双重pcr

对二维液滴数字PCR（ddPCR）数据进行分类，并量化起始分子的数量

生物导体版本：释放（3.19）

twoddpcr软件包采用Bio-Read QuantaSoft公司的滴滴数字PCR（ddPCR）滴滴振幅数据，并可以对滴滴进行分类。可以生成正/负液滴计数的汇总，然后使用泊松分布估计分子数量。这是第一个有助于自动分类通用双通道ddPCR数据的开源软件包。之前的工作包括“definetherain”（Jones等人，2014）和“ddpcRquant”（Trypsteen等人，2015），这两个词都只处理单通道ddPCR实验。CRAN上提供的“ddpcr”软件包（Attali等人，2016）仅支持特定类别的双通道ddpcr实验的自动选通。

作者：Anthony Chiu【aut，cre】

维护人员：安东尼·邱（Anthony Chiu）

引文（从R中输入引文（“twoddpcr”）):

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“4.4”）并输入：

如果（！require（“BiocManager”，悄悄地=TRUE））install.packages（“BiocManager”）BiocManager:：安装（“twoddpcr”）

对于R的旧版本，请参阅相应的生物导体释放.

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档，请启动R并输入：

浏览幻影（“twoddpcr”）

twoddpcr：滴滴数字PCR分析软件包	HTML格式	R脚本
参考手册	PDF格式
新闻	文本

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细节

生物视图	分类,软件,ddPCR
版本	1.28.0
在生物导体中	生物碳3.5（R-3.4）（7.5年）
许可证	GPL-3公司
取决于	R（>=3.4）
进口	班,ggplot2,己糖、方法、，规模,闪亮的，统计，实用程序，R彩色啤酒,S4载体
系统要求
统一资源定位地址	http://github.com/CRUKMI-ComputationalBiology/twoddpcr/
错误报告	http://github.com/CRUKMI-ComputationalBiology/twoddpcr/issues/

建议	开发工具,针织物,重塑2,rmarkdown公司,测试那个,仿生风格
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程序包档案

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包	两个ddpcr_1.28.0.tar.gz
Windows二进制	两天pcr_1.28.0.zip
macOS二进制（x86_64）	两个ddpcr_1.28.0.tgz
macOS二进制（arm64）	两个ddpcr_1.28.0.tgz
源码库信息	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/twoddpcr
源存储库（开发人员访问）	git克隆git@git.bioconductor.org：packages/twoddpcr
Bioc软件包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/twoddpcr/
包短Url	https://bioconductor.org/packages/twoddpcr/
软件包下载报告	下载统计信息