AHPathbank数据库

与PathBank通路相关的代谢产物和蛋白质（用于AnnotationHub）

生物导体版本：释放（3.19）

该软件包提供了与PathBank途径相关的代谢产物和蛋白质的综合映射表。这些表格包括HMDB、KEGG、ChEBI、CAS、Drugbank和Uniprot ID。表中列出了10种物种中的每一种（“智人”、“大肠杆菌”、“小家鼠”、“拟南芥”、“酿酒酵母”、“牛牛”、“秀丽隐杆线虫”、“褐家鼠”，“黑腹果蝇”和“铜绿假单胞菌”）。这些表格信息可用于代谢物集（和其他）富集分析。

作者：西田科佐[aut，cre]

维护人员：西田科佐（Kozo Nishida）<Kozo.Nishida at gmail.com>

引文（从R中输入引文（“AHPathbankDbs”）):

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“4.4”）并输入：

如果（！require（“BiocManager”，悄悄地=TRUE））install.packages（“BiocManager”）BiocManager:：安装（“AHPathbankDbs”）

对于R的旧版本，请参阅相应的生物导体释放.

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档，请启动R并输入：

浏览渐晕图（“AHPathbankDbs”）

为AnnotationHub提供PathbankDb数据库	HTML格式	R脚本
参考手册	PDF格式
新闻	文本

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细节

生物视图	批注数据,批注中心,自定义DBSchema,功能注释
版本	0.99.5
许可证	艺术-2.0
取决于	R（>=4.1.0）
进口	批注中心(>= 2.23.0)
系统要求
统一资源定位地址	https://github.com/kozo2/AHPathbankDbs

建议	仿生风格,马格里特,数字播放器,易怒的,针织物,rmarkdown公司
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程序包档案

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包	AHPathbank数据库Dbs_0.99.5.tar.gz
Windows二进制
macOS二进制（x86_64）
macOS二进制（arm64）
包短Url	https://bioconductor.org/packages/AHPathbankDbs/
软件包下载报告	下载统计信息