鼠标老化数据

用于研究衰老影响的多组分数据访问


生物导体版本:释放(3.19)

MouseAgingData软件包提供了来自不同研究的分析数据资源,这些研究侧重于小鼠的衰老和年轻化。该软件包目前提供两个10倍基因组学单细胞RNA-seq数据集。第一项研究描述了37089个细胞中测量的衰老小鼠大脑(Ximerakis等人,2019年)。第二项研究通过分析总共105329个细胞来研究联体共生(Ximerakis&Holton等人,2023年)。数据集作为SingleCellExperiment对象提供,并提供原始UMI计数和单元元数据。

作者:有轨电车阮[aut,cre]、克里斯·霍尔顿[aut]、泰龙·李[aut]:Nitesh Turaga[ctb]、路德维希·盖斯林格[aut'、罗伯特·绅士

维护人员:Tram Nguyen<哈佛大学的Tram Guyen>

引文(从R中输入引文(“MouseAgingData”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“4.4”)并输入:

如果(!require(“BiocManager”,悄悄地=TRUE))install.packages(“BiocManager”)BiocManager::install(“MouseAgingData”)

对于R的旧版本,请参阅相应的生物导体释放.

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档,请启动R并输入:

浏览幻影(“MouseAgingData”)
访问并可视化共生液滴数据 HTML格式 R脚本
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新闻 文本

细节

生物视图 实验数据,实验中心,表达式数据,Mus_肌肉_数据,包类型数据,RNASeq数据,排序数据,单细胞数据
版本 1.0.0
许可证 艺术-2.0
取决于 R(>=4.4.0),单细胞实验
进口 批注中心,实验中心
系统要求
统一资源定位地址 https://github.com/ccb-hms/MouseAgingData网站
错误报告 https://github.com/ccb-hms/MouseAgingData/issues
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程序包档案

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包 鼠标老化数据_1.0.0.tar.gz
Windows二进制
macOS二进制(x86_64)
macOS二进制(arm64)
源码库信息 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/MouseAgingData网站
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:软件包/MouseAgingData
包短Url https://bioductor.org/packages/MouseAgingData/
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