SFE数据

示例空间特征实验数据集

生物导体版本：释放（3.19）

将Simple Feature注释作为SpatialFeatureExperiment对象的空间转录组学数据集示例。技术包括Visium、slide-seq、Nanostring CoxMX、Vizgen MERFISH和10X Xenium。组织包括小鼠骨骼肌、人类黑色素瘤转移、人类肺癌、乳腺癌和小鼠肝脏。

作者：兰达·摩西[aut，cre]，Alik Huseynov[aut]，凯拉·杰克逊，Lior Pachter[aut，ths]

维护人员：Lambda Moses<caltech.edu的dlu2

引文（从R中输入引文（“SFEData”）):

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“4.4”）并输入：

如果（！require（“BiocManager”，悄悄地=TRUE））install.packages（“BiocManager”）BiocManager:：安装（“SFEData”）

对于R的旧版本，请参阅相应的生物导体释放.

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档，请启动R并输入：

浏览Vignette（“SFEData”）

示例空间特征实验数据集	HTML格式	R脚本
参考手册	PDF格式
新闻	文本

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细节

生物视图	实验数据,实验中心,表达式数据,人乳头数据,Mus_肌肉_数据,单细胞数据,空间数据,组织
版本	1.6.0
许可证	艺术-2.0
取决于
进口	生物文件缓存,批注中心,实验中心，实用程序
系统要求
统一资源定位地址	https://github.com/pachterlab/SFEData网站
错误报告	https://github.com/pachterlab/SFEData/issues网站

建议	仿生风格,针织物,rmarkdown公司,修饰符对象,空间特征实验,测试那个(>= 3.0.0)
链接到
增强功能
取决于我
导入我
建议我	空间特征实验,旅行者号
指向我的链接
生成报告	生成报告

程序包档案

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包	SFE数据_1.6.0.tar.gz
Windows二进制
macOS二进制（x86_64）
macOS二进制（arm64）
源码库信息	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/SFEData网站
源存储库（开发人员访问）	git克隆git@git.bioconductor.org：包/SFEData
包短Url	https://bioconductor.org/packages/SFEData/
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