RLHub(RLHub)

用于访问已处理RLSuite数据集的ExperimentHub包


生物导体版本:释放(3.19)

|RLHub为RLSuite中提供的已处理数据提供了一个方便的接口,RLSuite是用于分析R循环映射数据集的工具库。RLHub的主要目的是为RLSeq R包和RLBase web服务所需的已处理数据集提供服务。此外,RLHub为这些数据提供了一个独立的R接口,有助于用户解决与R环区域(RL-regions)、R环结合蛋白(RLBPs)、R循环共定位因子以及R环映射方法之间的差异有关的问题。完整的数据生成协议如下:https://github.com/Bishop-Laboratory/RLBase-data。

作者:亨利·米勒[aut,cre,cph],亚历山大·毕晓普[ths,cph]

维护人员:亨利·米勒(Henry Miller)

引文(从R中输入引文(“RLHub”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“4.4”)并输入:

如果(!require(“BiocManager”,悄悄地=TRUE))install.packages(“BiocManager”)BiocManager::安装(“RLHub”)

对于R的旧版本,请参阅相应的生物导体释放.

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档,请启动R并输入:

浏览渐晕图(“RLHub”)
访问RLHub数据 HTML格式 R脚本
参考手册 PDF格式
新闻 文本
许可证 文本

细节

生物视图 ChIPSeq数据,DNASeq数据,编码器,实验数据,实验中心,表达式数据,地理位置,基因组,包类型数据,RNASeq数据,可复制研究,排序数据
版本 1.9.0
许可证 MIT+文件许可证
取决于
进口 批注中心,实验中心,实用程序
系统要求
统一资源定位地址 https://github.com/Bishop-Laboratory/RLHub网站 https://bishop实验室.github.io/RLHub/
错误报告 https://github.com/Bishop-Laboratory/RLHub/问题
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程序包档案

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包 RLHub_1.9.0.tar.gz号
Windows二进制
macOS二进制(x86_64)
macOS二进制(arm64)
源码库信息 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/RLHub
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/RLHub
包短Url https://bioconductor.org/packages/RLHub/
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