal网站/
软件包下载报告	下载统计信息