RLHub(RLHub)
用于访问已处理RLSuite数据集的ExperimentHub包
生物导体版本:释放(3.19)
|RLHub为RLSuite中提供的已处理数据提供了一个方便的接口,RLSuite是用于分析R循环映射数据集的工具库。RLHub的主要目的是为RLSeq R包和RLBase web服务所需的已处理数据集提供服务。此外,RLHub为这些数据提供了一个独立的R接口,有助于用户解决与R环区域(RL-regions)、R环结合蛋白(RLBPs)、R循环共定位因子以及R环映射方法之间的差异有关的问题。完整的数据生成协议如下:https://github.com/Bishop-Laboratory/RLBase-data。
作者:亨利·米勒[aut,cre,cph],亚历山大·毕晓普[ths,cph]
维护人员:亨利·米勒(Henry Miller)
安装
要安装此软件包,请启动R(版本“4.4”)并输入:
如果(!require(“BiocManager”,悄悄地=TRUE))install.packages(“BiocManager”)BiocManager::安装(“RLHub”)
对于R的旧版本,请参阅相应的生物导体释放.
文档
要查看系统中安装的此软件包版本的文档,请启动R并输入:
浏览渐晕图(“RLHub”)
细节
生物视图 |
ChIPSeq数据,DNASeq数据,编码器,实验数据,实验中心,表达式数据,地理位置,基因组,包类型数据,RNASeq数据,可复制研究,排序数据 |
版本 |
1.9.0 |
许可证 |
MIT+文件许可证 |
取决于 |
|
进口 |
批注中心,实验中心,实用程序 |
系统要求 |
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统一资源定位地址 |
https://github.com/Bishop-Laboratory/RLHub网站 https://bishop实验室.github.io/RLHub/ |
错误报告 |
https://github.com/Bishop-Laboratory/RLHub/问题 |
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程序包档案
跟随安装在R会话中使用此包的说明。