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AHLR底座

AnnotationHub的LRBaseDbs


生物导体版本:释放(3.19)

为AnnotationHub提供许多物种的`LRbaseDb`配体受体注释数据库。所有SQLite文件都是由我们的Snakemake工作流[lrbase-workflow]生成的(https://github.com/rikenbit/lrbase-workflow). 有关详细信息,请参阅lrbase-workflow的README.md。

作者:Koki Tsuyuzaki[aut,cre],Manabu Ishii[aut],Itoshi Nikaido[aut'

维护人员:Koki Tsuyuzza<k.t.the-answer在hotmail.co.jp>

引文(从R中输入引文(“AHLRBaseDbs”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“4.4”)并输入:

如果(!require(“BiocManager”,悄悄地=TRUE))install.packages(“BiocManager”)BiocManager::安装(“AHLRBaseDbs”)

对于旧版本的R,请参阅相应的生物导体释放.

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档,请启动R并输入:

浏览渐晕图(“AHLRBaseDbs”)
为AnnotationHub提供LRBaseDb数据库 HTML格式 R脚本
参考手册 PDF格式
新闻 文本

细节

生物视图 注释数据,批注中心,功能注释,LR基准Db
版本 1.8.0
许可证 艺术-2.0
取决于 R(>=4.1.0)
进口 批注中心(>=2.22.0)
系统要求
统一资源定位地址
错误报告 https://github.com/rikenbit/AHLRBaseDbs/issues
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程序包档案

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包 AHLR基础数据库_1.8.0.tar.gz
Windows二进制
macOS二进制(x86_64)
macOS二进制(arm64)
包短Url https://bioconductor.org/packages/AHLRBaseDbs/
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