Johnson激酶数据

基于Johnson等人2023年发布的数据的激酶PWM(doi:10.1038/s41586-022-05575-3)


生物导体版本:释放(3.19)

这些软件包为最初发表于Johnson等人2023年的303种人类丝氨酸/苏氨酸激酶提供了位置特异性权重矩阵(PWM)。它包括每个激酶PWM的基因注释和一组85603个精心策划的人类磷酸化位点的PWM匹配分数,可用于将PWM分数映射到其百分位等级。该软件包还包括对用户提供的磷脂酶进行评分的基本功能。

作者:弗洛里安·盖尔

维护人员:Florian Geier<unibas.ch的Florian.Geier>

引文(从R中输入引文(“JohnsonKinaseData”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“4.4”)并输入:

如果(!require(“BiocManager”,悄悄地=TRUE))install.packages(“BiocManager”)BiocManager::install(“JohnsonKinaseData”)

对于R的旧版本,请参阅相应的生物导体释放.

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档,请启动R并输入:

浏览幻影(“JohnsonKinaseData”)
Johnson激酶数据 HTML格式 R脚本
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新闻 文本
许可证 文本

细节

生物视图 实验数据,实验中心,人乳头数据,蛋白质组
版本 1.0.0
许可证 MIT+文件许可证
取决于
进口 实验中心,BiocParallel公司,将死,数字播放器,统计,字符串,第三年,呜呜声,实用程序
系统要求
统一资源定位地址 https://github.com/fgeier/JohnsonKinaseData网站/
错误报告 https://support.bioconductor.org/t/JohnsonKinaseData网站
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程序包档案

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包 强生KinaseData_1.0.0.tar.gz
Windows二进制
macOS二进制(x86_64)
macOS二进制(arm64)
源码库信息 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/JohnsonKinaseData网站
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:软件包/JohnsonKinaseData
包短Url https://bioconductor.org/packages/JohnsonKinaseData网站/
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